We have used rice line Tetep as a r

We have used rice line Tetep as a resistant donor with the aim of mapping a durable blast resistance gene Pi-k h using RAPD and AFLP techniques in conjunction with bulk segregant analysis. An F2 mapping population consisting of 205 plants was generated by crossing Tetep with HP2216, a highly susceptible cultivar. Inoculation with specific isolate (PLP-1) of Magnaporthe grisea at seeding stage showed that the Pi-k h gene inherited as a single dominant gene in F2 population. RAPD analysis was performed with 240 primers to detect polymorphism between resistant and susceptible parents. Of these, 48 primers produced polymorphic banding pattern between resistant and susceptible parents. Bulk segregant analysis was performed with 48 primers of which 5 showed polymorphism between resistant and susceptible bulks. A 700 bp DNA band was obtained in resistant F2 plants with primer 5-129 indicating its linkage to the resistance gene. Out of 64 AFLP primer combinations used for polymorphism survey between HP 2216 and Tetep, 11 AFLP primer combinations were able to distinguish the resistant and susceptible bulks. An AFLP band of 75 bp obtained with primer combination, E-TAlM-CTC co-segregated with the resistance gene. The RAPD marker 5-129700 and AFLP75 were placed on the linkage map at a distance of 2.1 eM and 15.1 eM flanking to Pi-k hgene, respectively. The RAPD band closely linked to Pi-k h gene was sequenced and used for the development of CAPs markers which also co-segregated with resistant phenotype in the mapping population. On sequence analysis and homology search of RAPD fragment with whole rice genome sequence database and the information available on physical, genetic and sequence maps of rice, the co-segregating CAPs marker was placed at long arm of rice chromosome 11. CAPs marker developed in this study showed polymorphism in different rice cultivars grown in North-Western Himalayan region and is being used for the pyramiding of Pi-k h gene along with other blast resistance genes using marker-assisted selection.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราใช้ข้าวบรรทัด Tetep เป็นผู้บริจาคที่ทนกับจุดมุ่งหมายของการแม็ประเบิดทนทานต้านทานยีนพี่ k h โดยใช้เทคนิคอาร์เอพีดีและ AFLP ร่วมกับการวิเคราะห์ segregant จำนวนมาก ประชากรการแม็ป F2 ที่ประกอบด้วยพืช 205 ถูกสร้างขึ้น โดยข้าม Tetep กับ HP2216, cultivar สูงไวต่อ Inoculation มีเฉพาะแยก (PLP-1) ของ Magnaporthe grisea ที่ปลูกระยะพบว่าปี่-k สืบทอดยีน h เป็นยีนหลักเดียวในประชากร F2 วิเคราะห์อาร์เอพีดีที่ดำเนินการกับไพรเมอร์ 240 ตรวจหาโพลิมอร์ฟิซึมระหว่างพ่อแม่ทน และไวต่อ เหล่านี้ ไพรเมอร์ 48 ผลิตแบบ polymorphic banding ระหว่างพ่อแม่ทน และไวต่อ วิเคราะห์ segregant จำนวนมากที่ดำเนินการ ด้วยไพรเมอร์ที่ 48 ของที่ 5 แสดงโพลิมอร์ฟิซึมระหว่าง bulks ทน และไวต่อ ดีเอ็นเอ 700 bp วงกล่าวในพืช F2 ทนกับรองพื้น 5-129 แสดงความเชื่อมโยงกับยีนต้านทาน ชุดรองพื้น AFLP 11 ก็ไม่สามารถแยกแยะ bulks ทน และไวต่อจาก 64 AFLP พื้นชุดใช้สำหรับการสำรวจโพลิมอร์ฟิซึมระหว่าง HP 2216 Tetep วง AFLP 75 รับกับผสมรองพื้น บีพีอี-TAlM-CTC ร่วมแยกกับยีนต้านทาน อาร์เอพีดีเครื่องหมาย 5-129700 และ AFLP75 ถูกวางแผนที่เชื่อมโยงในระยะทาง 2.1 eM และ eM 15.1 flanking Pi k hgene ตามลำดับ วงการอาร์เอพีดีที่เชื่อมโยงอย่างใกล้ชิดกับยีน h k ปี่ถูกเรียงลำดับ และใช้ในการพัฒนาเครื่องหมายหมวกซึ่งยัง ร่วมแยกกับ phenotype ทนในประชากรการแม็ป ลำดับวิเคราะห์และ homology ค้นหาอาร์เอพีดีส่วนกับข้าวทั้งจีโนมลำดับฐานข้อมูลที่พร้อมใช้งานบนทางกายภาพ ทางพันธุกรรมและแผนผังลำดับของข้าว เครื่องหมายหมวกร่วม segregating ถูกวางไว้ที่แขนยาวของโครโมโซมข้าว 11 เครื่องหมายหมวกที่ได้รับการพัฒนาในการศึกษานี้แสดงให้เห็นว่าโพลีมอร์ฟิซึมในพันธุ์ข้าวต่าง ๆ ที่ปลูกในภูมิภาคหิมาลัยตะวันตกเหนือ และถูกใช้สำหรับ pyramiding ของยีน h k ปี่กับยีนต้านทานระเบิดอื่น ๆ โดยใช้เครื่องหมายช่วยเลือก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราได้ใช้สาย Tetep ข้าวเป็นผู้บริจาคทนโดยมีวัตถุประสงค์ของการทำแผนที่ความต้านทานความคงทนของยีนระเบิดชั่วโมง Pi-k ใช้ RAPD และเทคนิค AFLP ร่วมกับกลุ่มวิเคราะห์ segregant การทำแผนที่ประชากร F2 ประกอบด้วยพืช 205 ถูกสร้างขึ้นโดยข้าม Tetep กับ HP2216, พันธุ์ไวต่อสูง การฉีดวัคซีนกับแยกเฉพาะ (PLP-1) ของ Magnaporthe grisea ในขั้นตอนการเพาะพบว่ายีนเอช Pi-k ได้รับมรดกเป็นยีนเด่นเดียวในประชากร F2 การวิเคราะห์ดีเอ็นเอได้ดำเนินการกับไพรเมอร์ 240 ในการตรวจสอบความแตกต่างระหว่างผู้ปกครองทนและอ่อนไหว ของเหล่านี้ 48 ไพรเมอร์ที่ผลิตรูปแบบแถบ polymorphic ระหว่างผู้ปกครองทนและอ่อนไหว การวิเคราะห์ segregant กลุ่มได้ดำเนินการกับไพรเมอร์ 48 ซึ่งแสดงให้เห็นความแตกต่าง 5 ระหว่าง bulks ทนและอ่อนไหว วงดนตรีดีเอ็นเอ 700 bp ที่ได้รับในพืช F2 ทนกับไพรเมอร์แสดงให้เห็นความเชื่อมโยง 5-129 ในการแสดงออกของยีนต้านทาน ออกจาก 64 AFLP รวมกันไพรเมอร์ที่ใช้ในการสำรวจความแตกต่างระหว่าง HP 2216 และ Tetep 11 AFLP ไพรเมอร์รวมกันก็สามารถที่จะแยกแยะความแตกต่าง bulks ทนและอ่อนไหว วงดนตรี AFLP 75 bp ได้มีการรวมกันไพรเมอร์, E-TAlM-CTC ร่วมกับแยกยีนต้านทาน เครื่องหมาย RAPD 5-129700 และ AFLP75 ถูกวางไว้บนแผนที่เชื่อมโยงในระยะทาง 2.1 EM และ 15.1 eM ขนาบข้างไป hgene Pi-k ตามลำดับ วงดนตรี RAPD เชื่อมโยงอย่างใกล้ชิดกับยีนเอช Pi-k ได้ติดใจและใช้สำหรับการพัฒนาของตัวบ่งชี้ตัวพิมพ์ใหญ่ที่ยังได้ร่วมกับฟีโนไทป์แยกทนของประชากรในการทำแผนที่ การวิเคราะห์และการค้นหาลำดับที่คล้ายคลึงกันของชิ้นส่วนดีเอ็นเอกับฐานข้อมูลจีโนมข้าวลำดับทั้งหมดและข้อมูลที่มีอยู่ในทางกายภาพทางพันธุกรรมและแผนที่ลำดับของข้าวเครื่องหมาย CAPs ร่วมแยกวางอยู่ที่แขนยาวของโครโมโซมข้าว 11. เครื่องหมายการพัฒนาในตัวพิมพ์ใหญ่นี้ การศึกษาพบความแตกต่างในสายพันธุ์ข้าวที่ปลูกที่แตกต่างกันในภูมิภาคหิมาลัยตะวันตกเฉียงเหนือและจะถูกใช้สำหรับ pyramiding ของยีนเอช Pi-k พร้อมกับยีนต้านทานระเบิดอื่น ๆ โดยใช้การเลือกเครื่องหมายช่วย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราได้ใช้ tetep เส้นข้าวเป็นผู้บริจาคที่ทนกับจุดมุ่งหมายของแผนที่ระเบิดความต้านทานคงทนยีนโดยใช้เทคนิค RAPD และ AFLP pi-k H เทคนิคร่วมกับการวิเคราะห์ segregant เป็นกลุ่ม เป็น F2 แผนที่ประชากรประกอบด้วย 205 พืชที่ถูกสร้างขึ้นโดยข้าม tetep กับ hp2216 พันธุ์สูง , ความอ่อนแอการแยก ( เฉพาะ plp-1 ) ของ magnaporthe นาน 2 ชั่วโมง พบว่า เมล็ดที่เวที pi-k H ยีนถ่ายทอดเป็นยีนเด่นเดียวในประชากร F2 การวิเคราะห์ RAPD primers คือการตรวจหา polymorphism ระหว่าง 240 และทนต่อพ่อแม่ ของเหล่านี้ ชนิดที่ผลิตจำนวน 48 ประเทศไทยระหว่าง ต้านทานต่อพ่อแม่การวิเคราะห์ segregant ขนาดใหญ่แสดงกับ 48 ไพรเมอร์ที่ 5 พบความหลากหลายระหว่างทนไว bulks . 700 / แถบดีเอ็นเอในพืชทนได้ F2 ด้วยไพรเมอร์ 5-129 แสดงการเชื่อมโยงของการต่อต้านจีน จาก 64 เทคนิคผสมรองพื้นใช้ Polymorphism ระหว่างเอชพีและสำรวจ tetep 1977 ,11 เทคนิคผสมรองพื้นสามารถแยกแยะทนไว bulks . เป็นเอเอฟวงดนตรี 75 BP ได้ด้วยไพรเมอร์ผสม e-talm-ctc Co แยกกับความต้านทานของยีน ที่เพียงและเครื่องหมาย 5-129700 aflp75 ถูกวางไว้บนแผนที่การเชื่อมโยงที่ระยะทาง 2.1 เอ็มเอ็มที่จะ pi-k hgene flanking และ 15.1 ตามลำดับโดยวงดนตรีที่เชื่อมโยงอย่างใกล้ชิดเพื่อ pi-k H ยีนยีน และใช้สำหรับการพัฒนาของหมวกเครื่องหมายซึ่งยังร่วมแยกกับทนในแผนที่ที่มีประชากร ในการวิเคราะห์และทดลองค้นหาที่สุดส่วนที่มีทั้งข้าวจีโนมลำดับฐานข้อมูลและข้อมูลทางกายภาพและลำดับลำดับแผนที่พันธุกรรมของข้าวร่วมแยกเครื่องหมายหมวกถูกวางไว้ที่แขนยาวของโครโมโซมของข้าว 11 เครื่องหมายหมวกที่พัฒนาขึ้นในการศึกษานี้ พบความหลากหลายในสายพันธุ์ข้าวที่ปลูกแตกต่างกันทางภาคตะวันตกเฉียงเหนือภูมิภาคหิมาลัยและถูกใช้สำหรับ pyramiding ของ pi-k H ยีนด้วยยีนต้านทานระเบิดอื่น ๆ โดยใช้เครื่องหมายช่วยในการคัดเลือก