Two different tree-building methods

Two different tree-building methods were used to construct branching diagrams. Neighbor-joining (NJ) analysis was conducted using the software package MEGA 5 (Tamura et al. 2011). For the maximum-likelihood (ML) approach, the appropriate model of nucleotide substitution was determined using jModeltest version 3.07 (Posada 2008). The ML analysis was run on Phylogeny.fr server (Dereeper et al., 2008) with parameters fixed according to jModeltest specifications. Confidence in topologies was evaluated based on 1000 bootstrap replicates or posterior probability. The two analyses resulted in identical tree topologies. The NJ tree is presented herein.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ต้นไม้อาคารสองวิธีที่ใช้ในการสร้างไดอะแกรมโยงหัวข้อ เพื่อนบ้านเข้าร่วมวิเคราะห์ (NJ) ได้ดำเนินการโดยใช้แพคเกจซอฟต์แวร์ 5 ร็อค (Tamura et al. 2011) สำหรับแนวทางความเป็นไปได้สูงสุด (ML) รูปแบบที่เหมาะสมของแทนนิวคลีโอไทด์ถูกกำหนดใช้รุ่น jModeltest อาหาร 3.07 (อิ่ม 2008) วิเคราะห์ ML ถูกเรียกใช้บนเซิร์ฟเวอร์ Phylogeny.fr (Dereeper et al., 2008) กับพารามิเตอร์คงตามข้อมูลจำเพาะของ jModeltest มีประเมินความเชื่อมั่นในโท 1000 เหมือนกับเริ่มต้นระบบหรือความน่าเป็นหลัง ผลวิเคราะห์สองในทรีเหมือนกันโท ต้น NJ นำเสนอนี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สองวิธีการสร้างต้นไม้ที่แตกต่างกันถูกนำมาใช้ในการสร้างแผนภาพแขนง เพื่อนบ้านเข้า (NJ) การวิเคราะห์ได้ดำเนินการโดยใช้แพคเกจซอฟต์แวร์ MEGA 5 (ทามูระ et al. 2011) สำหรับโอกาสสูงสุด (ML) วิธีการรูปแบบที่เหมาะสมของการทดแทน nucleotide ถูกกำหนดใช้รุ่น jModeltest 3.07 (Posada 2008) การวิเคราะห์ ML ได้รับการทำงานบนเซิร์ฟเวอร์ Phylogeny.fr (Dereeper et al., 2008) กับพารามิเตอร์คงที่ตามข้อกำหนด jModeltest ความเชื่อมั่นในโครงสร้างได้รับการประเมินตาม 1000 ซ้ำบูตหรือน่าจะเป็นหลัง สองการวิเคราะห์ผลในโครงสร้างต้นไม้เหมือนกัน ต้นไม้นิวเจอร์ซีย์จะถูกนำเสนอในที่นี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สองวิธีการสร้างต้นไม้ที่แตกต่างกันถูกใช้เพื่อสร้างกิ่งแผนภาพ เพื่อนบ้านร่วม ( NJ ) การวิเคราะห์จำนวนแพคเกจซอฟต์แวร์ใหญ่ 5 ( ทามูระ et al . 2011 ) สำหรับโอกาสสูงสุด ( มิลลิลิตร ) วิธีการที่เหมาะสมในการพิจารณาการใช้เบสรุ่น jmodeltest 3.07 ( โป 2008 ) การวิเคราะห์ ml ก็วิ่งบน phylogeny.fr เซิร์ฟเวอร์ ( dereeper et al . ,2008 ) กับพารามิเตอร์คงที่ตาม jmodeltest ข้อกําหนด ความเชื่อมั่นในรูปแบบการประเมินตามแบบหรือความน่าจะเป็นเท่ากับ 1000 หลัง 2 การวิเคราะห์ผลในรูปแบบต้นไม้เหมือนกัน ต้นไม้ของ NJ ที่นำเสนอในที่นี้