Recent data have linked hypoxia, a

Recent data have linked hypoxia, a classic feature of the tumor microenvironment, to the function of specific microRNAs (miRNAs); however, whether hypoxia affects other types of noncoding transcripts is currently unknown. Starting from a genome-wide expression profiling, we demonstrate for the first time a functional link between oxygen deprivation and the modulation of long noncoding transcripts from ultraconserved regions, termed transcribed-ultraconserved regions (T-UCRs). Interestingly, several hypoxia-upregulated T-UCRs, henceforth named 'hypoxia-induced noncoding ultraconserved transcripts' (HINCUTs), are also overexpressed in clinical samples from colon cancer patients. (C) We show that these T-UCRs are predominantly nuclear and that the hypoxia-inducible factor (HIF) is at least partly responsible for the induction of several members of this group. One specific HINCUT, uc.475 (or HINCUT-1) is part of a retained intron of the host protein-coding gene, O-linked N-acetylglucosamine transferase, which is overexpressed in epithelial cancer types. Consistent with the hypothesis that T-UCRs have important function in tumor formation, HINCUT-1 supports cell proliferation specifically under hypoxic conditions and may be critical for optimal O-GlcNAcylation of proteins when oxygen tension is limiting. Our data gives a first glimpse of a novel functional hypoxic network comprising protein-coding transcripts and noncoding RNAs (ncRNAs) from the T-UCRs category. © 2013 Macmillan Publishers Limited All rights reserved.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ข้อมูลล่าสุดมีการเชื่อมโยงการขาดออกซิเจนที่มีคุณสมบัติคลาสสิกของเนื้องอก microenvironment, ฟังก์ชั่นของ microRNAs เฉพาะ (miRNAs) แต่ไม่ว่าจะมีผลกระทบต่อการขาดออกซิเจนชนิดอื่น ๆ ของบันทึก noncoding ไม่เป็นที่รู้จักในปัจจุบัน เริ่มจากโปรไฟล์การแสดงออกของจีโนมกว้างเราแสดงให้เห็นเป็นครั้งแรกที่การเชื่อมโยงการทำงานระหว่างการกีดกันออกซิเจนและการปรับของยีน noncoding ยาวจากภูมิภาค ultraconserved เรียกว่าคัดลอก-ultraconserved ภูมิภาค (t-UCRs) ที่น่าสนใจหลายขาดออกซิเจน-upregulated เสื้อ UCRs ชื่อต่อจากนี้ไป 'บันทึกการขาดออกซิเจนเกิด noncoding ultraconserved (hi​​ncuts)overexpressed จะยังอยู่ในตัวอย่างทางคลินิกจากผู้ป่วยมะเร็งลำไส้ใหญ่ (c) เราแสดงให้เห็นว่าเหล่านี้เสื้อ UCRs ที่เด่นนิวเคลียร์และปัจจัยที่กระตุ้นการขาดออกซิเจน-(hif) เป็นอย่างน้อยบางส่วนรับผิดชอบในการเหนี่ยวนำของสมาชิกหลายคนของกลุ่มนี้ hincut หนึ่งที่เฉพาะเจาะจง uc.475 (หรือ hincut-1) เป็นส่วนหนึ่งของ intron สะสมของยีนโปรตีนเข้ารหัสโฮสต์o-transferase เชื่อมโยง n-acetylglucosamine ซึ่งเป็น overexpressed ในประเภทโรคมะเร็งเยื่อบุผิว สอดคล้องกับสมมติฐานที่ว่าเสื้อ UCRs มีฟังก์ชั่นสำคัญในการสร้างเนื้องอก hincut-1 สนับสนุนการเพิ่มจำนวนเซลล์โดยเฉพาะภายใต้เงื่อนไข hypoxic และอาจจะมีความสำคัญสำหรับการที่ดีที่สุด o-glcnacylation ของโปรตีนเมื่อความตึงเครียดออกซิเจน จำกัดข้อมูลของเราให้เหลือบแรกของการทำงานเครือข่ายนวนิยาย hypoxic ประกอบไปด้วยโปรตีนบันทึกการเข้ารหัสและ noncoding RNAs (ncRNAs) จากหมวดหมู่เสื้อ UCRs © 2013 สำนักพิมพ์มักมิลลัน จำกัด สงวนลิขสิทธิ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ข้อมูลล่าสุดลิงค์ hypoxia ลักษณะคลาสสิกของ microenvironment เนื้องอก กับการทำงานของการ microRNAs (miRNAs); อย่างไรก็ตาม ว่า hypoxia มีผลต่อใบแสดงผล noncoding ชนิดอื่น ๆ ได้รู้จักในขณะนี้ เริ่มต้นจากนิพจน์ทั้งจีโนมการสร้างโพรไฟล์ เราแสดงเป็นครั้งแรกทำงานเชื่อมโยงระหว่างภาวะขาดออกซิเจนและเอ็มของใบแสดงผลนาน noncoding จาก ultraconserved ภูมิภาค ภูมิภาค ultraconserved ทับศัพท์ (T UCRs) เรียกว่าการ เป็นเรื่องน่าสนใจ หลาย hypoxia upregulated T-UCRs แท้ ๆ ชื่อ 'ใบแสดงผลเกิด hypoxia noncoding ultraconserved' (HINCUTs), มี overexpressed ในตัวอย่างทางคลินิกจากผู้ป่วยโรคมะเร็งลำไส้ใหญ่ (ค) เราแสดง T-UCRs นี้เป็นนิวเคลียร์ และปัจจัย hypoxia inducible (HIF) มีน้อยรับผิดชอบบางส่วนการเหนี่ยวนำของสมาชิกของกลุ่มนี้ หนึ่งเฉพาะ HINCUT, uc.475 (HINCUT-1) คือ ส่วนของ intron สะสมของยีนการโปรตีนรหัสโฮสต์ ลิงค์ O N acetylglucosamine transferase ที่ overexpressed ใน epithelial มะเร็งชนิดนั้น สอดคล้องกับสมมติฐานที่ว่า T-UCRs มีฟังก์ชันที่สำคัญในการก่อตัวของเนื้องอก HINCUT-1 สนับสนุนการงอกของเซลล์โดยเฉพาะภายใต้เงื่อนไขแปร และอาจสำคัญสำหรับ O GlcNAcylation ดีที่สุดของโปรตีนเมื่อจำกัดออกซิเจนความตึงเครียด ข้อมูลของเราให้เหลือบแรกของนวนิยายหน้าที่แปรเครือใบแสดงผลรหัสโปรตีนและ RNAs noncoding (ncRNAs) จากประเภท T-UCRs © 2013 Macmillan ผู้เผยแพร่ จำกัดสงวนลิขสิทธิ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เมื่อไม่นานมานี้มีข้อมูลเชื่อมโยง hypoxia โดดเด่นไปด้วยคลาสสิคของ microenvironment เนื้องอกที่ให้กับฟังก์ชันของ micrornas เฉพาะ( mirnas )แต่ถึงอย่างไรก็ตามไม่ว่าจะมีผลต่อ hypoxia ประเภท อื่นๆของทรานสคริปท์ noncoding เป็นที่รู้จักในปัจจุบัน โดยเริ่มจากยีนโปรไฟล์ - แสดงออกที่หลากหลายเราแสดงให้เห็นเป็นครั้งแรกที่ลิงค์เต็มไปด้วยประโยชน์ใช้สอยระหว่างขาดออกซิเจนและสัญญาณคลื่นวิทยุของทรานสคริปท์ noncoding ยาวจากเขตพื้นที่ ultraconserved เรียกว่าเขตพื้นที่ที่ถอดสคริปต์แล้ว - ultraconserved ( T - ucrs ) เป็นสิ่งที่น่าสนใจหลาย hypoxia - upregulated T - ucrs นับจากนี้ไปมีชื่อว่า" noncoding hypoxia - ก่อขึ้น ultraconserved 'บันทึกการสนทนา( hincuts )มี overexpressed ในตัวอย่างทางการแพทย์จากผู้ป่วยมะเร็งลำไส้ใหญ่ด้วย ( c )เราจะแสดงให้เห็นว่า T - ucrs เหล่านี้โดดเด่นไปด้วยมีอาวุธนิวเคลียร์และว่าปัจจัยด้าน hypoxia - inducible ( hif )เป็นเวลาอย่างน้อยบางส่วนต้องรับผิดชอบสำหรับเตาแม่เหล็กไฟฟ้าของสมาชิกของกลุ่มหลายแห่งนี้ หนึ่ง hincut เฉพาะ uc. 475 (หรือ hincut - 1 )เป็นส่วนหนึ่งของ intron ถูกเก็บไว้ที่โฮสต์ของยีนโปรตีน - การเข้ารหัสได้transferase N - acetylglucosamine o - เชื่อมโยงซึ่งเป็น overexpressed ใน ประเภท โรคมะเร็ง epithelial . สอดคล้องกับสมมุติฐานที่ว่า T - ucrs มีบทบาทที่สำคัญยิ่งในการจัดตั้งเป็นโรคเนื้องอก hincut 1 รองรับการขยายตัวโดยเฉพาะเซลล์หัวใจอยู่ ภายใต้ เงื่อนไขและอาจมีความสำคัญอย่างมากสำหรับดีที่สุด o - glcnacylation ของโปรตีนเมื่อความตึงเครียดมีการจำกัดข้อมูลของเราจะช่วยให้เห็นเป็นครั้งแรกที่เต็มไปด้วยประโยชน์ใช้สอยของเครือข่ายหัวใจใหม่ที่ประกอบด้วยโปรตีน - การเข้ารหัสและการตอบ noncoding rnas ( ncrnas )จาก ประเภท T - ucrs ได้ ©ปี 2013 macmillan ผู้พิมพ์ผู้โฆษณาจำกัดสิทธิ์ตามกฎหมาย