consequence may influence nitrogen dynamics, we also
measured different nitrogen compounds in the compost.
Using the DGGE technique, it is possible to separate
PCR amplified fragments by the base composition of the
fragments (Fischer and Lerman, 1979). This technique
has been used to study community changes and complexity
mostly in sediments and soils (Muyzer and Smalla, 1998),
by using DNA fragments isolated directly from these environments.
Originally, application of DGGE with environmental
samples was used to analyze the genetic diversity
of bacterial populations (Muyzer et al., 1993), but recently
the use of DGGE has expanded to also include the study of
fungal communities (Anderson et al., 2003; Vainio and
Hantula, 2000; van Elsas et al., 2000). Regarding compost,
DGGE has been used to monitor succession in the bacterial
community during the maturation of compost (Ishii
et al., 2000; Pedro et al., 2001). Analysis of fungal communities
in compost by DGGE, have only been used a few
times (Cahyani et al., 2004; Marshall et al., 2003), and
the compost types used in previous studies differs from
the two types used in our investigation.
Consequently, we made bacterial and fungal DGGEprofiles
of different types of compost and compared them
to the chitinase activity, and in this way we were able to
distinguish different microbial communities that corresponded
with differences in chitinase activity.
ผลที่ตามมาอาจมีผลต่อการเปลี่ยนแปลงของไนโตรเจนเรายัง
วัดสารประกอบไนโตรเจนที่แตกต่างกันในปุ๋ยหมัก.
โดยใช้เทคนิค DGGE ก็เป็นไปได้ที่จะแยก
PCR เศษขยายโดยองค์ประกอบฐานของ
เศษ (ฟิชเชอร์และ Lerman, 1979) เทคนิคนี้
ได้ถูกนำมาใช้เพื่อการศึกษาการเปลี่ยนแปลงของชุมชนและความซับซ้อน
ส่วนใหญ่อยู่ในตะกอนและดิน (Muyzer และ Smalla, 1998)
โดยใช้ชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่แยกได้โดยตรงจากสภาพแวดล้อมเหล่านี้.
เดิม, การประยุกต์ใช้ DGGE กับสิ่งแวดล้อม
ตัวอย่างถูกใช้ในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรม
ของ ประชากรแบคทีเรีย (. Muyzer et al, 1993) แต่เมื่อเร็ว ๆ นี้
การใช้ DGGE ได้ขยายไปยังรวมถึงการศึกษาของ
ชุมชนเชื้อรา (Anderson et al, 2003;. Vainio และ
Hantula 2000. รถตู้ Elsas, et al, 2000) เกี่ยวกับปุ๋ยหมัก
DGGE ได้รับการใช้เพื่อตรวจสอบการสืบทอดในแบคทีเรีย
ชุมชนในช่วงการเจริญเติบโตของปุ๋ยหมัก (อิชิ
et al, 2000;.. เปโดร, et al, 2001) การวิเคราะห์ของชุมชนเชื้อรา
ในปุ๋ยหมักโดย DGGE ได้รับการใช้เพียงไม่กี่
ครั้ง (Cahyani et al, 2004;. มาร์แชลล์ et al, 2003.) และ
ประเภทปุ๋ยหมักที่ใช้ในการศึกษาก่อนหน้านี้แตกต่างจาก
ทั้งสองประเภทที่ใช้ในการตรวจสอบของเรา
ดังนั้นเราจึงทำ DGGEprofiles แบคทีเรียและเชื้อรา
ชนิดที่แตกต่างกันของปุ๋ยหมักและเมื่อเทียบกับพวกเขา
กับกิจกรรมไคติเนสและในวิธีนี้เราก็สามารถที่จะ
แยกแยะความแตกต่างกลุ่มจุลินทรีย์ที่แตกต่างกันที่ตรง
กับความแตกต่างในกิจกรรมไคติเนส
การแปล กรุณารอสักครู่..
ผลของไนโตรเจนจะมีอิทธิพลต่อเรายังวัดต่าง ๆ ปริมาณไนโตรเจนในปุ๋ยหมักการใช้เทคนิคการทดลอง มันเป็นไปได้ที่จะ แยกชิ้นส่วนของดีเอ็นเอโดยพื้นฐานองค์ประกอบของเศษ ( ฟิชเชอร์ และ เลอร์แมน , 1979 ) เทคนิคนี้ได้ถูกใช้เพื่อศึกษาการเปลี่ยนแปลงของชุมชนและความซับซ้อนส่วนใหญ่ในดินตะกอนและดิน ( muyzer และ smalla , 1998 )โดยใช้ดีเอ็นเอที่แยกได้โดยตรงจากสภาพแวดล้อมเหล่านี้แต่เดิมการประยุกต์การทดลองกับสิ่งแวดล้อมตัวอย่างที่ใช้ในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรแบคทีเรีย ( muyzer et al . , 1993 ) แต่เมื่อเร็วๆ นี้ใช้ในการทดลองได้ขยายไปยังรวมถึงการศึกษาชุมชนรา ( Anderson et al . , 2003 ; ไวนิโอ และhantula , 2000 ; รถตู้ elsas et al . , 2000 ) เกี่ยวกับปุ๋ยหมักการทดลองได้ถูกใช้ในการตรวจสอบความสำเร็จในแบคทีเรียชุมชนในระหว่างการเจริญเติบโตของปุ๋ยหมัก ( ชีet al . , 2000 ; เปโดร et al . , 2001 ) การวิเคราะห์ชุมชนราในปุ๋ยหมักจากการทดลอง มีเพียงการใช้ไม่กี่ครั้ง ( cahyani et al . , 2004 ; มาร์แชลล์ et al . , 2003 )ปุ๋ยหมักชนิดที่ใช้ในการศึกษาก่อนหน้านี้ที่แตกต่างจากสองชนิดที่ใช้ในการสืบสวนของเราดังนั้นเราจึง dggeprofiles เชื้อแบคทีเรียและเชื้อราชนิดของปุ๋ยหมักและเปรียบเทียบพวกเขาต่อกิจกรรมของเอนไซม์ และในวิธีนี้เราสามารถแยกแยะของชุมชนที่แตกต่างกันของมีความแตกต่างกันในกิจกรรมของเอนไซม์ .
การแปล กรุณารอสักครู่..