Discoveries revealing the functiona

Discoveries revealing the functional diversity of natural RNAs reinforce the need to better understand the guiding principles associated with RNA structure and folding. The RNA-folding problem, much like the protein-folding problem, corresponds to challenges associated with predicting the particular structure that an individual RNA sequence will adopt. The RNA-folding problem is made unique by the fact that the initial collapse of an RNA molecule leads to the formation of a secondary structure resulting from the minimization of the nearest-neighbor stacking energies of base pairs (bps), mostly classic Watson–Crick (WC) and wobble bps. As a result, much progress has been made with regard to understanding and predicting the secondary structure that a particular RNA sequence will likely take (made evident by the various tools available to predict the secondary structure of an RNA).[1], [2] and [3] The tertiary structure of RNA, in contrast, is largely dictated by noncanonical bps,[4], [5] and [6] whereby noncanonical bps typically refer to nucleotide contacts occurring between the WC, Hoogsteen, or shallow groove (SG) edges of two nucleotides.7 Usually, these noncanonical bps enter into the composition of recurrent noncanonical tertiary hydrogen‐bonding patterns of greater complexity, also called RNA structural motifs. Large RNAs such as the ribosome contain an assortment of these recurrent structural elements or motifs[8], [9], [10], [11], [12], [13], [14], [15], [16], [17], [18] and [19] and meticulous investigation of their secondary and tertiary hydrogen‐bonding interactions has provided a great deal of information concerning the sequence space associated with these same motifs.[10], [11], [12] and [20] While it is clear that RNA motifs serve stable structural purposes, the fact that they are able to direct local folding pathways toward the formation of functional RNAs is still less recognized.[4] and [6] Most recent studies emphasize their key role in promoting higher-order stability and in specifying for the positioning and topological arrangements of helices to form bends or stacks.[21], [22], [23] and [24] In this light, the RNA-folding problem involves understanding how an RNA sequence (coding for structural RNA motifs) can direct the positioning of adjacent RNA helices with respect to one another. Furthermore, RNA structural motifs can be used to understand the evolutionary emergence of particular naturally occurring RNAs.[25] and [26]
.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ค้นพบเผยให้เห็นความหลากหลายหน้าที่ของ RNAs ธรรมชาติเสริมจำเป็นต้องเข้าใจหลักการแนวทางที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างของอาร์เอ็นเอและการพับ อาร์เอ็นเอพับปัญหา ปัญหา พับโปรตีนเหมือนสอดคล้องกับความท้าทายที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างเฉพาะที่ลำดับอาร์เอ็นเอแต่ละตัวจะนำมาใช้คาดการณ์ ปัญหาพับอาร์เอ็นเอจะทำเฉพาะความจริงที่ว่า อาศัยโมเลกุลเป็นอาร์เอ็นเอเริ่มต้นนำไปสู่การก่อตัวของโครงสร้างรองเป็นผลมาจากการลดของพลังงานซ้อนเพื่อนบ้านที่ใกล้ที่สุดของฐานคู่ (bps), ส่วนใหญ่คลาสสิกวัตสันคริก (สุขา) และกระเด้ง bps เป็นผล ความคืบหน้ามากได้ตามความเข้าใจ และคาดการณ์รองโครงสร้างที่มีแนวโน้มจะลำดับเฉพาะอาร์เอ็นเอ (ทำเห็นได้ชัด โดยจะทำนายโครงสร้างรองของอาร์เอ็นเอเป็นเครื่องมือต่าง ๆ)[1], [2] และ [3] ต่อโครงสร้างของอาร์เอ็นเอ คมชัด ส่วนใหญ่ได้ถูกควบคุม โดย noncanonical bps, [4], [5] และ [6] โดย noncanonical bps โดยทั่วไปหมายถึงติดต่อนิวคลีโอไทด์ที่เกิดขึ้นระหว่างสุขา Hoogsteen หรือ nucleotides.7 สองขอบร่องตื้น (SG) ปกติ bps noncanonical เหล่านี้ใส่ลงในส่วนประกอบของรูปแบบการเกิดซ้ำ hydrogen‐bonding ต่อ noncanonical ของความซับซ้อนมากขึ้น เรียกว่าโดดเด่นทางโครงสร้างของอาร์เอ็นเอ RNAs ใหญ่เช่นไรโบโซมประกอบด้วยการจัดประเภทขององค์ประกอบโครงสร้างที่เกิดซ้ำเหล่านี้โดดเด่น [8], [9], [10], [11], [12], [13], [14], [15], [16], [17], [18] และ [19] และตรวจสอบอย่างพิถีพิถันของการโต้ตอบรอง และต่อ hydrogen‐bonding ได้ให้ข้อมูลเกี่ยวกับพื้นที่ลำดับที่เกี่ยวข้องกับความเหล่านี้กันมากขึ้น[10], [11], [12] และ [20] ขณะที่ชัดเจนว่า ลงอาร์เอ็นเอใช้วัตถุประสงค์โครงสร้างมีเสถียรภาพ ความจริงที่ว่า พวกเขาจะสามารถตรงมนต์พับท้องถิ่นไปสู่การก่อตัวของ RNAs ทำงานยังน้อยรับรู้[4] และล่าสุด [6] การศึกษาเน้นบทบาทความสำคัญ ในการส่งเสริมความมั่นคงขั้นสูง และ ในการระบุการจัดวางตำแหน่ง และ topological ของ helices การจัดฟันแบบฟอร์มกอง[21], [22], [23] [24] ในไฟนี้ อาร์เอ็นเอพับปัญหาเกี่ยวข้องกับการเข้าใจวิธีการลำดับอาร์เอ็นเอ (รหัสสำหรับโครงสร้างอาร์เอ็นเอลง) สามารถโดยตรงตำแหน่งของ helices อาร์เอ็นเอติดกับกัน นอกจากนี้ ความโครงสร้างของอาร์เอ็นเอสามารถใช้เพื่อทำความเข้าใจการเกิดวิวัฒนาการของธรรมชาติเกิดขึ้น RNAs เฉพาะ[25] และ [26]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การค้นพบการเปิดเผยความหลากหลายหน้าที่ของ RNAs ธรรมชาติเสริมสร้างจำเป็นต้องเข้าใจหลักการที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้าง rna และพับ ยีนพับปัญหา เหมือนโปรตีนพับปัญหา สอดคล้องกับความท้าทายที่เกี่ยวข้องกับทำนายโครงสร้างเฉพาะที่เป็นลำดับยีนของแต่ละบุคคลจะอุปการะปัญหาคือทำให้ยีนพับกันโดยความจริงที่ว่ายุบเริ่มต้นของอาร์เอ็นเอโมเลกุล นำไปสู่การก่อตัวของโครงสร้างทุติยภูมิที่เกิดจากการเพื่อนบ้านที่ใกล้ที่สุดซ้อนพลังของคู่เบส ( 2007 ) , คลาสสิกมากกว่า วัตสันและคริก ( ห้องสุขา ) และส่ายไปส่ายมา 2007 ผลความคืบหน้ามากได้รับการทำเกี่ยวกับความเข้าใจและทำนายโครงสร้างทุติยภูมิที่ลำดับ RNA โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีแนวโน้มที่จะใช้ ( ให้ประจักษ์ โดยเครื่องมือต่างๆที่มีอยู่เพื่อทำนายโครงสร้างของอาร์เอ็นเอ ) . [ 1 ] , [ 2 ] และ [ 3 ] ตติยโครงสร้างของอาร์เอ็นเอ ในทางตรงข้าม คือไปบอกด้วย noncanonical bps , [ 4 ][ 5 ] [ 6 ] โดย noncanonical bps มักจะอ้างถึงเบสติดต่อที่เกิดขึ้นระหว่างสุขา hoogsteen หรือร่องตื้น ( SG ) ขอบสองขนาด 7 ปกติ หรือ noncanonical เหล่านี้เข้าไปในองค์ประกอบของการกลับเป็นซ้ำ noncanonical ‐ตติยรูปแบบของความซับซ้อนมากกว่าพันธะไฮโดรเจน ที่เรียกว่า motifs โครงสร้าง RNARNAs ขนาดใหญ่เช่นไรโบโซมประกอบด้วยการแบ่งประเภทของเหล่านี้ดำเนินการองค์ประกอบโครงสร้าง หรือลวดลาย [ 8 ] , [ 9 ] , [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] , [ 17 ] , [ 18 ] และ [ 19 ] และ สืบสวนพิถีพิถันของทุติยภูมิและตติย‐ปฏิกิริยาพันธะไฮโดรเจนได้จัดให้มีการจัดการที่ดีของข้อมูลเกี่ยวกับลำดับของพื้นที่ที่เกี่ยวข้องกับลวดลายเหล่านี้เหมือนกัน . [ 10 ] [ 11 ][ 12 ] และ [ 20 ] ในขณะที่มันเป็นที่ชัดเจนว่า RNA มีโครงสร้างที่มั่นคงและให้บริการ , ความจริงที่ว่าพวกเขาจะสามารถโดยตรงต่อการพัฒนาท้องถิ่น พับเก็บได้ แนวทางการทำงานก็ยังคงน้อยกว่า RNAs ได้รับการยอมรับ[ 4 ] และ [ 6 ] การศึกษาล่าสุดเน้นบทบาทสำคัญของพวกเขาในการส่งเสริมเสถียรภาพและขั้นสูงในการจัดวางรูปแบบการจัดเรียงของสำหรับและ helices แบบโค้งหรือกอง [ 21 ] , [ 22 ] [ 23 ] และ [ 24 ] ในเรื่องนี้ยีนพับปัญหาเกี่ยวข้องกับความเข้าใจวิธีการลำดับ RNA ( RNA การเข้ารหัสสำหรับโครงสร้างลวดลาย ) ตรงตำแหน่งของยีนที่อยู่ helices ด้วยความเคารพซึ่งกันและกัน นอกจากนี้ ลวดลายโครงสร้าง RNA ที่สามารถใช้เพื่อให้เข้าใจวิวัฒนาการของธรรมชาติที่เกิดขึ้น โดยเฉพาะการ RNAs [ 25 ] และ [ 26 ]