red (see Supporting information, Figs S3 and S4).
Our results provide further support for the application
of target sequence capture within the field of
systematics. Target sequence capture could have particular
importance for museum collections by opening
up possibilities for incorporating genetic material
from type specimens. These specimens underpin the
morphological descriptions of almost all recognized
species and, as such, serve as benchmarks for field
identification and taxonomy (Kingdon, 1997; Csorba
et al., 2003), as well as for conservation action
(DeSalle & Amato, 2004). Yet, despite this, only a
relatively small proportion of type specimens has
been sequenced for inclusion in studies of phylogenetics
and phylogenomics (Schindel et al., 2011;
Staats et al., 2013; Brugler et al., 2014). Notable
exceptions include the current efforts by the American
Museum of Natural History to obtain COI barcodes
from their mammal type specimens (Brugler
et al., 2014). The rarity of such initiatives is unfortunate,
not least because surprisingly large numbers of
field researchers are unable to assign a taxonomic
name to their study organisms with complete confi-
dence (Wilson, 2000; Kim & Byrne, 2006; Bennett &
Balick, 2014). This is especially true of researchers
working on taxa that are cryptic or otherwise morphologically
difficult to tell apart (Jones & Vanparijs,
1993; Kingston et al., 2001; Soisook et al., 2008).
Sequencing of type material would benefit large
numbers of taxonomists, including collectors and
museum staff, who are engaged in laborious comparisons
involving costly international loans and visits.
If more type specimens were sequenced, then verifying
the status of new species would be much simpler
(Schindel et al., 2011; Brugler et al., 2014) and, effectively,
digital through the use of online databases
(Rhead et al., 2010; Kasprzyk, 2011; Goodstein et al.,
2012). Additionally, it would help settle long-standing
taxonomic debates, including the verification of
the taxonomic distinctiveness of numerous specimens
that were described in the past but are now viewed
as questionable (Zhang et al., 2009; Helgen et al.,
2013).
สีแดง (ดูข้อมูลเสริม มะเดื่อ S3 และ S4)ผลของเราให้การสนับสนุนเพิ่มเติมสำหรับโปรแกรมประยุกต์ของเป้าหมายลำดับจับภายในเขตของอนุกรมวิธานของ จับลำดับเป้าหมายอาจมีเฉพาะสำคัญสำหรับคอลเลกชันพิพิธภัณฑ์โดยเปิดโอกาสสำหรับการนำสารพันธุกรรมจากตัวอย่างชนิดนี้ ตัวอย่างเหล่านี้หนุนการอธิบายสัณฐานของเกือบทั้งหมดที่รู้จักสายพันธุ์และ เช่น เป็นเกณฑ์มาตรฐานสำหรับฟิลด์ระบุและจำแนกประเภท (อาณาจักรอ 1997 Csorbaet al. 2003), เช่นเดียวกับการดำเนินการอนุรักษ์(DeSalle & Amato, 2004) แม้นี้ เท่านั้น ยังมีมีสัดส่วนค่อนข้างเล็กของชิ้นงานชนิดการเรียงลำดับสำหรับการรวมในการศึกษาวงศ์วานวิวัฒนาการและ phylogenomics (Schindel et al. 2011Staats et al. 2013 Brugler et al. 2014) ไดแกข้อยกเว้นรวมอกีดอเมริกันปัจจุบันพิพิธภัณฑ์ประวัติศาสตร์ธรรมชาติรับบาร์โค้ด COIจากตัวอย่างของประเภทเลี้ยงลูกด้วยนม (Brugleret al. 2014) สิ่งที่หายากของโครงการดังกล่าวเป็นโชคร้ายไม่น้อยเพราะจู่ ๆ จำนวนมากฟิลด์นักวิจัยไม่สามารถกำหนดเป็นอนุกรมวิธานชื่อของพวกเขามีชีวิตศึกษากับสมบูรณ์ confi-dence (Wilson, 2000 คิม & Byrne, 2006 เบนเน็ตต์และBalick, 2014) อย่างยิ่งของนักวิจัยทำงานในลับ หรือมิฉะนั้น morphologicallyยากที่จะบอกกัน (Jones & Vanparijsปี 1993 Kingston et al. 2001 Soisook et al. 2008)ลำดับชนิดของวัสดุจะได้รับประโยชน์มากจำนวน taxonomists รวมทั้งนักสะสม และพนักงานพิพิธภัณฑ์ ที่มีส่วนร่วมในการเปรียบเทียบลำบากเกี่ยวข้องกับเงินกู้ยืมต่างประเทศค่าใช้จ่ายและเข้าชมถ้าเพิ่มเติมพิมพ์ ชิ้นงานถูกเรียงลำดับ การตรวจสอบแล้วสถานะของสายพันธุ์ใหม่จะง่ายมาก(Schindel et al. 2011 Brugler et al. 2014) และ มี ประสิทธิภาพดิจิตอลผ่านการใช้ฐานข้อมูลออนไลน์(Rhead et al. 2010 Kasprzyk, 2011 Goodstein et al.,2012) . นอกจากนี้ มันจะช่วยชำระยาวนานอนุกรมวิธานอภิปราย รวมทั้งการตรวจสอบของงามอนุกรมวิธานอย่างมากมายที่อธิบายไว้ในอดีต แต่ตอนนี้ดูเป็นน่าสงสัย (Zhang et al. 2009 Helgen et al.,2013)
การแปล กรุณารอสักครู่..
สีแดง (ดูข้อมูลสนับสนุนมะเดื่อ S3 และ S4).
ผลของเราให้การสนับสนุนต่อไปสำหรับแอพลิเคชัน
ของการจับภาพเป้าหมายลำดับภายในเขตของ
ระบบ เป้าหมายการจับลำดับโดยเฉพาะอย่างยิ่งจะมี
ความสำคัญสำหรับคอลเลกชันพิพิธภัณฑ์โดยการเปิด
ขึ้นเป็นไปได้สำหรับการรวมสารพันธุกรรม
จากชนิดตัวอย่าง ตัวอย่างเหล่านี้หนุน
รายละเอียดทางสัณฐานวิทยาของเกือบทุกได้รับการยอมรับ
ชนิดและเป็นเช่นนี้ทำหน้าที่เป็นมาตรฐานสำหรับเขตข้อมูล
บัตรประจำตัวและอนุกรมวิธาน (Kingdon, 1997; Csorba
., et al, 2003) เช่นเดียวกับการดำเนินการอนุรักษ์
(DeSalle และอะมา, 2004) . แต่อย่างไรก็ตามเรื่องนี้เป็นเพียง
สัดส่วนที่ค่อนข้างเล็กของประเภทตัวอย่างได้
รับการจัดลำดับให้รวมอยู่ในการศึกษาของ phylogenetics
และ phylogenomics (Schindel et al, 2011;.
Staats et al, 2013;.. Brugler et al, 2014) เด่น
ข้อยกเว้นรวมถึงความพยายามในปัจจุบันโดยอเมริกัน
พิพิธภัณฑ์ประวัติศาสตร์ธรรมชาติที่จะได้รับบาร์โค้ด COI
จากเลี้ยงลูกด้วยนมประเภทตัวอย่างของพวกเขา (Brugler
et al., 2014) ความประเสริฐของการริเริ่มดังกล่าวเป็นโชคร้าย
ไม่น้อยเพราะจำนวนมากที่น่าแปลกใจของ
นักวิจัยภาคสนามไม่สามารถที่จะกำหนดอนุกรมวิธาน
ชื่อสิ่งมีชีวิตการศึกษาของพวกเขาด้วยมั่นสมบูรณ์
มั่นใจ (วิลสัน, 2000 คิมและเบิร์น 2006 เบนเน็ตต์และ
Balick 2014) . โดยเฉพาะอย่างยิ่งของนักวิจัย
ที่ทำงานเกี่ยวกับแท็กซ่าที่มีความลับหรือมิฉะนั้นสัณฐาน
ยากที่จะบอกความแตกต่าง (โจนส์และ Vanparijs,
1993 คิงส์ตัน et al, 2001;. Soisook et al, 2008.).
ลำดับของวัสดุประเภทจะได้รับประโยชน์ขนาดใหญ่
จำนวน อนุกรมวิธานรวมทั้งนักสะสมและ
เจ้าหน้าที่พิพิธภัณฑ์ที่มีส่วนร่วมในการเปรียบเทียบลำบาก
ที่เกี่ยวข้องกับการให้กู้ยืมเงินระหว่างประเทศค่าใช้จ่ายและการเข้าชม.
หากมีประเภทตัวอย่างมีลำดับขั้นตอนแล้วการตรวจสอบ
สถานะของสายพันธุ์ใหม่จะง่ายมาก
(Schindel et al, 2011;. Brugler et al, . 2014) และมีประสิทธิภาพ
ดิจิตอลผ่านการใช้ฐานข้อมูลออนไลน์
(Rhead et al, 2010;. Kasprzyk 2011. Goodstein, et al,
2012) นอกจากนี้ก็จะช่วยชำระยาวนาน
อภิปรายการจัดหมวดหมู่รวมทั้งการตรวจสอบของ
เอกเทศอนุกรมวิธานของตัวอย่างจำนวนมาก
ที่ได้อธิบายไว้ในอดีต แต่จะถูกมองในขณะนี้
เป็นที่น่าสงสัย (Zhang et al, 2009;.. Helgen, et al,
2013)
การแปล กรุณารอสักครู่..
สีแดง ( ดูข้อมูลประกอบ , มะเดื่อ S3 และ S4 )ผลของเราให้เพิ่มเติมเพื่อสนับสนุนโปรแกรมจับลำดับเป้าหมายภายในเขตของระบบ . จับเป้าหมายได้โดยลำดับความสำคัญสำหรับพิพิธภัณฑ์คอลเลกชันโดยเปิดอัพความผสมผสานทางพันธุกรรมจากตัวอย่างชนิด ตัวอย่างเหล่านี้เป็นรากฐานลักษณะสัณฐานวิทยาของเกือบทั้งหมดที่รู้จักชนิด เช่น ใช้เป็นมาตรฐานสำหรับฟิลด์การจำแนกและอนุกรมวิธาน ( คิงเดิ่น , 1997 ; csorbaet al . , 2003 ) , เช่นเดียวกับการกระทำเพื่อการอนุรักษ์( desalle & Amato , 2004 ) แต่อย่างไรก็ตามเรื่องนี้เท่านั้นตัวอย่างของประเภทมีสัดส่วนค่อนข้างเล็กเป็นลำดับสำหรับการรวมอยู่ในการศึกษาของไฟโลเจเนติกและ phylogenomics ( schindel et al . , 2011 ;สตาตส์ et al . , 2013 ; brugler et al . , 2010 ) เด่นข้อยกเว้น รวมถึงปัจจุบันความพยายามโดยอเมริกันพิพิธภัณฑ์ประวัติศาสตร์ธรรมชาติที่จะได้รับผมบาร์โค้ดจากตัวอย่าง ( brugler สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดet al . , 2010 ) ที่หายากของการริเริ่มดังกล่าวคือโชคร้ายไม่น้อย เพราะจู่ ๆของตัวเลขขนาดใหญ่นักวิจัยภาคสนามไม่สามารถกำหนดอนุกรมวิธานชื่อของสิ่งมีชีวิตศึกษา - ลงทะเบียนสมบูรณ์dence ( Wilson , 2000 ; คิม และ เบิร์น , 2006 ; เบนเน็ตต์ &balick 2014 ) นี้เป็นจริงโดยเฉพาะอย่างยิ่งของนักวิจัยทำซ่าที่คลุมเครือ หรือมิฉะนั้น จากยากที่จะบอกกัน ( vanparijs โจนส์ & ,1993 ; Kingston et al . , 2001 ; soisook et al . , 2008 )ลำดับชนิดของวัสดุจะได้รับประโยชน์มากจำนวน taxonomists รวมทั้งนักสะสมและเจ้าหน้าที่พิพิธภัณฑ์ ที่เป็นธุระในการเปรียบเทียบคงลำบากที่เกี่ยวข้องกับสินเชื่อต่างประเทศราคาแพง และชมถ้าตัวอย่างชนิดมากขึ้นเป็นลำดับ แล้วตรวจสอบสถานะของสายพันธุ์ใหม่น่าจะง่ายกว่ามาก( schindel et al . , 2011 ; brugler et al . , 2010 ) และ ได้อย่างมีประสิทธิภาพดิจิตอลผ่านการใช้ฐานข้อมูลออนไลน์( rhead et al . , 2010 ; kasprzyk 2011 ; goodstein et al . ,2012 ) นอกจากนี้ก็จะช่วยจัดการยืนยาวการอภิปรายทาง รวมถึงการตรวจสอบของที่แตกต่างและตัวอย่างมากมายที่ได้ถูกอธิบายไว้ในอดีต แต่ตอนนี้ดูเป็นที่น่าสงสัย ( Zhang et al . , 2009 ; เกน et al . ,2013 )
การแปล กรุณารอสักครู่..