DNA Extraction. Genomic DNA of HeLa

DNA Extraction.
Genomic DNA of HeLa cells was extracted using DNAiso Reagent (Takara Biotechnology Co.,Ltd., Dalian, China) according to the protocol recommended by the manufacture.
Yeast genomic DNA was extracted using a previously described method.29 The isolated DNA was divided
into four equal aliquots named Group Control, Group TiO2, Group Enzyme, and Group Enzymex2 (Scheme 1).
Group Control represents that the isolated genomic DNA was directly enzymatically hydrolysis and analyzed by LC-MS/MS.
Group TiO2 represents that the isolated genomic DNA was treated by TiO2-based SPE after being hydrolyzed and then was analyzed by LC-MS/MS.
Group Enzyme represents that the isolated genomic DNA was treated by the traditional enzymatic
digestion method to remove RNA contamination and then was hydrolyzed and analyzed by LC-MS/MS.
Group Enzymex2 represents that the isolated genomic DNA was treated by the traditional enzymatic digestion method twice and then hydrolyzed and analyzed by LC-MS/MS.
The detailed procedures for the treatments can be found in the following Sections.
The residual ribonucleosides and recoveries of 2′-deoxynucleosides were calculated by dividing the signal intensities of Group TiO2, Group Enzyme, or Group Enzymex2 by the corresponding signal intensity of Group Control.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การสกัดดีเอ็นเอ
Genomic DNA ของ HeLa เซลล์ถูกสกัดโดยใช้ DNAiso รีเอเจนต์ (Takara เทคโนโลยีชีวภาพ Co., Ltd. ต้าเหลียน จีน) ตามโพรโทคอลแนะนำการผลิต
Genomic DNA ถูกสกัดโดยใช้ method.29 ที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ดีเอ็นเอแยกยีสต์ที่แบ่ง
เป็นสี่เท่า aliquots ชื่อกลุ่มควบคุม TiO2 กลุ่ม กลุ่มเอนไซม์ และกลุ่ม Enzymex2 (แผน 1) .
กลุ่มควบคุมแสดงว่า DNA genomic แยกตรง enzymatically ไฮโตรไลซ์ และวิเคราะห์ โดย LC-MS/นางสาว
TiO2 กลุ่มแสดงว่า DNA genomic แยกรักษา โดยใช้ TiO2 SPE หลังการ hydrolyzed แล้ว ถูกวิเคราะห์ โดย LC-MS/นางสาว
แทนกลุ่มเอนไซม์ DNA genomic แยกถูกได้รับการรักษา โดยดั้งเดิมที่เอนไซม์ในระบบ
วิธีการย่อยอาหารจะเอาอาร์เอ็นเอปนเปื้อนแล้วถูก hydrolyzed และวิเคราะห์ โดย LC-MS/นางสาว
Enzymex2 กลุ่มแสดงว่า DNA genomic แยกได้รับการรักษา โดยวิธีการย่อยอาหารเอนไซม์ในระบบดั้งเดิมสองแล้ว hydrolyzed และวิเคราะห์ โดย LC-MS/นางสาว
รายละเอียดขั้นตอนการรักษาที่สามารถพบได้ในส่วนต่อไปนี้ได้
เหลือ ribonucleosides และ recoveries 2′ deoxynucleosides ถูกคำนวณ โดยการหารการปลดปล่อยก๊าซสัญญาณที่กลุ่ม TiO2 เอนไซม์กลุ่ม หรือกลุ่ม Enzymex2 ที่ ด้วยความเข้มสัญญาณที่สอดคล้องกันของกลุ่มควบคุม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สกัดดีเอ็นเอ
ดีเอ็นเอจีโนมของเซลล์ HeLa ถูกสกัดโดยใช้ DNAiso Reagent (Takara เทคโนโลยีชีวภาพ จำกัด . ต้าเหลียน, จีน) ตามโปรโตคอลที่แนะนำโดยผลิต
ยีสต์ดีเอ็นเอถูกสกัดโดยใช้อธิบายไว้ก่อนหน้า method.29 ดีเอ็นเอแยก ถูกแบ่งออก
เป็นสี่ aliquots เท่ากับชื่อกลุ่มควบคุมกลุ่ม TiO2 กลุ่มเอนไซม์และกลุ่ม Enzymex2 (โครงการ 1)
กลุ่มควบคุมแสดงว่าดีเอ็นเอแยกเป็นการย่อยสลายเอนไซม์โดยตรงและวิเคราะห์โดย LC-MS / MS
กลุ่ม TiO2 แสดงให้เห็นถึงว่า ดีเอ็นเอที่แยกได้รับการรักษาโดย TiO2-based SPE หลังจากที่ถูกไฮโดรไลซ์แล้วถูกวิเคราะห์โดย LC-MS / MS
กลุ่มเอ็นไซม์แสดงว่าดีเอ็นเอที่แยกได้รับการรักษาโดยเอนไซม์ดั้งเดิม
วิธีการย่อยอาหารเพื่อลบปนเปื้อนของอาร์เอ็นเอและจากนั้นได้รับการไฮโดรไลซ์และวิเคราะห์ โดย LC-MS / MS
กลุ่ม Enzymex2 แสดงว่าดีเอ็นเอที่แยกได้รับการรักษาโดยวิธีการย่อยของเอนไซม์แบบดั้งเดิมสองครั้งแล้วไฮโดรไลและวิเคราะห์โดย LC-MS / MS
ขั้นตอนอย่างละเอียดสำหรับการรักษาสามารถพบได้ในส่วนดังต่อไปนี้
ribonucleosides คงเหลือและการกลับคืนของ 2'-deoxynucleosides จะถูกคำนวณโดยการหารความเข้มของสัญญาณของกลุ่ม บริษัท TiO2 กลุ่มเอนไซม์หรือกลุ่ม Enzymex2 โดยความเข้มของสัญญาณที่สอดคล้องกันของกลุ่มควบคุม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การสกัดดีเอ็นเอ
ดีเอ็นเอของเซลล์ Hela ถูกสกัดโดยใช้ dnaiso Reagent ( Takara เทคโนโลยีชีวภาพ Co . , Ltd . , Dalian , จีน ) ตามขั้นตอนที่แนะนำโดยผู้ผลิต
ยีสต์สกัดดีเอ็นเอโดยใช้อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ method.29 แยกดีเอ็นเอถูกแบ่งเป็นสี่เท่าเฉยๆ
ชื่อควบคุมกลุ่ม TiO2 , เอนไซม์กลุ่ม และกลุ่ม enzymex2 ( โครงการ 1 ) .
กลุ่มควบคุม แสดงว่าแยกดีเอ็นเอได้โดยตรง การ วิเคราะห์ข้อมูล โดย enzymatically อินซูลินคุณ
) หมายถึงกลุ่มที่แยกดีเอ็นเอรักษา ) ใช้เอสพี หลังจากถูกไฮโดรไลซ์แล้ว โดยใช้เอนไซม์อินซูลินคุณ
กลุ่มตัวแทนแยกดีเอ็นเอรักษา
เอนไซม์ดั้งเดิมวิธีการลบไวรัสที่ปนเปื้อนอาหารแล้วถูกไฮโดรไลซ์ และวิเคราะห์โดยอินซูลินคุณ
enzymex2 หมายถึงกลุ่มที่แยกดีเอ็นเอรักษาแบบวิธีการย่อยอาหารเอนไซม์ย่อย 2 ครั้ง จากนั้นใช้อินซูลินคุณ
ขั้นตอนรายละเอียดการรักษาสามารถพบได้ในส่วนต่อไปนี้
การ ribonucleosides ที่เหลือและเมื่อ 2 - deoxynucleosides นั้นคำนวณโดยการหารสัญญาณความเข้มของ TiO2 , กลุ่มเอนไซม์ หรือกลุ่ม enzymex2 โดยสอดคล้องกับความเข้มของสัญญาณควบคุมกลุ่ม