A collection of 50 indigenous meta-

A collection of 50 indigenous meta-toluate tolerating bacteria isolated from oil-contaminated rhizosphere of Galega orientalis on selective medium was characterized and identified by classical and molecular methods. 16S rDNA partial sequencing showed the presence of five major lineages of the Bacteria domain. Gram-positive Rhodococcus, Bacillus and Arthrobacter and gram-negative Pseudomonas were the most abundant genera. Only one-fifth of the strains that tolerated m-toluate also degraded m-toluate. The inoculum Pseudomonas putida PaW85 was not found in the rhizosphere samples. The ability to degrade m-toluate by the TOL plasmid was detected only in species of the genus Pseudomonas. However, a few Rhodococcus erythropolis strains were found which were able to degrade m-toluate. A new finding was that Pseudomonas migulae strains and a few P. oryzihabitans strains were able to grow on m-toluate and most likely contained the TOL plasmid. Because strain specific differences in degradation abilities were found for P. oryzihabitans, separation at the strain level was important. For strain specific separation (GTG)5 fingerprinting was the best method. A combination of the single locus ribotyping and the whole genomic fingerprinting techniques with the selective partial sequencing formed a practical molecular toolbox for studying genetic diversity of culturable bacteria in oil-contaminated rhizosphere.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การเก็บรวบรวมจาก 50 ประเทศแบคทีเรียทนเมตา tol​​uate-แยกออกจากบริเวณรากน้ำมันปนเปื้อนของ orientalis Galega ในสื่อการคัดเลือกก็มีลักษณะและระบุวิธีการคลาสสิกและโมเลกุล 16s rDNA บางส่วนลำดับที่แสดงให้เห็นการปรากฏตัวของห้า lineages ที่สำคัญของโดเมนแบคทีเรีย Rhodococcus แกรมบวก,บาซิลลัสและ Arthrobacter และแกรมลบ Pseudomonas เป็นจำพวกที่มีมากที่สุด เพียงหนึ่งในห้าของสายพันธุ์ที่ทน M-toluate ยังเสื่อมโทรม M-toluate เชื้อ Pseudomonas putida paw85 ไม่พบในตัวอย่างที่บริเวณราก ความสามารถในการย่อยสลาย M-toluate โดย TOL พลาสมิดถูกตรวจพบเฉพาะในสายพันธุ์ของพืชและสัตว์ Pseudomonas อย่างไรก็ตามสายพันธุ์ erythropolis Rhodococcus ไม่กี่พบซึ่งก็สามารถที่จะลด M-toluate การค้นพบใหม่คือการที่สายพันธุ์ Pseudomonas migulae และ p ไม่กี่ สายพันธุ์ oryzihabitans ก็สามารถที่จะเติบโตบน m-toluate และส่วนใหญ่มีแนวโน้มที่จะ TOL พลาสมิด เพราะความแตกต่างของสายพันธุ์โดยเฉพาะความสามารถในการย่อยสลายของเขาถูกพบสำหรับ p oryzihabitans แยกระดับความเครียดเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการแยกสายพันธุ์ที่เฉพาะเจาะจง (GTG) 5 พิมพ์ลายนิ้วมือเป็นวิธีที่ดีที่สุด การรวมกันของ ribotyping ทีเดียวและเทคนิคการพิมพ์ลายนิ้วมือจีโนมทั้งหมดที่มีการเรียงลำดับบางส่วนที่เลือกกลายเป็นโมเลกุลกล่องเครื่องมือในทางปฏิบัติสำหรับการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อแบคทีเรียที่ culturable ในน้ำมันที่ปนเปื้อน-บริเวณราก.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

คอลเลกชันของ 50 meta toluate ชน tolerating แบคทีเรียแยกต่างหากจากน้ำมันปนเปื้อนไรโซสเฟียร์ของ Galega orientalis ในกลางงานถูกลักษณะ และระบุวิธีคลาสสิก และโมเลกุล 16S rDNA ลำดับบางส่วนพบของ 5 เชื้อชาติหลักของโดเมนแบคทีเรีย แบคทีเรียแกรมบวก Rhodococcus คัด และ Arthrobacter และ Pseudomonas แบคทีเรียแกรมลบได้สกุลอุดมสมบูรณ์มากที่สุด เพียง 1 5 ของสายพันธุ์ที่สม m toluate ยังเสื่อมโทรม m toluate Putida ลี inoculum PaW85 ไม่พบในตัวอย่างไรโซสเฟียร์ ความสามารถในการ m toluate โดย plasmid แก่พบเฉพาะในสายพันธุ์ของพืชสกุลลี อย่างไรก็ตาม สายพันธุ์กี่ Rhodococcus erythropolis ตรวจพบซึ่งมีความสามารถในการ m toluate ค้นหาใหม่เป็นสายพันธุ์ Pseudomonas migulae และสายพันธุ์ P. oryzihabitans กี่สามารถเติบโตบน m toluate และจะประกอบด้วย plasmid แก่ เนื่องจากพบความแตกต่างเฉพาะต้องใช้ในการลดความสามารถสำหรับ P. oryzihabitans แยกระดับต้องใช้เป็นสิ่งสำคัญ การต้องใช้แยกเฉพาะ (GTG) 5 ลายพิมพ์เป็นวิธีดีที่สุด Ribotyping โลกัสโพลเดียวและเทคนิค fingerprinting genomic ทั้งหมด ด้วยลำดับบางส่วนเลือกรูปแบบเครื่องมือระดับโมเลกุลการปฏิบัติสำหรับการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของแบคทีเรีย culturable ในไรโซสเฟียร์ที่ปนเปื้อนน้ำมัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

คอลเลคชั่นของแบคทีเรีย 50 พื้นเมืองเมตา - toluate เพื่อให้ทนต่อแยกต่างหากจาก rhizosphere น้ำมัน - การปนเปื้อนของ orientalis galega ในขนาดกลางมีทางเลือกเป็นลักษณะและระบุว่าโดยวิธีใดวิธีหนึ่งในแบบคลาสสิกและระดับโมเลกุล 16 S rdna บางส่วนการจัดลำดับให้เห็นการมีอยู่ของห้ารากฐานสำคัญของโดเมนแบคทีเรีย rhodococcus กรัมในเชิงบวกarthrobacter pseudomonas กรัม - ลบและเชื้อก็เอื้องที่สุด เพียงหนึ่งในห้าของพันธุ์ที่น่าเบื่อหน่าย m - toluate ยังถูกปรับระดับลงม. - toluate . putida pseudomonas inoculum paw 85 ไม่พบในตัวอย่าง rhizosphere ได้ ความสามารถในการลดลงม. - toluate โดย plasmid TOL ในระยะทางที่มีการตรวจพบเฉพาะในสายพันธุ์ของพืชที่ pseudomonas แต่ถึงอย่างไรก็ตามความตึงเครียด erythropolis rhodococcus เพียงไม่กี่คนที่พบซึ่งก็สามารถลดลงม. - toluate การค้นหาใหม่ว่าพันธุ์และพันธุ์ migulae pseudomonas oryzihabitans p .เพียงไม่กี่คนที่สามารถขยายตัวในม. - toluate และเป็นไปได้มากที่อยู่ plasmid TOL ในระยะทางที่ เพราะความเมื่อยล้าความแตกต่างในความสามารถการเสื่อม สภาพ ไม่พบสำหรับ oryzihabitans p .การแยกในระดับสายพันธุ์นี้เป็นสิ่งสำคัญสำหรับความเมื่อยล้าการแยกเฉพาะ(เวลา) 5 fingerprinting เป็นวิธีที่ดีที่สุด การผสมผสานของ ribotyping สภาพ เดียวและมีเทคนิคการ fingerprinting genomic ทั้งหมดที่พร้อมด้วยทางเลือกการจัดลำดับบางส่วนได้, toolbox ,ระดับโมเลกุลที่ใช้งานได้จริงสำหรับการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อแบคทีเรีย culturable ใน rhizosphere น้ำมัน - การปนเปื้อน.