Most of the plants chosen to be sequenced to date fit specific criteria such as size of research community, model organisms or economically important, small genome size, ploidy (diploid), availability of inbred lines (low heterozygosity), access to genetic and physical maps, expressed sequence tags (EST)/transcriptome and other genomic tools. Seventy-three percent (40) of the plant genome publications have been on crop species and some of these crop species double as model systems while several were sequenced purely for research such as Arabidopsis thaliana, Arabidopsis lyrata, Brachypodium distachyon, Physcomitrella patens (moss), and Selaginella moellendorffii (spikemoss). Most (94%) genomes sequenced to date are Angiosperms, of which 36 are dicots and 16 are monocots, while only one gymnosperm (spruce), one bryophyte (moss), and one lycophyta (club-moss) have been sequenced (Table 1). Much of the early decisions about which genomes to sequence were driven by the Department of Energy Joint Genome Institute (JGI), which resulted in the publication and public availability (phytozome) of eleven of the highest quality
ส่วนใหญ่พืชที่เลือกจะเรียงลำดับวันที่เหมาะสมกับเงื่อนไขเฉพาะเช่นขนาดของชุมชนวิจัย แบบจำลองสิ่งมีชีวิต หรือ ขนาดจีโนมอย่างสำคัญ ขนาดเล็ก พล็อยดี (diploid), พร้อมใช้งานของบรรทัด inbred (ต่ำ heterozygosity), เข้าถึงแผนที่ทางพันธุกรรม และทางกายภาพ แสดงลำดับแท็ก (EST) / transcriptome และเครื่องมืออื่น ๆ genomic สามเจ็ดเปอร์เซ็นต์ (40) ของสื่อสิ่งพิมพ์กลุ่มพืชได้กับพืชชนิดเหล่านี้พืช และพันธุ์คู่เป็นระบบจำลองในขณะต่าง ๆ ถูกเรียงลำดับเหมาะสำหรับงานวิจัยเช่น Arabidopsis thaliana, Arabidopsis lyrata, Brachypodium distachyon, Physcomitrella ก้ามปูแดง (moss), และ Selaginella moellendorffii (spikemoss) Genomes (94%) มากที่สุดเรียงลำดับวัน Angiosperms, 36 ที่มี dicots และ 16 monocots ขณะเดียว gymnosperm ที่ (แค่), หนึ่ง bryophyte (มอ), และ lycophyta หนึ่ง (club-moss) มีการเรียงลำดับ (ตารางที่ 1) การตัดสินใจช่วงที่ genomes ลำดับถูกขับเคลื่อนโดยแผนกของพลังงานร่วมกลุ่มสถาบัน (JGI), ซึ่งมีผลในการเผยแพร่และ (phytozome) พร้อมใช้งานสาธารณะของคถูกคุณภาพ มาก
การแปล กรุณารอสักครู่..
ส่วนใหญ่ของพืชที่เลือกเป็นลำดับวันพอดีเฉพาะเกณฑ์ เช่น ขนาดของชุมชนการวิจัยสิ่งมีชีวิตรูปแบบหรือมีความสำคัญทางเศรษฐกิจ ขนาดจีโนมเล็ก พีเอชพี ( ซ้ำ ) , ความพร้อมของสายพันธุ์แท้ ( เฉพาะที่ต่ำ ) , การเข้าถึงแผนที่พันธุกรรมและทางกายภาพ , แสดงลำดับแท็ก ( EST ) / ทราน ริปโตมและอุปกรณ์อย่างอื่นเจ็ดสิบสามเปอร์เซ็นต์ ( 40 ) ของพืชพันธุกรรมสิ่งพิมพ์ได้รับพันธุ์พืชบางชนิดและพืชเหล่านี้สองเป็นแบบจำลองระบบในขณะที่หลายเป็นลำดับอย่างหมดจดเพื่อการวิจัยเช่น Arabidopsis thaliana Arabidopsis lyrata distachyon brachypodium , , , physcomitrella patens ( มอส ) และซอฟต์ moellendorffii ( spikemoss ) มากที่สุด ( ร้อยละ 94 ) จีโนมลำดับวันที่เป็นพืชดอก ,ที่ 36 จะเป็น 16 เป็นพืชใบเลี้ยงเดี่ยว ในขณะที่เพียงหนึ่งพืชเมล็ดเปลือย ( โก้ ) , ไบรโอไฟต์ ( มอส ) , และหนึ่งไลโคไฟตา ( คลับมอส ) มีลำดับ ( ตารางที่ 1 ) มากของการตัดสินใจก่อน ซึ่งจะลำดับจีโนมถูกขับเคลื่อน โดยกรมสถาบันจีโนมร่วมพลังงาน ( jgi ) ซึ่งมีผลในการตีพิมพ์และสาธารณะประโยชน์ ( phytozome ) สิบเอ็ดของ ที่มีคุณภาพสูงสุด
การแปล กรุณารอสักครู่..