Differentially expressed proteinsId

Differentially expressed proteins
Identification of differentially expressed proteins was carried out as reported in . In order to identify differences specifically caused by a certain growth rate, proteins expressed in batch culture and retentostats were compared to each other for a specific substrate condition (acetate or acetate plus benzoate) via one-way ANOVA with subsequent application of the t-test. False discovery rates (FDR) were calculated as described in . Two technical replicates were taken from the retentostat experiments. In order to gain sufficient power to recognize differentially abundant pro-teins, the randomization of the protein abundances was applied 100 times within each technical sample and not between the con-ditions. The FDR threshold was set to 2%.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Differentially แสดงโปรตีนมีดำเนินการระบุของโปรตีน differentially แสดงออกตามที่รายงานใน เพื่อระบุความแตกต่างโดยเฉพาะเกิดจากอัตราการเจริญเติบโตบาง โปรตีนแสดงในชุดวัฒนธรรม และ retentostats ได้เปรียบเทียบกันสำหรับเงื่อนไขที่เฉพาะพื้นผิว (อะซิเตท หรืออะซิเตท และ benzoate) ผ่านทางเดียว ANOVA กับประยุกต์ใช้การทดสอบ t ราคาพิเศษค้นหาเท็จ (FDR) ได้คำนวณตามที่อธิบายไว้ใน เหมือนกับเทคนิคที่สองที่ถ่ายจากการทดลองที่ retentostat เพื่อให้ได้พลังงานเพียงพอให้รู้จักโปมากมาย differentially-teins บายของร้านโปรตีนถูกใช้ 100 ครั้งภาย ในแต่ละอย่างทางเทคนิค และไม่ ระหว่างคอน-ditions ด้วยขีดจำกัดถูกตั้งค่าให้ 2%

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แสดงความแตกต่างกันโปรตีน
บัตรประจำตัวของโปรตีนที่แสดงความแตกต่างกันได้ดำเนินการในขณะที่รายงาน เพื่อที่จะระบุความแตกต่างที่เกิดขึ้นโดยเฉพาะอัตราการเจริญเติบโตบางโปรตีนแสดงในวัฒนธรรมชุดและ retentostats ถูกเมื่อเทียบกับแต่ละอื่น ๆ สำหรับสภาพพื้นผิวที่เฉพาะเจาะจง (อะซิเตทหรืออะซิเตทบวกเบนโซเอต) ผ่านทางเดียว ANOVA พร้อมกับใบสมัครตามมาของ t-test . อัตราการค้นพบเท็จ (FDR) จะถูกคำนวณตามที่อธิบายไว้ใน สองซ้ำทางเทคนิคถูกนำมาจากการทดลอง retentostat เพื่อที่จะได้มาซึ่งอำนาจเพียงพอที่จะรับรู้ที่แตกต่างกันมากมายโปร teins สุ่มของปริมาณโปรตีนที่ถูกนำมาใช้ 100 ครั้งในแต่ละตัวอย่างเทคนิคและไม่ได้ระหว่าง Con-สภาวะแวดล้อม เกณฑ์ FDR ถูกกำหนดให้ 2%

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มีโปรตีนต่างกันการจำแนกชนิดของโปรตีนที่แสดงออกแตกต่างกันมีการรายงานใน เพื่อระบุความแตกต่างเฉพาะเกิดจากอัตราการเจริญเติบโตบาง โปรตีนที่แสดงออกในวัฒนธรรม retentostats Batch และเปรียบเทียบกับแต่ละอื่น ๆสำหรับเงื่อนไขที่เฉพาะเจาะจง ( อะซิเตต ( หรือบวก benzoate ) ผ่านการวิเคราะห์ความแปรปรวนด้วยโปรแกรมการฝึก อัตราการค้นพบเท็จ ( FDR ) ได้อธิบายไว้ใน 2 เทคนิคได้แก่ นำมาจาก retentostat การทดลอง เพื่อให้ได้พลังงานเพียงพอที่จะรับรู้ต่างกันมากมาย โปร teins , ชุดของโปรตีน abundances จำนวน 100 ครั้งภายในแต่ละเทคนิคตัวอย่างและไม่ระหว่าง ditions con . เอฟดีอาร์เริ่มตั้ง 2 %