To investigate the change in transc

To investigate the change in transcriptional profiles of 336gr-1 derivatives (especially, LSUPB145) between solid and liquid cultures, RNA-seq was again performed. The transcriptomes of bacterial cultures of LSUPB145 grown on solid and in liquid media were compared. The differentially expressed genes were selected. Strikingly, many genes from this selection were also previously identified as potential QS-dependent genes. These genes encode proteins including ferredoxin, ABC transporter component, UspA domain containing protein, FAD/FMN-binding oxidoreductase, AraC regulator, RebAB proteins, thioesterase super family protein, (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase and LuxR type autoinducer-binding regulator. Therefore, it is possible that some other alternative regulator can perform similar global regulatory functions as AHL QS in B. glumae.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในโพรไฟล์ transcriptional อนุพันธ์ 336gr-1 (โดยเฉพาะอย่างยิ่ง LSUPB145) ระหว่างวัฒนธรรมที่เป็นของแข็ง และของเหลว อาร์เอ็นเอลำดับอีกทำ Transcriptomes วัฒนธรรมแบคทีเรียของ LSUPB145 โตของแข็ง และของเหลวสื่อถูกเปรียบเทียบ ยีน differentially แสดงได้เลือก กว่า ยีนหลายตัวเลือกนี้ยังถูกระบุก่อนหน้านี้เป็น QS-ขึ้นอยู่กับยีนที่อาจเกิดขึ้น ยีนเหล่านี้เข้ารหัสโปรตีนรวมถึง ferredoxin, ABC ขนส่งส่วนประกอบ ประกอบด้วยโปรตีน oxidoreductase บูรณะ FMN-ผูก ควบคุม AraC, RebAB โปรตีน โปรตีนครอบครัวซุปเปอร์ thioesterase, (3R) โด UspA dehydratase - hydroxymyristoyl - ACP และ LuxR ชนิด autoinducer ผูกเครื่องปรับลม จึง มันเป็นไปได้ว่า ควบคุมอื่น ๆ ที่อื่นสามารถทำหน้าที่คล้ายกันส่วนกลางกำกับดูแลเป็น AHL QS ใน glumae เกิด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในรูปแบบการถอดรหัสของสัญญาซื้อขายล่วงหน้า 336gr-1 (โดยเฉพาะอย่างยิ่ง LSUPB145) ระหว่างวัฒนธรรมของแข็งและของเหลว, RNA-seq ได้ดำเนินการอีกครั้ง ทรานของวัฒนธรรมของแบคทีเรีย LSUPB145 ปลูกบนที่เป็นของแข็งและของเหลวในสื่อมาเปรียบเทียบ ยีนที่แสดงออกแตกต่างกันได้รับการคัดเลือก เปี๊ยยีนจำนวนมากจากการเลือกนี้ยังระบุก่อนหน้านี้เป็นยีนที่มีศักยภาพขึ้นอยู่กับคำพูดคำจา ยีนเหล่านี้รวมถึงการเข้ารหัสโปรตีน ferredoxin ส่วนประกอบขนส่ง ABC, USPA โดเมนที่มีโปรตีน FAD / oxidoreductase FMN ผูกพันควบคุม Arac โปรตีนรือบับ, thioesterase โปรตีนครอบครัวซุปเปอร์ (3R) dehydratase -hydroxymyristoyl-ACP และประเภท LuxR ควบคุม autoinducer ผูกพัน ดังนั้นจึงเป็นไปได้ว่าบางควบคุมทางเลือกอื่น ๆ สามารถทำหน้าที่กำกับดูแลระดับโลกเช่นเดียวกับอาห์ในคำพูดคำจาบี glumae

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อศึกษาการเปลี่ยนแปลงใน particle โปรไฟล์ของอนุพันธ์ 336gr-1 ( โดยเฉพาะอย่างยิ่ง lsupb145 ) ระหว่างของแข็งและของเหลววัฒนธรรม RNA seq เป็นอีกครั้งที่แสดง การ transcriptomes ของวัฒนธรรมของเชื้อแบคทีเรีย lsupb145 ปลูกในที่เป็นของแข็งและในอาหารเหลวถูกเปรียบเทียบ ที่แสดงออกแตกต่างกันยีนที่ถูกเลือก มาก ,ยีนมากมายจากการเลือกครั้งนี้ยังระบุก่อนหน้านี้เป็น QS ศักยภาพขึ้นอยู่กับยีน ยีนเหล่านี้รวมถึงการเข้ารหัสโปรตีน ferredoxin ส่วนประกอบลำเลียง ABC , uspa โดเมนที่มีโปรตีน , แฟชั่น / fmn ผูกอ ซิโดรีดักเทส เครื่องปรับลม arac ปรัศนี โปรตีน thioesterase Super ครอบครัวโปรตีน ( 3R ) - การ hydroxymyristoyl ACP และ autoinducer ผูก luxr ชนิดควบคุม ดังนั้นมันเป็นไปได้ว่าบางส่วนอื่น ๆทางเลือก ควบคุมสามารถดำเนินการฟังก์ชั่นที่คล้ายกันทั่วโลกกฎระเบียบอาห์ QS ในพ. glumae .