The diagnosis of late onset sepsis

The diagnosis of late onset sepsis (LOS), a severe condition with high prevalence in preterm infants, is hampered by the suboptimal sensitivity and long turnaround time of blood culture. Detection of the infecting pathogen directly in blood by PCR would provide a much more timely result. Unfortunately, PCR-based assays reported so far are labor intensive and often lack direct species identification. Therefore we developed a real-time multiplex PCR assay tailored to LOS diagnosis which is easy-to-use, is applicable on small blood volumes and provides species-specific results within 4 h. Species-specific PCR assays were selected from literature or developed using bioinformatic tools for the detection of the most prevalent etiologic pathogens: Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus, Staphylococcus spp., Streptococcus agalactiae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella spp. and Serratia marcescens. The PCR assays showed 100% specificity, full coverage of the target pathogens and a limit of detection (LOD) of ≤ 10 CFU eq./reaction. These LOD values were maintained in the multiplex format or when bacterial DNA was isolated from blood. Clinical evaluation showed high concordance between the multiplex PCR and blood culture. In conclusion, we developed a multiplex PCR that allows the direct detection of the most important bacterial pathogens causing LOS in preterm infants.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวินิจฉัยล่าช้าเริ่มมีอาการ sepsis (LOS), เงื่อนไขการรุนแรงกับชุกสูงในทารก preterm ถูกขัดขวาง โดยสภาพไวและระยะยาวเวลาเลือดวัฒนธรรม ตรวจสอบศึกษา infecting ในเลือดโดย PCR จะให้ผลรวดเร็วมาก อับ assays ผลรายงานจนมีแรงงานเข้มข้น และมักจะขาดการระบุสายพันธุ์โดยตรง ดังนั้น การที่เราพัฒนาแบบเรียลไทม์ multiplex PCR ทดสอบเพื่อการวินิจฉัย LOS ซึ่งจะง่ายต่อการใช้ ใช้บนไดรฟ์ข้อมูลเลือดขนาดเล็ก และแสดงผล species-specific ภายใน 4 h. Species-specific PCR assays เลือกจากวรรณกรรม หรือพัฒนาโดยใช้เครื่องมือผลเชิงวิวัฒนาการตรวจโรค etiologic แพร่หลายมากที่สุด: Enterococcus faecalis, Staphylococcus หมอเทศข้างลาย โอ Staphylococcus อุณหภูมิ agalactiae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosaโอ Klebsiella และ Serratia marcescens PCR assays specificity 100% แสดง ความครอบคลุมทั้งหมดของโรคเป้าหมายและขีดจำกัดของการตรวจ (ลอด) ≤ 10 CFU eq./ปฏิกิริยา ลอดค่าเหล่านี้ถูกเก็บรักษา ในรูปแบบ multiplex หรือดีเอ็นเอจากแบคทีเรียที่แยกได้จากเลือด การประเมินทางคลินิกที่พบสอดคล้องสูงระหว่าง multiplex PCR และเลือดวัฒนธรรม เบียดเบียน เราพัฒนา PCR multiplex ที่ช่วยให้การตรวจพบโรคแบคทีเรียสำคัญที่ก่อให้เกิด LOS ในทารก preterm โดยตรง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวินิจฉัยการติดเชื้อเริ่มมีอาการปลาย (LOS) ซึ่งเป็นเงื่อนไขที่รุนแรงที่มีความชุกสูงในทารกคลอดก่อนกำหนด, เป็นอุปสรรคโดยไว suboptimal และเวลาตอบสนองที่ยาวนานของวัฒนธรรมเลือด การตรวจหาเชื้อโรคที่ติดเชื้อโดยตรงในเลือดโดยวิธี PCR จะให้ผลในเวลาที่เหมาะสมมากขึ้น แต่น่าเสียดายที่การตรวจ PCR-ตามรายงานจนถึงขณะนี้มีแรงงานเข้มข้นและมักจะขาดการระบุสายพันธุ์โดยตรง ดังนั้นเราจึงพัฒนาแบบ real-time PCR ทดสอบหลายที่เหมาะกับการวินิจฉัย LOS ซึ่งเป็นเรื่องง่ายต่อการใช้งาน, มีผลบังคับใช้เมื่อวันที่ปริมาตรของเลือดที่มีขนาดเล็กและมีสายพันธุ์เฉพาะผลภายใน 4 ชั่วโมง สายพันธุ์เฉพาะการตรวจ PCR ได้รับการคัดเลือกจากวรรณกรรมหรือการพัฒนาโดยใช้เครื่องมือทางชีววิทยาสำหรับการตรวจหาเชื้อโรคสาเหตุที่แพร่หลายมากที่สุด: Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus, Staphylococcus spp, Streptococcus agalactiae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella spp. และ Serratia marcescens การตรวจ PCR แสดงให้เห็นว่า% ความจำเพาะ 100, คุ้มครองเต็มรูปแบบของเชื้อโรคเป้าหมายและขีด จำกัด ของการตรวจสอบ (หลอด) ของ≤ 10 CFU EQ. / ปฏิกิริยา เหล่านี้ค่า LOD ถูกเก็บรักษาในรูปแบบทวีคูณหรือเมื่อดีเอ็นเอของเชื้อแบคทีเรียที่แยกได้จากเลือด ประเมินผลทางคลินิกแสดงให้เห็นความสอดคล้องสูงระหว่างหลายวิธี PCR และวัฒนธรรมเลือด โดยสรุปเราพัฒนาหลายวิธี PCR ที่ช่วยให้การตรวจสอบโดยตรงของแบคทีเรียที่สำคัญที่สุดที่ก่อให้เกิด LOS ในทารกคลอดก่อนกำหนด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวินิจฉัยของ onset sepsis สาย ( ลอ ) , สภาพที่รุนแรงที่มีความชุกในทารกคลอดก่อนกำหนด เป็น hampered โดยไว suboptimal และเวลาตอบสนองนานวัฒนธรรมของเลือด การตรวจหาเชื้อในเลือดของการติดเชื้อโดยตรง ซึ่งจะมีผลมากทันเวลามากขึ้น ขออภัยตามรายงานตรวจพบเพื่อให้ห่างไกลเป็นแรงงานเข้มข้น และมักจะขาดชนิดตรงรหัส ดังนั้นเราจึงพัฒนา multiplex PCR แบบเรียลไทม์ ( เหมาะกับ Los วินิจฉัยซึ่งง่ายต่อการใช้งาน สามารถใช้ได้บนไดรฟ์เลือดขนาดเล็กและแสดงผลเฉพาะ - ขยายพันธุ์ภายใน 4 ชั่วโมงชนิด โดยเฉพาะสามารถถูกเลือกจากวรรณคดีหรือพัฒนาโดยใช้เครื่องมือไบโอ นฟ ์เมติกเพื่อตรวจหาเชื้อโรคที่แพร่หลายมากที่สุด etiologic : เอ็นเทโรค็อกคัส faecalis Staphylococcus aureus Staphylococcus , Streptococcus spp . , แลคเตีย , Escherichia coli , Pseudomonas aeruginosa และ Klebsiella spp . , เซอร์ราเทีย marcescens . pcr ตรวจพบร้อยละ 100 ความจำเพาะความคุ้มครองเต็มรูปแบบของชิ้นงาน และขีดจำกัดของการตรวจหาเชื้อโรค ( LOD ) ของ≤ 10 ปฏิกิริยาอีคิว / cfu . ค่า LOD เหล่านี้ถูกเก็บรักษาไว้ในรูปแบบมัลติเพล็กซ์ หรือเมื่อแบคทีเรียดีเอ็นเอที่แยกได้จากเลือด การประเมินผลทางคลินิกพบความสอดคล้องกันสูงระหว่างเทคนิค multoplex PCR และการเพาะเชื้อจากเลือด . สรุปเราพัฒนา multiplex PCR ที่ช่วยให้การตรวจหาแบคทีเรียก่อโรคโดยตรง ที่สำคัญที่สุด ทำให้ ลอส ในทารกคลอดก่อนกำหนด