Recent evidence demonstrates the po

Recent evidence demonstrates the power of RNA sequencin
g (RNA-Seq) for identifying valuable and urgently need-
ed blood biomarkers and advancing both early and accurate detection of neurological diseases, and in particular
Parkinson's disease (PD). RNA sequencing technology enab
les non-biased, high throughput, probe-independent in-
spection of expression data and high coverage and both quanti
fi
cation of global transcript levels as well as the de-
tection of expressed exons and junctions given a suf
fi
cient sequencing depth (coverage). However, the analysis of
sequencing data frequently presents a bottleneck. Tools for quanti
fi
cation of alternative splicing from sequenced li-
brarieshardlyexistatthepresenttime,andmethodsthatsupportmultiplesequencingplatformsare especiallylack-
ing. Here, we describe in details a whole RNA-Seq transcriptome dataset produced from PD patient's blood
leukocytes. The samples were taken prior to, and following deep brain stimulation (DBS) treatment while being
on stimulation and following 1 h of complete electrical stimulation cessation and from healthy control volunteers.
We describe in detail the methodology applied for analyzing the RNA-Seq data including differential expression
of long noncoding RNAs (lncRNAs). We also provide details o
f the corresponding analysis of in-depth splice isoform
data from junction and exon reads, with the use o
f the software AltAnalyze. Both the RNA-Seq raw (
http://www.
ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE42608
) and analyzed data (
https://www.synapse.org/#!Synapse:
syn2805267
) may be found valuable towards detection of novel blood biomarkers for PD.
© 2014 Published by Elsevier Inc. This is an open access article under the CC BY-NC-ND licens

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หลักฐานล่าสุดแสดงให้เห็นถึงพลังของอาร์เอ็นเอ sequencing (อาร์เอ็นเอลำดับ) สำหรับระบุค่ะและเร่งด่วนจำเป็น-biomarkers เลือด ed และความก้าวหน้าก่อน และต้องตรวจหาโรคระบบประสาท และโดยเฉพาะอย่างยิ่งโรคพาร์กินสัน (PD) อาร์เอ็นเอลำดับเทคโนโลยี enabเลสไม่ลำเอียง สูงสูง โพรบอิสระในspection ข้อมูลนิพจน์ และความครอบคลุมสูง และ quanti ทั้งสองไร้สายcation ระดับสากลเสียงบรรยายตลอดจนเดอ-tection exons แสดงและ junctions ให้เป็น sufไร้สายcient ลำดับลึก (ครอบคลุม) อย่างไรก็ตาม การวิเคราะห์ของจัดลำดับข้อมูลบ่อย ๆ แสดงคอขวด เครื่องมือสำหรับ quantiไร้สายcation ของ splicing อื่นจาก li ตามลำดับ-brarieshardlyexistatthepresenttime, andmethodsthatsupportmultiplesequencingplatformsare especiallylack-ing ที่นี่ เราอธิบายในรายละเอียดที่ชุดข้อมูล transcriptome ลำดับอาร์เอ็นเอทั้งหมดผลิตจากเลือดของผู้ป่วย PDleukocytes ตัวอย่างที่ถ่ายก่อน และ ต่อสมองลึกรักษากระตุ้น (เศรษฐกิจ) ในขณะที่กำลังกระตุ้นและต่อ 1 h กระตุ้นไฟฟ้าสมบูรณ์ยุติ และจากอาสาสมัครสุขภาพควบคุมเราอธิบายรายละเอียดวิธีใช้สำหรับวิเคราะห์ข้อมูลลำดับอาร์เอ็นเอรวมถึงส่วนนิพจน์ของยาว noncoding RNAs (lncRNAs) นอกจากนี้เรายังมีรายละเอียด of isoform ประกบเชิงลึกวิเคราะห์สอดคล้องกันข้อมูลจากการเชื่อมต่อและ exon อ่าน มีโอใช้f ซอฟต์แวร์ AltAnalyze ทั้งอาร์เอ็นเอลำดับดิบ(http://wwwncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE42608) และวิเคราะห์ข้อมูล(https://www.synapse.org/# ! ไซแนปส์:syn2805267) อาจพบมีคุณค่าต่อตรวจ biomarkers เลือดนวนิยายสำหรับ PD© ประกาศ 2014 โดย Elsevier อิงค์ เป็นบทความเปิดเข้าใต้ licens CC BY-NC-ND

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หลักฐานล่าสุดแสดงให้เห็นถึงพลังของอาร์เอ็นเอ sequencin
กรัม (RNA-Seq) สำหรับการระบุที่มีคุณค่าและต้องการคำเร่งด่วน
biomarkers เลือดเอ็ดและก้าวหน้าทั้งการตรวจหาและความถูกต้องของโรคทางระบบประสาทและโดยเฉพาะอย่างยิ่ง
โรคพาร์กินสัน (PD) ลำดับ RNA เทคโนโลยี enab
les ไม่ลำเอียง, อัตราความเร็วสูง, in-สอบสวนอิสระ
spection ข้อมูลการแสดงออกและความครอบคลุมสูงและทั้งสอง quanti
Fi
ไอออนบวกของระดับหลักฐานการศึกษาทั่วโลกรวมทั้ง de-
ของแหล่งของแสดงความ exons และแยกให้พอเพียง
ไฟ
เพียงพอ ความลึกลำดับ (คุ้มครอง) อย่างไรก็ตามการวิเคราะห์
ข้อมูลที่มีการจัดลำดับบ่อยคอขวด เครื่องมือสำหรับการ quanti
Fi
ไอออนบวกของประกบทางเลือกจาก Li- ติดใจ
brarieshardlyexistatthepresenttime, andmethodsthatsupportmultiplesequencingplatformsare especiallylack-
ไอเอ็นจี ที่นี่เราจะอธิบายในรายละเอียด RNA-Seq ชุดยีนทั้งที่ผลิตจาก PD ของผู้ป่วยเลือด
เม็ดเลือดขาว ตัวอย่างที่ถูกนำมาก่อนที่จะมีและต่อไปนี้การกระตุ้นสมองส่วนลึก (DBS) ในขณะที่การรักษา
ในการกระตุ้นและต่อไปนี้ 1 ชั่วโมงจากการกระตุ้นด้วยไฟฟ้าที่สมบูรณ์และอาสาสมัครจากการควบคุมที่มีสุขภาพดี.
เราอธิบายในรายละเอียดวิธีการที่นำมาใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูล RNA-Seq รวมทั้ง ความแตกต่างการแสดงออก
ของ RNAs noncoding ยาว (lncRNAs) นอกจากนี้เรายังให้รายละเอียด o
ฉวิเคราะห์ที่สอดคล้องกันของในเชิงลึกไอโซฟอร์มประกบ
ข้อมูลจากทางแยกและเอกซ์ซอนอ่านด้วยการใช้ o
ฉ AltAnalyze ซอฟแวร์ ทั้ง RNA-Seq ดิบ (
http: // www.
ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE42608
) และวิเคราะห์ข้อมูล (
https://www.synapse.org/#!Synapse :
syn2805267
.) อาจจะพบได้ที่มีคุณค่าต่อการตรวจสอบของ biomarkers เลือดใหม่สำหรับ PD
© 2014 เผยแพร่โดยเอลส์อิงค์นี้เป็นบทความเปิดภายใต้ CC BY-NC-ND ได้รับอนุญาต

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

หลักฐานล่าสุดแสดงให้เห็นถึงพลังของอาร์เอ็นเอ ( RNA sequencin
G seq ) เพื่อระบุคุณค่าและเร่งด่วน -
ดเลือดใหม่และก้าวหน้า ทั้งในวัยเด็กและการตรวจสอบความถูกต้องของโรคทางระบบประสาท และโดยเฉพาะ
โรคพาร์กินสัน ( PD ) RNA sequencing เทคโนโลยี enab
เลสไม่มีอคติ , throughput สูงสอบสวนอิสระ -
spection การแสดงออกของข้อมูลและความคุ้มครองสูงและทั้งการไฟฟ้า
ในบันทึกของ Fi
ระดับโลกรวมทั้ง de -
tection ของการแสดงออกที่มีมากยิ่งขึ้นได้รับซุฟ

cient Fi ลำดับความลึก ( คุ้มครอง ) อย่างไรก็ตาม การวิเคราะห์ข้อมูลการเสนอ
บ่อยคอขวด . เครื่องมือสำหรับการไฟฟ้า
fi
ไอออนบวกของทางเลือกนี้ Li - ตัดต่อจาก brarieshardlyexistatthepresenttime andmethodsthatsupportmultiplesequencingplatformsare especiallylack -

,ไอเอ็นจี ที่นี่ เราได้อธิบายในรายละเอียดทั้ง RNA seq ทราน ริปโตมวันที่ผลิตจากเลือด
PD ผู้ป่วยเม็ดเลือดขาว . จำนวนที่ถ่ายก่อนและหลังการกระตุ้นสมองส่วนลึก ( DBS ) การรักษาในขณะที่
ในการกระตุ้นและต่อไปนี้ 1 ชั่วโมงของการเลิกการกระตุ้นไฟฟ้าที่สมบูรณ์และการควบคุมจากอาสาสมัครสุขภาพดี