The genetic distance (GD) among 22

The genetic distance (GD) among 22 genotypes of Chinese cabbage
inbred lines was examined for use in F1 hybrid cultivars. The genotypes
of one commercial cultivar, Chiifu, 3 turnip DH lines, and 4 komatsuna
inbred or DH lines were also examined. We selected 66 SSR markers
to calculate the GD, and a total of 163 alleles were identified among all
30 lines. There are 1 to 7 alleles (mean = 5.1 alleles) per marker
among 30 lines. The average scores of GD among Chinese cabbage, turnip, komatsuna, and all lines were 0.38, 0.48, 0.45, and 0.44, respectively
(Table S8). Scores of GD between Chinese cabbage and turnip lines, between Chinese cabbage and komatsuna lines, and between turnip and
komatsuna lines were 0.53, 0.51, and 0.46, respectively.
Next we calculated the GD using 38 CAPS markers, and a total of 143
alleles were identified in all 30 lines. There are 1 to 8 alleles (mean = 4.8
alleles) per marker among all 30 lines. The average scores of genetic distance among Chinese cabbage, turnip, komatsuna, and all lines were
0.42, 0.58, 0.59, and 0.50, respectively (Table S9). Scores of genetic distances between Chinese cabbage and turnip lines, between Chinese cabbage and komatsuna lines, and between turnip and komatsuna lines
were 0.56, 0.63, and 0.59, respectively.
We selected 288 nucleotide positions determined by RAD-seq. The
average scores of genetic distance among Chinese cabbage, turnip,
komatsuna, and all lines were 0.07, 0.20, 0.16, and 0.10, respectively
(Table S10). Scores of genetic distances between Chinese cabbage
and turnip lines, between Chinese cabbage and komatsuna lines,
and between turnip and komatsuna lines were 0.16, 0.15, and 0.19,
respectively.
GD calculated by the three methods was compared, and the correlation coefficient between SSR and CAPS, between SSR and RAD-seq, and
between CAPS and RAD-seq were 0.65 (p b 0.01), 0.68 (p b 0.01), and
0.73 (p b 0.01) (Fig. 1), respectively, indicating that there is a high
correlation among three methods. Using all genotype information
among 22 inbred lines of Chinese cabbage, the genetic distance between
RJKB-T05 and -T14 was lowest, and highest between RJKB-T07 and
-T19. A dendrogram based on cluster analysis in Neighbor-joining
placed all lines into 5 major groups. Four groups (I, III, IV, and V) were
comprised of Chinese cabbage inbred lines, and turnip and komatsuna
lines were in group-II (Fig. S2).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระยะห่างทางพันธุกรรม (GD) ระหว่าง 22 พันธุ์ปลีเสถียรสายล้อมสำหรับใช้ใน F1 ผสมพันธุ์ จีโนไทป์พันธุ์พาณิชย์หนึ่ง Chiifu เส้นผักกาด DH 3 และ 4 komatsunaเสถียร หรือยังมีการตรวจสอบบรรทัด DH เราเลือกเครื่องหมายยังคง 66ในการคำนวณ GD รวม 163 alleles ระบุทั้งหมด30 บรรทัด มี alleles 1 ถึง 7 (หมายถึง = 5.1 alleles) ต่อเครื่องหมายระหว่าง 30 บรรทัด คะแนนเฉลี่ยของ GD ปลี ผักกาด komatsuna และบรรทัดทั้งหมด 0.38, 0.48, 0.45 และ 0.44 ตามลำดับ(ตาราง S8) คะแนนของ GD ระหว่างผักกาดขาวปลีและผักกาดบรรทัด ระหว่างปลีและบรรทัด komatsuna และ ระหว่างผักกาด และkomatsuna บรรทัด ขึ้น 0.53, 0.51, 0.46 ตามลำดับต่อไป เราคำนวณ GD ที่ใช้เครื่องหมายหมวก 38 และรวม 143alleles ที่ระบุในบรรทัดทั้งหมด 30 มี alleles 1 ถึง 8 (หมายถึง = 4.8alleles) ต่อเครื่องหมายในบรรทัดที่ 30 ทั้งหมด มีคะแนนเฉลี่ยของระยะห่างทางพันธุกรรมระหว่างผักกาดขาวปลี ผักกาด komatsuna และรายการทั้งหมด0.42, 0.58, 0.59 และ 0.50 ตามลำดับ (ตาราง S9) คะแนนของระยะห่างทางพันธุกรรม ระหว่างผักกาดขาวปลีและผักกาดบรรทัด ระหว่างปลีและบรรทัด komatsuna และ ระหว่างเส้นผักกาด komatsunaขึ้น 0.56, 0.63, 0.59 ตามลำดับเราเลือกตำแหน่งนิวคลีโอไทด์ 288 กำหนด โดย RAD หมายเลขลำดับเฉลี่ยคะแนนระยะทางพันธุกรรมระหว่างปลี ผักกาดkomatsuna และรายการทั้งหมดถูก 0.07, 0.20, 0.16 และ 0.10 ตามลำดับ(ตาราง S10) คะแนนของระยะห่างทางพันธุกรรมระหว่างปลีและหัวผักกาด กะหล่ำปลีจีนระหว่างบรรทัด komatsunaแล้วระหว่างผักกาด komatsuna บรรทัด 0.16, 0.15 และ 0.19ตามลาดับGD ที่คำนวณ โดยวิธีการสามวิธีถูกเปรียบเทียบ และค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์ระหว่างสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตและหมวก ระหว่างสาธารณรัฐสังคมนิยมโซเวียตและ RAD seq และระหว่างฝาและ RAD seq 0.65 (p b 0.01), 0.68 (p b 0.01), และ0.73 (p b 0.01) (รูปที่ 1), ตามลำดับ ระบุที่มีอยู่สูงความสัมพันธ์ระหว่างวิธีการสามวิธี โดยใช้ข้อมูลลักษณะทางพันธุกรรมทั้งหมดหมู่ 22 เสถียรบรรทัดปลี ห่างทางพันธุกรรมRJKB-T05 และ - T14 ถูกต่ำสุด และสูงสุดระหว่าง RJKB-T07 และ-T19 Dendrogram ตามการวิเคราะห์คลัสเตอร์เข้าร่วมเพื่อนบ้านวางบรรทัดทั้งหมดเป็น 5 กลุ่มหลัก กลุ่มที่สี่ (ฉัน III, IV และ V)ประกอบด้วยปลีเสถียร บรรทัด และผักกาด และ komatsunaบรรทัดที่อยู่ในกลุ่ม II (มะเดื่อ S2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ระยะห่างทางพันธุกรรม (GD) หมู่ 22 สายพันธุ์ของผักกาดขาว
สายพันธุ์แท้ถูกตรวจสอบสำหรับการใช้งานใน F1 ไฮบริดพันธุ์ จีโนไทป์
ของพันธุ์หนึ่งในเชิงพาณิชย์ Chiifu 3 หัวผักกาดเส้น DH และ 4 komatsuna
กำเนิดหรือ DH สายนอกจากนี้ยังมีการตรวจสอบ เราเลือก 66 SSR เครื่องหมาย
ในการคำนวณ GD และรวม 163 อัลลีลที่ถูกระบุในทุก
30 คู่สาย มี 1-7 อัลลีล (เฉลี่ย = 5.1 อัลลีล) ต่อเครื่องหมายเป็น
หมู่ 30 คู่สาย คะแนนเฉลี่ยของ GD หมู่ผักกาดขาวปลีผักกาด komatsuna และทุกบรรทัดเป็น 0.38, 0.48, 0.45 และ 0.44 ตามลำดับ
(ตารางที่ S8) คะแนนของ GD ระหว่างกะหล่ำปลีและผักกาดจีนเส้นระหว่างกะหล่ำปลีและ komatsuna จีนเส้นและระหว่างหัวผักกาดและ
komatsuna เส้นละ 0.53, 0.51 และ 0.46 ตามลำดับ.
ต่อไปเราคำนวณ GD โดยใช้ 38 CAPS เครื่องหมายและรวม 143
อัลลีลเป็น ที่ระบุไว้ในทั้งหมด 30 คู่สาย มี 1-8 อัลลีล (เฉลี่ย = 4.8 มี
อัลลีล) ต่อเครื่องหมายในทุก 30 คู่สาย คะแนนเฉลี่ยของระยะทางพันธุกรรมของผักกาดขาวปลีผักกาด komatsuna และทุกบรรทัดเป็น
0.42, 0.58, 0.59 และ 0.50 ตามลำดับ (ตารางที่ S9) คะแนนของระยะทางพันธุกรรมระหว่างกะหล่ำปลีและผักกาดจีนเส้นระหว่างกะหล่ำปลีและ komatsuna จีนเส้นและระหว่างหัวผักกาดและ komatsuna เส้น
เป็น 0.56, 0.63 และ 0.59 ตามลำดับ.
เราเลือก 288 ตำแหน่งเบื่อหน่ายกำหนดโดย RAD-seq
คะแนนเฉลี่ยของระยะทางพันธุกรรมของผักกาดขาวปลีผักกาด
komatsuna และทุกบรรทัดเป็น 0.07, 0.20, 0.16 และ 0.10 ตามลำดับ
(ตารางที่ S10) คะแนนของระยะทางพันธุกรรมระหว่างผักกาดขาวปลี
และผักกาดเส้นระหว่างกะหล่ำปลีและ komatsuna จีนเส้น
และระหว่างหัวผักกาดและ komatsuna เส้นละ 0.16, 0.15 และ 0.19
ตามลำดับ.
GD คำนวณโดยสามวิธีการเปรียบเทียบและค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์ระหว่าง SSR และ CAPS ระหว่าง SSR และ RAD-seq และ
ระหว่างหมวกและ RAD-seq 0.65 (Pb 0.01) 0.68 (Pb 0.01) และ
0.73 (Pb 0.01) (รูป. 1) ตามลำดับแสดงให้เห็นว่ามีความสูง
ความสัมพันธ์ ในหมู่สามวิธี โดยใช้ข้อมูลจีโนไทป์ทุก
หมู่ 22 สายพันธุ์แท้ของกะหล่ำปลีจีนระยะทางพันธุกรรมระหว่าง
RJKB-T05 และ -T14 ต่ำสุดและสูงสุดระหว่าง RJKB-T07 และ
-T19 dendrogram จากการวิเคราะห์ในกลุ่มเพื่อนบ้านเข้า
วางสายทั้งหมดออกเป็น 5 กลุ่มหลัก สี่กลุ่ม (I, III, IV และ V) ถูก
ประกอบด้วยผักกาดขาวสายพันธุ์แท้และหัวผักกาดและ komatsuna
เส้นอยู่ในกลุ่ม-II (รูป. S2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

遗传距离（GD）：中国cabbage among 22 genotypes ofexamined for use in是农业系的F1株genotypes）混合品种。在一个商业品种，3 DH系，Chiifu turnip，4 komatsunaDH系农业系或是我们选择66也examined SSR标记。对calculate GD，和一个总的163 alleles是所有identified among of30。有1对线是7 alleles每小时（平均= 5.1 alleles）标记。30线平均成绩。among（GD），中国cabbage among turnip，komatsuna，和所有的线，是0.38 0.48 0.45 respectively 0.44，，，和S8（GD）。不同的表之间，中国和中国cabbage turnip线和线之间，和之间的komatsuna cabbageturnip和komatsuna线，是0.53 0.51 respectively 0.46，，和。下一步，我们使用标记的Gd calculated 38帽，和一个总的143在所有alleles是identified 30。有1对线是alleles 8（平均= 4.8所有alleles）。每among 30线标记遗传距离（平均成绩），中国cabbage among，komatsuna，turnip和所有的线都是0.42，0.58，0.59，和0.50（S9）。respectively表，不同的遗传distances之间，中国和turnip cabbage线。中国komatsuna线之间，和之间的cabbage和turnip和komatsuna线。是的，0.63 0.56 respectively 0.59，，和。我们选择的位置的RAD-seq 288 nucleotide determined）。遗传距离的平均成绩，中国cabbage，turnip amongkomatsuna，和所有的线，是0.07 0.20 0.16 respectively 0.10，，，和表不同（S10）。distances cabbage之间的遗传分析之间的中国和turnip线，线，和komatsuna cabbageturnip和komatsuna线和0.16之间，是0.15，和0.19，respectively。该方法是由三calculated GD之间的相关系数，和相比，SSR和SSR和盖之间RAD-seq，和这个是0.65帽和RAD-seq（P B），0.68 0.01 0.01（P B），和0.73 0.01（P B）（1）、respectively Fig。这是一个高的，indicating方法among所有相关信息Using三型。中国的农业系among 22 cabbage线之间，遗传距离RJKB-T05 lowest和T14之间，是RJKB-T07和最高。基于T19 dendrogram - A在Neighbor-joining聚类分析所有5系为主要组placed。四组（I，III，IV，和V）是在中国，comprised农业系和系cabbage turnip和komatsuna在group-II是Fig线（S2）。