Ten ng of genomic Herbaspirillum DN

Ten ng of genomic Herbaspirillum DNA were submitted
to random amplification using the Ready.To.GoTM
RAPD Analysis Beads Kit (Amersham Biosciences) according
to the manufacturer’s instructions. Six different
primers, previously described for characterization of bacterial
strains (Amersham Biosciences), were used in the
RAPD reactions (Table 1). The electrophoretic profiles
were scored according to the presence (1) or absence (0) of
a particular band, generating a binary matrix. Similarity of
all pair-wise combinations of the numerical profiles was
determined by Dice’s coefficient (Dice, 1945) and clustered
by unweighted pair-group analysis using arithmetical
averages (UPGMA) (Sokal and Michener, 1958). A
dendrogram was constructed from the patterns, using the
NTSYS pc 2.0 program (Exeter Software - scientific software
for teaching and research - http://www.
exetersoftware.com/index.html). All samples and a negative
control without DNA were run in parallel in the same
thermocycler. At least three independently amplified fragment
patterns of each sample were obtained to confirm the
result.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ฉบับที่สิบของดีเอ็นเอ Herbaspirillum ออกส่งมาการใช้ Ready.To.GoTM ตัวแปรสุ่มตามชุดประคำการวิเคราะห์ RAPD (Amersham ออก)ให้คำแนะนำของผู้ผลิต หกที่แตกต่างกันไพรเมอร์ อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ สำหรับลักษณะของแบคทีเรียสายพันธุ์ (ออก Amersham), ใช้ในการRAPD ปฏิกิริยา (ตาราง 1) โปรไฟล์ของ electrophoreticมีการทำประตูตามมี (1) หรือไม่ (0)โดยเฉพาะอย่างยิ่งวงดนตรี สร้างเมทริกซ์ฐานสอง ความคล้ายคลึงกันของแก้ไขทั้งหมด pair-wise ชุดของส่วนกำหนดค่าตัวเลขโดยค่าสัมประสิทธิ์ของเต๋า (เต๋า 1945) และคลัสเตอร์โดยวิเคราะห์คู่กลุ่ม unweighted arithmeticalค่าเฉลี่ย (UPGMA) (Sokal และ Michener, 1958) Adendrogram สร้างขึ้นจากรูปแบบ การใช้โปรแกรม NTSYS pc 2.0 (เอ็กเซเตอร์ซอฟต์แวร์ - ซอฟต์แวร์วิทยาศาสตร์สำหรับการเรียนการสอนและการวิจัย - http://wwwexetersoftware.com/index.html). ตัวอย่างทั้งหมดและในแง่ลบควบคุม โดยดีเอ็นเอถูกเรียกใช้พร้อมกันในที่เดียวกันthermocycler อย่างน้อยสามอย่างอิสระขยายส่วนรูปแบบของแต่ละอย่างได้รับการยืนยันการผลการค้นหา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สิบ NG ของจีโนม HERBASPIRILLUM ดีเอ็นเอถูกส่ง
ไปยังเครื่องขยายเสียงแบบสุ่มโดยใช้ Ready.To.GoTM
RAPD วิเคราะห์ลูกปัด Kit (Amersham ชีววิทยาศาสตร์) ตาม
คำแนะนำของผู้ผลิต ที่แตกต่างกันหก
ไพรเมอร์อธิบายก่อนหน้านี้สำหรับลักษณะของแบคทีเรีย
สายพันธุ์ (Amersham ชีววิทยาศาสตร์) ถูกนำมาใช้ใน
ปฏิกิริยา RAPD (ตารางที่ 1) โปรไฟล์ electrophoretic
ถูกยิงตามที่ปรากฏตัว (1) หรือไม่มี (0) ของ
วงดนตรีโดยเฉพาะอย่างยิ่งการสร้างเมทริกซ์ไบนารี ความคล้ายคลึงกันของ
ทุกชุดคู่ที่ชาญฉลาดของโปรไฟล์ตัวเลขถูก
กำหนดโดยค่าสัมประสิทธิ์ของลูกเต๋า (ลูกเต๋า, 1945) และคลัสเตอร์
โดยการวิเคราะห์คู่กลุ่มชั่งโดยใช้การคำนวณ
ค่าเฉลี่ย (UPGMA) (Sokal และมิเชเนอร์, 1958)
dendrogram ถูกสร้างขึ้นมาจากรูปแบบการใช้
NTSYS PC โปรแกรม 2.0 (ซอฟท์แวเอ็กซีเตอร์ - ซอฟต์แวร์ทางวิทยาศาสตร์
สำหรับการเรียนการสอนและการวิจัย - http:. // www
exetersoftware.com/index.html) ตัวอย่างทั้งหมดและลบ
การควบคุมโดยไม่ต้องดีเอ็นเอวิ่งในแบบคู่ขนานในเดียวกัน
thermocycler อย่างน้อยสามขยายอิสระชิ้นส่วน
รูปแบบของแต่ละกลุ่มตัวอย่างที่ได้รับการยืนยันการ
ผล

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

10 ng ของจีโนมดีเอ็นเอ เพื่อ herbaspirillumเพื่อเพิ่มปริมาณการใช้ ready.to.gotm สุ่มชุดลูกปัดการวิเคราะห์ RAPD ( ชาม Biosciences ) ตามคำแนะนำของผู้ผลิต หกที่แตกต่างกันไพรเมอร์ก่อน อธิบายลักษณะของแบคทีเรียสายพันธุ์ ( ที่ใช้ในชีววิทยา )ปฏิกิริยา RAPD ( ตารางที่ 1 ) โพรไฟล์รูปแบบมีคะแนนตาม ( 1 ) หรือขาด ( 0 )วงดนตรี โดยเฉพาะการสร้างเมทริกซ์แบบไบนารี ความคล้ายคลึงกันของทุกคู่ปัญญาชุดของตัวเลขเป็นโปรไฟล์พิจารณาจากค่าสัมประสิทธิ์ ( ลูกเต๋าลูกเต๋า , 1945 ) และจับกลุ่มโดยการวิเคราะห์กลุ่มคู่ถ่วงน้ำหนักโดยใช้คณิตศาสตร์ค่าเฉลี่ย ( UPGMA ) ( Sokal และมิชเนอร์ , 1958 ) เป็นเดนโดรแกรมที่ถูกสร้างขึ้นจากรูปแบบการใช้2.0 โปรแกรม NTSYS pc ซอฟต์แวร์ ( ซอฟต์แวร์ เอ็กเซเตอร์ - วิทยาศาสตร์สำหรับการเรียนการสอนและการวิจัย - http : / / www .exetersoftware . com / index . html ) ตัวอย่างทั้งหมด และลบการควบคุมโดยดีเอ็นเอถูกวิ่งขนาน เหมือนเดิมเทอร์มอไซเคล ์ . อย่างน้อยสามอิสระ amplified fragmentรูปแบบของแต่ละตัวอย่างที่ได้รับการยืนยันผลที่ได้