The strict anaerobe Geobacter metal

The strict anaerobe Geobacter metallireducens was cultivated in retentostats under acetate and acetate plus benzoate limitation in the presence of Fe(III) citrate in order to investigate its physiology underclose to natural conditions. Growth rates below 0.003 h−1were achieved in the course of cultivation. Anano-liquid chromatography–tandem mass spectrometry-based proteomic approach (nano-LC–MS/MS)with subsequent label-free quantification was performed on proteins extracted from cells sampledat different time points during retentostat cultivation. Proteins detected at low (0.002 h−1) and high(0.06 h−1) growth rates were compared between corresponding growth conditions (acetate or acetateplus benzoate). Carbon limitation significantly increased the abundances of several catabolic proteinsinvolved in the degradation of substrates not present in the medium (ethanol, butyrate, fatty acids,and aromatic compounds). Growth rate-specific physiology was reflected in the changed abundances ofenergy-, chemotaxis-, oxidative stress-, and transport-related proteins. Mimicking natural conditions byextremely slow bacterial growth allowed to show how G. metallireducens optimized its physiology in orderto survive in its natural habitats, since it was prepared to consume several carbon sources simultaneouslyand to withstand various environmental stresses.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Metallireducens Geobacter anaerobe เข้มงวดถูกปลูกใน retentostats อะซิเตทและข้อจำกัดของอะซิเตทและ benzoate ในซิเตรท Fe(III) เพื่อตรวจสอบของ underclose สรีรวิทยาสภาพธรรมชาติ อัตราการเติบโตด้านล่าง 0.003 h−1were ประสบความสำเร็จในการเพาะปลูก ทำของเหลว Anano chromatography – ควบคู่ proteomic ใช้หลักมวลวิธี (นาโน-LC – MS/MS) กับมาฟรีป้ายชื่อด้านบนโปรตีนที่สกัดจากเซลล์ sampledat เวลาจุดในระหว่างการเพาะปลูก retentostat โปรตีนที่พบที่ต่ำ (0.002 h−1) และอัตราการเติบโตสูง (0.06 h−1) ได้เปรียบเทียบระหว่างเติบโตสอดคล้องเงื่อนไข (อะซิเตทหรือ acetateplus benzoate) ข้อจำกัดของคาร์บอนเพิ่มร้านของหลาย catabolic proteinsinvolved ในการเสื่อมสภาพของพื้นผิวที่ไม่มีอยู่ในตัวกลาง (เอทานอล บิวทิเรต กรดไขมัน และสารหอม) อย่างมาก สะท้อนการสรีรวิทยาเฉพาะอัตราการเติบโตในร้านเปลี่ยน ofenergy- chemotaxis- ความเครียดออกซิเดชัน- และโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการขนส่ง นั่งสภาพธรรมชาติ byextremely แบคทีเรียเติบโตช้าการแสดง metallireducens G. วิธีดีที่สุดของสรีรวิทยาในเพื่อการอยู่รอดในของธรรมชาติที่อยู่อาศัย เนื่องจากมันถูกเตรียมการใช้ simultaneouslyand แหล่งคาร์บอนหลายทนต่อความเครียดสิ่งแวดล้อมต่าง ๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

metallireducens Geobacter anaerobe เข้มงวดได้รับการปลูกฝังใน retentostats ภายใต้อะซิเตทและอะซิเตทบวกข้อ จำกัด เบนโซเอตในการปรากฏตัวของเฟ (III) citrate เพื่อตรวจสอบสรีรวิทยาของ underclose กับสภาพธรรมชาติ อัตราการเจริญเติบโตด้านล่าง 0.003 H-1were ประสบความสำเร็จในหลักสูตรของการเพาะปลูก Anano-Liquid Chromatography-ตีคู่มวลสารที่ใช้วิธีการ proteomic (Nano-LC-MS / MS) ที่มีปริมาณฉลากฟรีต่อมาได้รับการดำเนินการเกี่ยวกับโปรตีนสกัดจากเซลล์ sampledat จุดเวลาที่แตกต่างกันในช่วงการเพาะปลูก retentostat โปรตีนที่ตรวจพบต่ำ (0.002 H-1) และสูง (0.06 H-1) อัตราการเจริญเติบโตได้เปรียบเทียบระหว่างสภาวะการเจริญเติบโตที่สอดคล้องกัน (อะซิเตทหรือ acetateplus เบนโซเอต) ข้อ จำกัด คาร์บอนเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญของปริมาณ proteinsinvolved catabolic หลายในการย่อยสลายของพื้นผิวที่ไ​​ม่ได้อยู่ในปานกลาง (เอทานอล butyrate, กรดไขมันและสารอะโรมาติก) สรีรวิทยาของอัตราการเจริญเติบโตที่เฉพาะเจาะจงได้สะท้อนให้เห็นในการเปลี่ยนแปลงปริมาณ ofenergy-, chemotaxis-, ความเครียดออกซิเดชันและโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการขนส่ง การเลียนแบบสภาพธรรมชาติเจริญเติบโตของแบคทีเรียช้า byextremely ได้รับอนุญาตให้แสดงวิธีการที่ดีที่สุดกรัม metallireducens สรีรวิทยาใน orderto อยู่รอดในแหล่งที่อยู่อาศัยตามธรรมชาติของมันตั้งแต่มันถูกเตรียมที่จะใช้แหล่งคาร์บอนหลาย simultaneouslyand ที่จะทนต่อความเครียดสิ่งแวดล้อมต่างๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Geobacter）是被严格metallireducens在醋酸和醋酸在培养retentostats limitation加苯甲酸在柠檬酸存在下的Fe（III）在其physiology订单到自然条件对investigate underclose增长利率。下面0.003 h−1were取得了在课程的质量。Anano-liquid cultivation色谱串联质谱为基础的proteomic——方法nano-LC（MS / MS），是在与subsequent label-free quantification performed蛋白从细胞extracted sampledat在不同的时间点。retentostat cultivation外膜蛋白在低0.002 detected（H−1）和高（H−1）生长在0.06生长条件相比，corresponding之间是acetateplus醋酸或苯甲酸（碳limitation significantly）。的丰度的several分解increased proteinsinvolved）目前在substrates不在院中acids（乙醇，butyrate芳香化合物、脂肪，和rate-specific）。生长在physiology是reflected丰度的改变ofenergy，趋化作用，氧化应激，和自然条件byextremely Mimicking transport-related蛋白量。细菌的生长allowed给metallireducens如何优化其physiology G .在其自然生存，在orderto habitats它是一个自prepared来源的碳消耗的各种several simultaneouslyand标记到withstand讲。