Two PhD positions available at the

Two PhD positions available at the Molecular Plant Pathology group at the University of Amsterdam.
13 ต.ค. 2015259 ผู้เข้าชม18 คนที่ชอบ5 ความคิดเห็นแบ่งปันบน LinkedInแบ่งปันบน Facebookแบ่งปันบน Twitter
BestPass: Boosting plant-endophyte stability, compatibility and performance across scales

We need to increase the crop yield while reducing pesticide and use of inorganic fertiliser to meet the challenges of world population growth and climate change. Plant endophytic microorganisms can improve plant yield and enhance plant tolerance to abiotic stress as well as to pathogens under experimental conditions, but these effects are often not sufficiently stable for practical application.

How do we boost the stability and reliability of the positive effects of endophytes on plants?

We need to understand the genetic basis of beneficial interactions between crops and endophytes and extent this basis exhibits phenotypic plasticity at all interaction levels from the cellular to the field environment. This requires increasing our knowledge of the molecular mechanisms underlying the effects of endophytes, including intra and inter-kingdom exchange and distribution of resources (nutrients), signalling and possibly regulation between and inside the partners, the mutual induced production of secondary metabolites and the environmental cues which influence crop-endophyte interactions. The genetic variation and its plasticity in host and microbe will be exploited in to establish crop breeding and inoculum production processes for boosting the establishment and stability of plant-microbe mutualisms to benefit crop development, stress tolerance, pathogen resistance and quality.

In BestPass we will provide fundamental biological as well as practical knowledge about interactions between endophytes and plants. This improved understanding will pave the way for increased use of endophytes to improve sustainability and plant productivity in a reliable way.

BestPass is an International Training Network (ITN) funding by the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Skłodowska-Curie grant agreement No. 676480.

Project 1: How do endophytes evade host resistance while enhancing immunity?

Objectives:
Determine the resistance spectrum of endophyte colonised tomato plants and determine the changes in their transcriptome and xylem sap proteome in one, two and tri-fold interactions
Identify key genes/proteins correlated with endophyte colonization and enhanced biotic resistance and functionally characterize these genes.
Principal supervisor: Dr F.L.W. Takken, Molecular Plant Pathology, Swammerdam Institute for Life Sciences, University of Amsterdam, [e-mail], [phone]

http://www.uva.nl/over-de-uva/werken-bij-de-uva/vacatures/item/15-385_phd-candidate-in-molecular-plant-pathology-i.html

Project 2: How do endophytes differ from pathogens?

Objectives:

Identify the key genetic differences between endophytic and pathogenic forms of the fungus Fusarium oxysporum, with a particular focus on genes for small secreted proteins
Determine the influence of oxysporum strains with different endophytic and pathogenic capabilities on the physiology of tomato plants (phytohormones, metabolites, enzyme activities)
Principal supervisor: Dr Martijn Rep, Molecular Plant Pathology, Swammerdam Institute for Life Sciences, University of Amsterdam,

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สองปริญญาเอกตำแหน่งที่กลุ่มพยาธิวิทยาพืชโมเลกุลที่มหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม13 ต.ค. 2015259 ผู้เข้าชม18 คนที่ชอบ5 ความคิดเห็นแบ่งปันบน LinkedInแบ่งปันบน Facebookแบ่งปันบน TwitterBestPass: ส่งเสริมพืช endophyte เสถียรภาพ ความเข้ากันได้ และประสิทธิภาพในระดับเราจำเป็นต้องเพิ่มผลผลิตพืชลดสารพิษและการใช้ fertiliser นินทรีย์เพื่อตอบสนองความท้าทายของการเจริญเติบโตของประชากรโลกและการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ พืชจุลินทรีย์ endophytic สามารถเพิ่มผลผลิตพืช และปรับปรุงค่าเผื่อ abiotic ความเครียดเช่นเป็นโรคภายใต้เงื่อนไขทดลองพืช แต่ผลกระทบเหล่านี้มักจะไม่มั่นคงเพียงพอสำหรับการประยุกต์ในทางปฏิบัติ วิธีทำเราเพิ่มเสถียรภาพและความน่าเชื่อถือของผลบวกของ endophytes บนพืชหรือไม่เราต้องเข้าใจพื้นฐานทางพันธุกรรมของการโต้ตอบที่เป็นประโยชน์ระหว่างพืช endophytes และขอบเขต พื้นฐานนี้จัดแสดง plasticity ไทป์ทุกระดับโต้ตอบจากมือถือฟิลด์สภาพแวดล้อม ต้องเพิ่มความรู้ของเราของกลไกระดับโมเลกุลที่ต้นผล endophytes รวมทั้งภายในราชอาณาจักรระหว่างแลกเปลี่ยน และการกระจายทรัพยากร (สารอาหาร), แดง และอาจควบคุมระหว่าง และภาย ในหุ้นส่วน และเกิดจากผลิตของ metabolites รองและสัญลักษณ์สิ่งแวดล้อมที่มีอิทธิพลต่อพืช endophyte โต้ตอบ ความผันแปรทางพันธุกรรมและ plasticity ของโฮสต์และ microbe จะนำไปในการสร้างพันธุ์พืช และกระบวนการผลิตของ inoculum ในการก่อตั้งและความเสถียรของ mutualisms microbe พืชเพื่อประโยชน์ในการส่งเสริมพืชพัฒนา ยอมรับความเครียด ความต้านทานต่อการศึกษา และคุณภาพใน BestPass เราจะให้รู้พื้นฐานชีวภาพ ตลอดจนปฏิบัติเกี่ยวกับการโต้ตอบระหว่าง endophytes และพืช นี้ปรับปรุงความเข้าใจจะปูทางสำหรับการใช้ endophytes เพื่อปรับปรุงความยั่งยืน และพืชผลในทางความน่าเชื่อถือเพิ่มขึ้นBestPass เป็นการนานาชาติฝึกอบรมเครือข่าย (ITN) ทุนโดยสหภาพยุโรป 2020 ฮอไรซอนวิจัยและนวัตกรรมโครงการภายใต้การมารี Skłodowska-กูรีให้ข้อตกลงหมายเลข 676480โครงการที่ 1: วิธีทำ endophytes หนีความต้านทานของโฮสต์ในขณะที่เพิ่มภูมิคุ้มกันหรือไม่วัตถุประสงค์:พิจารณาสเปกตรัมความต้านทานของพืชมะเขือเทศ endophyte colonised และระบุการเปลี่ยนแปลงใน proteome การ sap transcriptome และ xylem ในหนึ่ง สอง และ พับตรีโต้ตอบระบุยีนโปรตีนสำคัญ correlated กับ endophyte สนาม และเพิ่มความต้านทานต่อ biotic และฟังก์ชันลักษณะของยีนเหล่านี้ ผู้ควบคุมหลัก: ดร. F.L.W. Takken โมเลกุลพืชพยาธิ Swammerdam สถาบันวิทยาศาสตร์สุขภาพมหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม [e-mail], [phone]http://www.uva.nl/over-de-uva/werken-bij-de-uva/vacatures/item/15-385_phd-candidate-in-molecular-plant-pathology-i.htmlโครงการที่ 2: วิธีทำ endophytes แตกต่างจากโรคหรือไม่วัตถุประสงค์:ระบุความแตกต่างทางพันธุกรรมสำคัญระหว่าง endophytic และ pathogenic ฟอร์มของการเชื้อรา Fusarium oxysporum โดยมุ่งเน้นเฉพาะยีนสำหรับโปรตีนขนาดเล็ก secretedตรวจสอบอิทธิพลของสายพันธุ์ oxysporum กับ endophytic และ pathogenic ความแตกต่างในสาขาสรีรวิทยาของพืชมะเขือเทศ (phytohormones, metabolites กิจกรรมของเอนไซม์) ผู้ควบคุมหลัก: ดร. Martijn ตัวแทน โมเลกุลพืชพยาธิ Swammerdam สถาบันวิทยาศาสตร์สุขภาพ มหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สองตำแหน่งระดับปริญญาเอกที่มีอยู่ในกลุ่มพืชโมเลกุลพยาธิวิทยาที่มหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม.
13 ต.ค. 2015259 ผู้เข้าชม 18 คนที่ชอบ 5 ความคิดเห็นแบ่งปันบน LinkedIn แบ่งปันบน Facebook แบ่งปันบนทวิตเตอร์
BestPass: การส่งเสริมความมั่นคงพืช endophyte เข้ากันได้และประสิทธิภาพการทำงานทั้งเครื่องชั่งน้ำหนักเราจำเป็นต้องเพิ่มผลผลิตพืชในขณะที่ลดสารกำจัดศัตรูพืชและการใช้ปุ๋ยอนินทรีที่จะตอบสนองความท้าทายของการเติบโตของประชากรโลกและการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ จุลินทรีย์พืชเอนโดไฟท์สามารถเพิ่มผลผลิตของพืชและเพิ่มความทนทานต่อพืชเพื่อความเครียด abiotic เช่นเดียวกับเชื้อโรคที่อยู่ภายใต้เงื่อนไขการทดลอง แต่ผลกระทบเหล่านี้มักจะไม่เพียงพอที่มั่นคงสำหรับการประยุกต์ใช้จริง. จะทำอย่างไรที่เราจะเพิ่มความมั่นคงและความน่าเชื่อถือของผลกระทบในเชิงบวกของ endophytes บน พืชได้หรือไม่เราต้องเข้าใจพื้นฐานทางพันธุกรรมของการสื่อสารที่เป็นประโยชน์ระหว่างพืชและendophytes และขอบเขตการจัดแสดงนิทรรศการนี้พื้นฐานปั้นฟีโนไทป์ในทุกระดับการทำงานร่วมกันจากโทรศัพท์มือถือไปยังสภาพแวดล้อมสนาม นี้ต้องเพิ่มความรู้ของเราของกลไกระดับโมเลกุลพื้นฐานผลกระทบของ endophytes รวมทั้งภายในและการแลกเปลี่ยนระหว่างราชอาณาจักรและการกระจายของทรัพยากร (สารอาหาร), การส่งสัญญาณและอาจระเบียบระหว่างและภายในคู่ค้าการผลิตการเหนี่ยวนำร่วมกันของสารทุติยภูมิและสิ่งแวดล้อม ความหมายที่มีอิทธิพลต่อการมีปฏิสัมพันธ์พืช endophyte การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมและการปั้นในโฮสต์และจุลินทรีย์จะใช้ประโยชน์ในการสร้างพันธุ์พืชและกระบวนการผลิตหัวเชื้อสำหรับการส่งเสริมการจัดตั้งและความมั่นคงของ mutualisms พืชจุลินทรีย์จะได้รับประโยชน์ในการพัฒนาพืช, ความทนทานต่อความเครียดความต้านทานเชื้อโรคและคุณภาพ. ใน BestPass เราจะ ให้พื้นฐานทางชีวภาพเช่นเดียวกับความรู้ทางปฏิบัติเกี่ยวกับการโต้ตอบระหว่าง endophytes และพืช นี้ความเข้าใจที่ดีขึ้นจะปูทางสำหรับการใช้งานที่เพิ่มขึ้นของ endophytes ในการปรับปรุงพัฒนาอย่างยั่งยืนและการผลิตที่โรงงานในวิธีที่เชื่อถือได้. BestPass เป็นเครือข่ายการฝึกอบรมระหว่างประเทศ (ไอที) เงินทุนโดยฮอไรซอนของสหภาพยุโรป 2020 การวิจัยและโปรแกรมนวัตกรรมภายใต้ทุนมารี Sklodowska-Curie ข้อตกลงฉบับ 676480. โครงการที่ 1: ทำ endophytes หลบเลี่ยงต้านทานโฮสต์วิธีการเสริมสร้างภูมิคุ้มกันในขณะที่? วัตถุประสงค์: ตรวจสอบคลื่นความถี่ความต้านทานของ endophyte อาณานิคมมะเขือเทศและตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในยีนและโปรตีนนม xylem ของพวกเขาในหนึ่งสองและการมีปฏิสัมพันธ์ไตรพับระบุยีนที่สำคัญ / โปรตีนมีความสัมพันธ์กับการล่าอาณานิคม endophyte และเพิ่มความต้านทานต่อสิ่งมีชีวิตและการทำงานลักษณะยีนเหล่านี้. ผู้บังคับบัญชาเงินต้น: ดร FLW Takken โมเลกุลโรคพืช Swammerdam สถาบันวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิตมหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม [e-mail], 2: ไม่ endophytes แตกต่างจากเชื้อโรคได้อย่างไรวัตถุประสงค์: ระบุความแตกต่างทางพันธุกรรมที่สำคัญระหว่างเอนโดไฟท์และรูปแบบที่ทำให้เกิดโรคของเชื้อรา Fusarium oxysporum ที่มีความสำคัญโดยเฉพาะอย่างยิ่งในยีนของโปรตีนที่หลั่งขนาดเล็กตรวจสอบอิทธิพลของสายพันธุ์oxysporum กับเอนโดไฟท์ที่แตกต่างกันและความสามารถที่ทำให้เกิดโรคใน สรีรวิทยาของพืชมะเขือเทศ (phytohormones, สารเอนไซม์) ผู้บังคับบัญชาเงินต้น: ดร Martijn ตัวแทนโมเลกุลโรคพืช Swammerdam สถาบันวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิตมหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สองเอกตำแหน่งที่มีอยู่ในโมเลกุลโรคพืชกลุ่มที่มหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม .
13 ต . ค . 2015259 ผู้เข้าชม 18 คนที่ชอบ 5 ความคิดเห็นแบ่งปันบน LinkedIn Facebook Twitter แบ่งปันบนแบ่งปันบน
bestpass : ส่งเสริมเสถียรภาพ endophyte พืช , เข้ากันได้และประสิทธิภาพในระดับ

เราต้องเพิ่มผลผลิตในขณะที่ลดการใช้ปุ๋ยและสารอนินทรีย์เพื่อตอบสนองความท้าทายของการเติบโตของประชากรโลก และการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ ราเอนโดไฟต์ที่สามารถเพิ่มผลผลิตพืช จุลินทรีย์ พืช และเพิ่มความอดทนต่อความเครียดที่พืช ไร่ รวมทั้งเชื้อโรคภายใต้เงื่อนไขการทดลอง แต่ผลกระทบเหล่านี้มักจะไม่เพียงพอ มั่นคง

เพื่อการใช้งานแล้วเราจะเพิ่มเสถียรภาพและความน่าเชื่อถือของผลในเชิงบวกของ endophytes บนพืช

เราต้องเข้าใจพื้นฐานทางพันธุกรรมของปฏิสัมพันธ์ที่เป็นประโยชน์ระหว่างพืชและ endophytes และขอบเขตพื้นฐานนี้จัดแสดงฟีโนไทป์พลาสติกทุกระดับปฏิสัมพันธ์จากมือถือไปยังเขตข้อมูลสิ่งแวดล้อมนี้ต้องใช้ความรู้ของกลไกระดับโมเลกุล เป็นต้น ผลของ endophytes รวมทั้งภายในและระหว่างอาณาจักรตราและการกระจายของทรัพยากร ( รัง ) , สัญญาณและอาจจะเป็นระเบียบระหว่างและภายในพันธมิตร , ร่วมกันกระตุ้นการผลิตสาร secondary metabolites และสิ่งแวดล้อมที่มีอิทธิพลต่อการสื่อสาร endophyte ชี้นํา พืชความผันแปรทางพันธุกรรมและพลาสติกในโฮสต์และจุลินทรีย์จะใช้ประโยชน์ในการสร้างกระบวนการผลิตเชื้อพันธุ์พืชและเพื่อส่งเสริมการจัดตั้ง และเสถียรภาพของ mutualisms จุลินทรีย์พืชเพื่อประโยชน์ในการพัฒนาพืช ความทนทานต่อความเครียด ต่อต้านเชื้อโรค และคุณภาพ

ใน bestpass เราจะมีพื้นฐานทางชีวภาพ ตลอดจนความรู้เกี่ยวกับการปฏิสัมพันธ์ระหว่าง endophytes และพืช นี้การปรับปรุงความเข้าใจจะปูทางสำหรับการใช้ที่เพิ่มขึ้นของ endophytes ปรับปรุงความยั่งยืนและการผลิตพืชในวิธีที่เชื่อถือได้ .

bestpass เป็นการอบรมเครือข่ายระหว่างประเทศ ( ไอที ) โดยทุนของสหภาพยุโรปขอบฟ้า 2020 การวิจัยและหลักสูตรนวัตกรรมภายใต้ข้อตกลงมารีคูรี odowska SK łแกรนท์ไม่ 676480

โครงการ 1 : วิธีทำ endophytes หลบเลี่ยงต้านทานโฮสต์ในขณะที่เสริมสร้างภูมิคุ้มกัน ? วัตถุประสงค์ :

ตรวจสอบความต้านทานของสเปกตรัม endophyte อาณานิคมพืชมะเขือเทศ และศึกษาการเปลี่ยนแปลงของโปรตีนใน SAP และทราน ริปโตมไซเลม หนึ่ง สอง และสามพับปฏิสัมพันธ์
ระบุยีน / โปรตีน มีความสัมพันธ์กับคีย์ endophyte อาณานิคมและเพิ่มการต้านทานและการทำงานลักษณะยีนเหล่านี้ .
หัวหน้าหลัก : ดร f.l.w. takken พยาธิวิทยาพืชระดับโมเลกุลสถาบันชีววิทยาศาสตร์ swammerdam มหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม [e-mail] 3152057795 ,

http : / / www.uva . nl / เกี่ยวกับ UVA / Werken ใกล้กับ เดอ รังสี UVA / vacatures / รายการ / 15-385_phd-candidate-in-molecular-plant-pathology-i.html

โครงการ 2 : วิธีทำ endophytes แตกต่างจากเชื้อโรค ? วัตถุประสงค์ :



หาคีย์และรูปแบบความแตกต่างทางพันธุกรรมระหว่างราเชื้อโรคเชื้อรา Fusarium oxysporum ,ด้วยการมุ่งเน้นเฉพาะยีนขนาดเล็กหลั่งโปรตีน
ศึกษาอิทธิพลของสายพันธุ์และเชื้อรา เชื้อโรค ที่มีความสามารถแตกต่างกันในสรีรวิทยาพืชมะเขือเทศ ( กิจกรรมเอนไซม์ phytohormones , metabolites )
หัวหน้าหลัก : ดร martijn ตัวแทน , โรคพืชระดับโมเลกุล สถาบันชีววิทยาศาสตร์ swammerdam มหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัม