PsRobot and psRNAtarget server were

PsRobot and psRNAtarget server were used to predict the potential and known targets of miRNAs, and the functions of the miRNA targets were annotated using Blast2go v1.3.3 and KOBAS 2.0. Blast2go uses local or remote BLAST searches to find sequences similar to one or several input sequences. Uniprot KB accessions were used to extract GO terms for further functional annotation. Blast2go was also used to perform basic statistics on the GO annotations, as reported by Botton et al. (2008) and Galla et al. (2009). The program extracts the GO terms associated with each of the obtained hits and returns an evaluated GO annotation for the query sequence. Enzyme codes are obtained by mapping from equivalent GOs, whereas InterPro motifs are directly queried at the InterProScan web service. GO annotation can be visualized by reconstructing the structure of the GO relationships, and enzyme codes (ECs) are highlighted on KEGG maps.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เซิร์ฟเวอร์ PsRobot และ psRNAtarget ใช้ในการคาดการณ์เป้าหมายที่มีศักยภาพ และเป็นที่รู้จักของ miRNAs และฟังก์ชั่นของเป้าหมายเที่ยวถูกประกอบใช้ Blast2go v1.3.3 และ KOBAS 2.0 Blast2go ใช้การค้นหาระเบิดระยะ ไกลเพื่อค้นหาลำดับที่คล้ายกับหนึ่ง หรือหลายอินพุตลำดับ Uniprot KB accessions ถูกใช้ในการแยกเงื่อนไขไปทำงานคำอธิบายประกอบเพิ่มเติม Blast2go ยังใช้ทำสถิติพื้นฐานบนข้อมูลกำกับไป โดยปุ่ม et al. (2008) และ Galla et al. (2009) โปรแกรมแยกเงื่อนไขไปที่เกี่ยวข้องกับแต่ละของปริมาณได้รับ และส่งกลับข้อมูลกำกับไปประเมินสำหรับลำดับการสอบถาม รหัสเอนไซม์ได้รับ โดยการแมปจาก GOs เทียบเท่า ในขณะที่ InterPro ลายจะสอบถามโดยตรงที่ InterProScan บริการเว็บ ไปที่สามารถจะแสดงเป็นภาพประกอบ โดยฟื้นฟูโครงสร้างของความสัมพันธ์ไป รหัสเอนไซม์ (ECs) จะถูกเน้นบน KEGG แผนที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

PsRobot และเซิร์ฟเวอร์ psRNAtarget ถูกนำมาใช้ในการทำนายเป้าหมายที่มีศักยภาพและเป็นที่รู้จักของ miRNAs และฟังก์ชั่นของเป้าหมาย miRNA ถูกอธิบายโดยใช้ v1.3.3 Blast2go และ Kobas 2.0 Blast2go ใช้ท้องถิ่นหรือระเบิดระยะไกลการค้นหาเพื่อหาลำดับคล้ายกับหนึ่งหรือหลายลำดับการป้อนข้อมูล สาย Uniprot KB ที่ถูกนำมาใช้ในการสกัดแง่ไปสำหรับคำอธิบายประกอบการทำงานต่อไป Blast2go ยังถูกนำมาใช้ในการดำเนินการสถิติพื้นฐานในคำอธิบายประกอบไปรายงานโดย Botton, et al (2008) และเกลล่า, et al (2009) โปรแกรมสารสกัดจากแง่ GO ที่เกี่ยวข้องกับแต่ละของความนิยมที่ได้รับและส่งกลับไปอธิบายประกอบการประเมินลำดับแบบสอบถาม รหัสเอนไซม์ที่ได้จากการทำแผนที่จากเทียบเท่า GOS ขณะที่ลวดลาย InterPro จะมีการสอบถามโดยตรงได้ที่บริการเว็บ InterProScan คำอธิบายประกอบ GO สามารถมองเห็นโดยการฟื้นฟูโครงสร้างของความสัมพันธ์ระหว่างการเดินทางและเอนไซม์รหัส (ECS) เป็นไฮไลต์บนแผนที่ KEGG

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

psrobot psrnatarget เซิร์ฟเวอร์และใช้ทำนายศักยภาพ และรู้จักเป้าหมายของ mirnas และการทำงานของ mirna เป้าหมายคือการบันทึกย่อและ blast2go v1.3.3 kobas 2.0 blast2go ใช้ในท้องถิ่นหรือระยะไกลระเบิดค้นหาลำดับคล้ายกับหนึ่งหรือหลายลำดับการป้อนข้อมูล บางครั้ง ตัวอย่าง uniprot นำมาสกัดไปข้อตกลงสำหรับการจัดการต่อไปตามหน้าที่ blast2go ถูกใช้เพื่อแสดงสถิติพื้นฐานบนไปการจัดการ รายงานโดย Botton et al . ( 2008 ) และ กัลลา et al . ( 2009 ) โปรแกรมแยกไปคำที่เกี่ยวข้องกับแต่ละที่ฮิตและผลตอบแทนการประเมินไปบันทึกย่อสำหรับการลำดับ รหัสเอนไซม์ที่ได้จากแผนที่จากรัฐเทียบเท่าในขณะที่ InterPro ลวดลายโดยตรงสอบถามที่ interproscan เว็บบริการ ไปหมายเหตุสามารถมองเห็นโดยการสร้างโครงสร้างของไป ความสัมพันธ์ และรหัสเอนไซม์ ( ECS ) จะถูกเน้นบนแผนที่ KEGG เป็นต้น