Data from the electronic medical re

Data from the electronic medical record comprise numerous structured but uncoded elements,
which are not linked to standard terminologies. Reuse of such data for secondary research
purposes has gained in importance recently. However, the identification of rele-vant
data elements and the creation of database jobs for extraction, transformation and loading
(ETL) are challenging: With current methods such as data warehousing, it is not feasible to
efficiently maintain and reuse semantically complex data extraction and trans-formation routines.
We present an ontology-supported approach to overcome this challenge by making
use of abstraction: Instead of defining ETL procedures at the database level, we use ontologies
to organize and describe the medical concepts of both the source system and the target
system. Instead of using unique, specifically developed SQL statements or ETL jobs,
we define declarative transformation rules within ontologies and illustrate how these constructs
can then be used to automatically generate SQL code to perform the desired ETL
procedures. This demonstrates how a suitable level of abstraction may not only aid the interpretation
of clinical data, but can also foster the reutilization of methods for un-locking it.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ข้อมูลจากเวชระเบียนอิเล็กทรอนิกส์ประกอบด้วยหลายโครงสร้าง แต่ uncoded องค์ประกอบซึ่งไม่ได้เชื่อมโยงไปกับมาตรฐาน ของข้อมูลดังกล่าวสำหรับวิจัยรองการได้รับความสำคัญในเร็ว ๆ นี้ อย่างไรก็ตาม รหัส rele-vantองค์ประกอบของข้อมูลและการสร้างฐานข้อมูลงานสกัด การแปลง และโหลด(ETL) ท้าทาย: วิธีปัจจุบันเช่นข้อมูลคลังสินค้า ไม่เหมาะสมในการมีประสิทธิภาพรักษา และนำมาใช้สกัดข้อมูลประโยคซับซ้อนและสร้างธุรกรรมตามปกติเรานำเสนอวิธีการสนับสนุนภววิทยาเพื่อเอาชนะความท้าทายนี้ ด้วยการใช้ของนามธรรม: แทนที่การกำหนดกระบวนการ ETL ที่ระดับฐานข้อมูล เราใช้ ontologiesการจัดระเบียบ และอธิบายแนวคิดทางการแพทย์ของระบบต้นทางและปลายทางระบบ แทนการใช้คำสั่ง SQL ที่ไม่ซ้ำกัน ได้รับการพัฒนาโดยเฉพาะหรืองาน ETLเรากำหนดกฎการแปลงประกาศได้ภายใน ontologies และแสดงโครงสร้างเหล่านี้แล้วใช้โค้ด SQL การ ETL สร้างโดยอัตโนมัติวิธีการ นี้แสดงว่านามธรรมในระดับเหมาะสมอาจเพียงช่วยตีข้อมูลทางคลินิก แต่ยังสามารถส่งเสริม reutilization ของวิธีการสำหรับล็อคไม่ได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ข้อมูลจากเวชระเบียนอิเล็กทรอนิกส์ประกอบด้วยโครงสร้าง แต่ไม่มีรหัสองค์ประกอบมากมาย
ที่ไม่ได้เชื่อมโยงกับคำศัพท์มาตรฐาน นำมาใช้ใหม่ของข้อมูลดังกล่าวสำหรับการวิจัยรอง
วัตถุประสงค์ได้รับในความสำคัญเมื่อเร็ว ๆ นี้ อย่างไรก็ตามประชาชนของ rele-Vant
องค์ประกอบของข้อมูลและการสร้างงานฐานข้อมูลสำหรับการสกัดการเปลี่ยนแปลงและการโหลด
(ETL) มีความท้าทาย: ด้วยวิธีการในปัจจุบันเช่นคลังข้อมูลก็ไม่ได้เป็นไปได้ที่จะ
มีประสิทธิภาพในการรักษาและนำมาใช้ในการสกัดข้อมูลที่ซับซ้อนความหมายและ . การปฏิบัติ Trans-ก่อตัว
เรานำเสนอวิธีการที่เกี่ยวกับธรรมชาติได้รับการสนับสนุนที่จะเอาชนะความท้าทายนี้โดยการ
ใช้งานของนามธรรม: แทนที่จะกำหนดขั้นตอน ETL ในระดับฐานข้อมูลที่เราใช้จีส์
ในการจัดระเบียบและอธิบายแนวคิดทางการแพทย์ของทั้งสองระบบแหล่งที่มาและเป้าหมาย
ระบบ. แทนการใช้ที่ไม่ซ้ำกันคำสั่ง SQL การพัฒนาโดยเฉพาะหรืองาน ETL,
เรากำหนดกฎการเปลี่ยนแปลงภายในเปิดเผยจีส์และแสดงให้เห็นว่าโครงสร้างเหล่านี้
จากนั้นจะสามารถนำมาใช้เพื่อสร้างรหัส SQL โดยอัตโนมัติเพื่อดำเนินการ ETL ที่ต้องการ
ขั้นตอน นี้แสดงให้เห็นว่าระดับที่เหมาะสมของนามธรรมอาจไม่เพียง แต่ช่วยแปลความหมาย
ของข้อมูลทางคลินิก แต่ยังสามารถส่งเสริมให้เกิดการ reutilization ของวิธีการในการยกเลิกการล็อคมัน