Here, we used high throughput next-

Here, we used high throughput next-generation sequencing (NGS) to identify molecular and biological processes involved in the responses to environmental changes. Preliminary tests revealed that seawater (SW)-acclimated milkfish tolerated lower temperatures than the fresh water (FW)-acclimated group. Although FW- and SW-acclimated milkfish have different levels of tolerance for hypothermal stress, to date, the molecular physiological basis of this difference has not been elucidated. Here, we performed a next-generation sequence analysis of mRNAs from four groups of milkfish.We obtained 29669 unigenes with an average length of approximately 1936 base pairs. Gene ontology (GO) analysis was performed after gene annotation. A large number of genes for molecular regulation were identified through a transcriptomic comparison in a KEGG analysis. Basal metabolic pathways involved in hypothermal tolerance, such as glycolysis, fatty acid metabolism, amino acid catabolism and oxidative phosphorylation, were analyzed using PathVisio and Cytoscape software. Our results indicate that in response to hypothermal stress, genes for oxidative phosphorylation, e.g., succinate dehydrogenase, were more highly up-regulated in SW than FW fish. Moreover, SW and FWmilkfish used different strategies when exposed to hypotherma stress: SW milkfish up-regulated oxidative phosphorylation and catabolism genes to produce more energy budget, whereas FWmilkfish down-regulated genes related to basal metabolism to reduce energy loss.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ที่นี่ เราใช้อัตราความเร็วสูงยุค sequencing (NGS) เพื่อระบุโมเลกุลทางชีวภาพกระบวนการ และมีส่วนร่วมในการตอบสนองการเปลี่ยนแปลงของสิ่งแวดล้อม การทดสอบเบื้องต้นเปิดเผยว่า น้ำทะเล (SW) -อุณหภูมิต่ำกว่าน้ำจืด (FW) ในเหมือนเขามั้ยวะปลานวลจันทร์ทะเลยอมรับ - เหมือนเขามั้ยวะกลุ่ม แม้ว่าปลานวลจันทร์ทะเล FW - และ SW-เหมือนเขามั้ยวะมีแตกต่างกันของค่าเผื่อสำหรับความเครียด hypothermal วันที่ พื้นฐานทางสรีรวิทยาโมเลกุลของความแตกต่างนี้ได้ไม่ถูกปากมดลูก ที่นี่ เราทำการวิเคราะห์ลำดับยุคของ mRNAs จากสี่กลุ่มของปลานวลจันทร์ทะเล เรารับ 29669 unigenes มีความยาวเฉลี่ยประมาณ 1936 ฐานคู่ ดำเนินการวิเคราะห์ยีนภววิทยา (GO) หลังจากอธิบายยีน มีระบุยีนสำหรับควบคุมโมเลกุลจำนวนมากผ่านการเปรียบเทียบ transcriptomic ในการวิเคราะห์ KEGG เกี่ยวข้องในความอดทน hypothermal เช่น glycolysis เผาผลาญกรดไขมัน กรดอะมิโนแคแทบอลิซึม และ ฟฟอสโฟรี ทางเดินเผาผลาญพื้นฐานมาวิเคราะห์โดยใช้ซอฟต์แวร์ PathVisio และ Cytoscape ผลลัพธ์ของเราระบุว่า ในการตอบสนองความเครียด hypothermal ยีนสำหรับฟฟอสโฟ เช่น พร่อง succinate ได้สูงขึ้นควบคุมใน SW กว่าปลา FW นอกจากนี้ SW และ FWmilkfish ใช้กลยุทธ์ที่แตกต่างกันเมื่อเผชิญกับความเครียด hypotherma: SW ปลานวลจันทร์ทะเลขึ้นควบคุมฟฟอสโฟและยีนแคแทบอลิซึมในการผลิตงบประมาณพลังงาน ในขณะที่ FWmilkfish ลงควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญ basal เพื่อลดพลังงานที่สูญเสีย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ที่นี่เราใช้อัตราความเร็วสูงรุ่นต่อไปลำดับ (NGS) การระบุกระบวนการทางชีวภาพโมเลกุลและการมีส่วนร่วมในการตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงด้านสิ่งแวดล้อม การทดสอบเบื้องต้นเปิดเผยว่าน้ำทะเล (SW) ปลานวลจันทร์ทะเล -acclimated ทนอุณหภูมิต่ำกว่าน้ำจืด (FW) กลุ่ม -acclimated แม้ว่า FW- และปลานวลจันทร์ทะเล SW-acclimated มีระดับที่แตกต่างกันของความอดทนสำหรับความเครียด hypothermal, วันที่, พื้นฐานทางสรีรวิทยาโมเลกุลของความแตกต่างนี้ไม่ได้รับการอธิบาย ที่นี่เราจะดำเนินการวิเคราะห์ลำดับรุ่นต่อไปของ mRNAs จากสี่กลุ่มที่ได้รับ milkfish.We 29669 unigenes มีความยาวเฉลี่ยประมาณ 1,936 ฐานคู่ ยีนอภิปรัชญา (ไป) การวิเคราะห์ได้รับการดำเนินการหลังจากคำอธิบายประกอบยีน จำนวนมากของยีนสำหรับการควบคุมโมเลกุลที่ถูกระบุผ่านการเปรียบเทียบ transcriptomic ในการวิเคราะห์ KEGG ฐานเผาผลาญเซลล์มีส่วนร่วมในความอดทน hypothermal เช่น glycolysis การเผาผลาญกรดไขมันกรดอะมิโนและ catabolism oxidative phosphorylation ถูกวิเคราะห์โดยใช้ PathVisio และ Cytoscape ซอฟแวร์ ผลของเราแสดงให้เห็นว่าในการตอบสนองต่อความเครียด hypothermal ยีนสำหรับ phosphorylation oxidative เช่น succinate dehydrogenase เป็นมากขึ้นสูงขึ้นควบคุมใน SW กว่าปลา FW นอกจากนี้ SW และ FWmilkfish ใช้กลยุทธ์ที่แตกต่างเมื่อสัมผัสกับความเครียด hypotherma: SW ปลานวลจันทร์ทะเลขึ้นควบคุม phosphorylation oxidative และยีน catabolism งบประมาณในการผลิตพลังงานมากขึ้นในขณะที่ FWmilkfish ควบคุมลงยีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญพื้นฐานเพื่อลดการสูญเสียพลังงาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่นี่เราใช้ลำดับ throughput สูงรุ่นใหม่ ( ภาพหลุด ) เพื่อระบุกระบวนการโมเลกุลทางชีววิทยา และมีส่วนร่วมในการตอบสนองต่อ การเปลี่ยนแปลงของสิ่งแวดล้อม การทดสอบเบื้องต้นพบว่าน้ำทะเล ( SW ) - ทนอุณหภูมิต่ำกว่า 720 ปลานวลจันทร์ทะเลน้ำจืด ( FW ) - ชินกรุ๊ป แต่ FW และ SW ให้ความสุขได้ระดับที่แตกต่างกันของความอดทนต่อความเครียด hypothermal วันที่พื้นฐานทางสรีรวิทยาระดับโมเลกุลของความแตกต่างนี้ยังไม่ได้ทำการ . ที่นี่เราได้ทำการวิเคราะห์ลำดับรุ่นของรหัสจากสี่กลุ่มของความสุข เราได้รับ 29669 unigenes มีความยาวโดยเฉลี่ยประมาณ 2479 ฐานคู่ ยีนอภิปรัชญา ( ไป ) การวิเคราะห์หลังจากที่ยีนหมายเหตุ . ตัวเลขขนาดใหญ่ของยีนควบคุมโมเลกุลถูกระบุผ่าน transcriptomic เปรียบเทียบการวิเคราะห์ KEGG เป็นต้น แรกเริ่มการเผาผลาญเซลล์ที่เกี่ยวข้องในความอดทน hypothermal เช่นไกลโคไลซิส กรดไขมันทำให้กระบวนการสลายกรดอะมิโนและออกซิเดทีฟฟอสโฟรีเลชัน คือ วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ pathvisio และซอฟต์แวร์ cytoscape . ผลของเราระบุว่าในการตอบสนองต่อความเครียดจากออกซิเดทีฟฟอสโฟรีเลชัน hypothermal , เช่น ซัคซิเนท ดีไฮโดรจีเนส มีคา SW กว่า FW ปลา นอกจากนี้ fwmilkfish SW ใช้กลยุทธ์ต่าง ๆ และเมื่อสัมผัสกับ hypotherma ความเครียด : SW ปลานวลจันทร์ทะเลสามารถตัวละครชาวออสเตรเลียกระบวนการสลายยีนเพื่อผลิตพลังงานมากขึ้นและงบประมาณ ในขณะที่ fwmilkfish ลงควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญอาหารพื้นฐาน เพื่อลดการสูญเสียพลังงาน