The Polymerase chain reaction–restr

The Polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR–RFLP) is a relatively simple and inexpensive method for genotyping single nucleotide polymorphisms (SNPs). It requires minimal investment in instrumentation. Here, we describe a web application, ‘SNP Cutter,’ which designs PCR–RFLP assays on a batch of SNPs from the human genome. NCBI dbSNP rs IDs or formatted SNPs are submitted into the SNP Cutter which then uses restriction enzymes from a pre-selected list to perform enzyme selection. The program is capable of designing primers for either natural PCR–RFLP or mismatch PCR–RFLP, depending on the SNP sequence data. SNP Cutter generates the information needed to evaluate and perform genotyping experiments, including a PCR primers list, sizes of original amplicons and different allelic fragment after enzyme digestion. Some output data is tab-delimited, therefore suitable for database archiving. The SNP Cut-ter is available at

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การพอลิเมอเรสปฏิกิริยาลูกโซ่ – จำกัดส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (PCR-RFLP) เป็นวิธีที่ค่อนข้างง่าย และราคาไม่แพงสำหรับ genotyping นิวคลีโอไทด์เดี่ยว polymorphisms (SNPs) ต้องการลงทุนน้อยที่สุดในการใช้เครื่องมือ ที่นี่ เราอธิบายโปรแกรมประยุกต์เว็บ 'ตัด SNP ซึ่งออกแบบ PCR-RFLP assays บนชุดของ SNPs จากกลุ่มมนุษย์ NCBI dbSNP เอสรหัสหรือ SNPs ที่จัดรูปแบบจะถูกส่งไปตัด SNP ซึ่งใช้เอนไซม์จำกัดจากรายการที่เลือกไว้แล้ว ทำการเลือกเอนไซม์ โปรแกรมมีความสามารถในการออกแบบไพรเมอร์สำหรับ PCR-RFLP เป็นธรรมชาติหรือ PCR-RFLP ไม่ตรงตามข้อมูลลำดับ SNP ตัด SNP สร้างข้อมูลที่จำเป็นเพื่อประเมิน และทำการทดลอง genotyping รวมทั้ง PCR เป็น ไพรเมอร์รายการ ขนาดของ amplicons เดิมและส่วน allelic ต่าง ๆ หลังจากย่อยอาหารเอนไซม์ บางข้อมูลผลลัพธ์จะคั่น ด้วยแท็บ ดังนั้นจึงเหมาะสำหรับการเก็บถาวรของฐานข้อมูล SNP ตัดเธอได้ที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ส่วนปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอข้อ จำกัด หลายรูปแบบความยาว (PCR-RFLP) เป็นวิธีการที่ค่อนข้างง่ายและราคาไม่แพงสำหรับ genotyping หลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNPs) มันต้องมีการลงทุนที่น้อยที่สุดในการใช้เครื่องมือ ที่นี่เราจะอธิบายโปรแกรมเว็บ 'ตัด SNP' ซึ่งเป็นผู้ออกแบบการตรวจ PCR-RFLP ในชุดของ SNPs จากจีโนมมนุษย์ NCBI dbSNP รหัสอาร์เอสหรือ SNPs การจัดรูปแบบจะถูกส่งเข้าไปในเครื่องตัด SNP ที่แล้วใช้เอนไซม์ข้อ จำกัด จากรายการที่เลือกไว้ก่อนที่จะดำเนินการคัดเลือกเอนไซม์ โปรแกรมมีความสามารถในการออกแบบไพรเมอร์สำหรับทั้งธรรมชาติ PCR-RFLP หรือไม่ตรงกัน PCR-RFLP ขึ้นอยู่กับข้อมูลลำดับ SNP SNP ตัดสร้างข้อมูลที่จำเป็นในการประเมินและดำเนินการทดลองลักษณะทางพันธุกรรมรวมทั้ง PCR รายการไพรเมอร์ขนาด amplicons เดิมและส่วนที่แตกต่างกัน allelic หลังจากการย่อยของเอนไซม์ ข้อมูลออกเป็นบางส่วนคั่นด้วยแท็บดังนั้นจึงเหมาะสำหรับการเก็บฐานข้อมูล SNP ตัดเธอสามารถดูได้ที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอร์เรส–การ fragment length polymorphism ( RFLP ) ซึ่งเป็นค่อนข้างง่ายและราคาไม่แพงวิธีการส่งเสริมความหลากหลายซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ ( snps ) มันต้องมีการลงทุนที่น้อยที่สุดในการใช้เครื่องมือวัด ที่นี่เราจะอธิบายโปรแกรมเว็บ ' ตัด SNP ' ซึ่งออกแบบโดยวิธี RFLP ซึ่งในชุดของ snps จากจีโนมของมนุษย์ncbi dbsnp RS รหัสหรือการจัดรูปแบบ snps ส่งเข้า SNP ตัดซึ่งใช้เอนไซม์จากก่อนเลือกรายการเพื่อดําเนินการคัดเลือกเอนไซม์ โปรแกรมที่มีความสามารถในการออกแบบไพรเมอร์สำหรับ PCR ธรรมชาติ– RFLP หรือไม่ตรงกัน ( RFLP ) ขึ้นอยู่กับ SNP ลำดับข้อมูล ตัด SNP สร้างข้อมูลที่จำเป็นในการประเมินและการส่งเสริมการทดลองรวมทั้งรายการ PCR ไพรเมอร์ขนาดของต้นฉบับ และยาฆ่าแมลง amplicons แตกต่างกันส่วนหลังการย่อยอาหารเอนไซม์ ข้อมูลบางส่วน ออก เป็น คั่นด้วยแท็บ จึงเหมาะสำหรับการจัดเก็บฐานข้อมูล ส่วน SNP คัทเธอใช้ได้ที่