were quality assessed with the qual

were quality assessed with the quality assessment software FastQC [34]. Because Saccharomyces
cerevisiae (S. cerevisiae) is the main food source of lab-reared springtails, we expected that
the sequences could be contaminated with yeast RNA. Also, contamination by human DNA
and by DNA from Wolbachia, an obligate bacterial endosymbiont of F. candida were considered.
To check for potential contamination in both datasets, the raw reads were mapped to the
genomes of Homo sapiens [35], S. cerevisiae [35] and Wolbachia [36] with TopHat 2.0.8 [37]
using default parameters. The raw reads that were not mapped to the above genomes were
used for the assembly.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีคุณภาพพร้อมซอฟต์แวร์ประเมินคุณภาพ FastQC [34] เนื่องจาก Saccharomycescerevisiae (S. cerevisiae) เป็นแหล่งอาหารหลักของ springtails เลี้ยงแล็บ เราคาดไว้ที่ลำดับที่อาจจะปนเปื้อนกับยีสต์ RNA นอกจากนี้ การปนเปื้อน โดยดีเอ็นเอมนุษย์และพิจารณาว่า โดยดีเอ็นเอจาก Wolbachia, endosymbiont แบคทีเรียเป็น obligate ของ F. candidaการตรวจสอบการปนในทั้งสองชุดข้อมูล อ่านดิบถูกแมปไปยังgenomes ของตุ๊ด sapiens [35], S. cerevisiae [35] และ [36] Wolbachia กับ TopHat 2.0.8 [37]ใช้พารามิเตอร์เริ่มต้น อ่านดิบที่ไม่ได้ถูกแมปกับ genomes ข้างต้นได้ใช้สำหรับแอสเซมบลี

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ได้รับการประเมินคุณภาพกับซอฟต์แวร์การประเมินคุณภาพ FastQC [34] เพราะ Saccharomyces
cerevisiae (เอส cerevisiae) เป็นแหล่งอาหารหลักของ springtails ห้องปฏิบัติการเลี้ยงเราคาดหวังว่า
ลำดับที่อาจจะปนเปื้อนด้วยยีสต์อาร์เอ็นเอ นอกจากนี้ยังมีการปนเปื้อนจากดีเอ็นเอของมนุษย์
และดีเอ็นเอจาก Wolbachia เป็นแบคทีเรีย endosymbiont หนี้บุญคุณของเอฟได้รับการพิจารณา Candida.
ในการตรวจสอบการปนเปื้อนที่อาจเกิดขึ้นทั้งในชุดข้อมูลดิบอ่านถูกแมปไปยัง
จีโนมของมนุษย์ปัจจุบัน [35], S. cerevisiae [35] และ Wolbachia [36] กับ Tophat 2.0.8 [37]
โดยใช้ค่าเริ่มต้น ดิบอ่านที่ไม่ได้ถูกแมปกับจีโนมดังกล่าวข้างต้นถูก
ใช้สำหรับการชุมนุม