marigold by PCR. The PCRs were set up in a total volume
of 20 ml containing 50 ng of DNA, 0.2mM of each dNTP,
3.5mM MgCl2, 10 pmol of each primer and 1U of Taq
polymerase (Promega, WI, USA) in the manufacturersupplied
buffer. PCR cycles were run as follows: 948C
for 5 min, then 40 cycles of 948C for 30 s, 608C for 90 s
and 728C for 90 s, and ending with 728C for 5 min. The
amplified fragments were separated on 5% denaturing
polyacrylamide gels and visualized by silver staining as
described by Benbouza et al. (2006). The polymorphic
bands containing SSRs were excised and incubated at
37 8C for 2 h in 20 ml of sterile distilled water. The
eluted DNA bands were then reamplified and purified
before being cloned. To clone the fragments, SSR-containing
fragments were ligated with the pGEM-T easy
vector and transformed into Escherichia coli DH5a by
the heat shock method according to the manufacturer’s
instructions. The positive clones were selected for
sequencing, and SSR-flanking primers were designed
from the sequences of the clones and the database
using Websat (http://wsmartins.net/websat/). SSRs were
initially tested for amplification by PCR, and the products
were separated by polyacrylamide gel electrophoresis as
described above. The markers generating clear and scorable
bands were evaluated in all DNA samples with the
same technique.
ดอกดาวเรืองโดยวิธี PCR PCRs ถูกตั้งขึ้นในปริมาณ
20 มล. มี 50 NG ดีเอ็นเอ 0.2mm ของแต่ละ dNTP,
3.5 มม MgCl2 10 pmol ของแต่ละไพรเมอร์และ 1U ของ Taq
โพลิเมอร์ (Promega, WI, USA) ใน manufacturersupplied
บัฟเฟอร์ รอบ PCR วิ่งดังนี้ 948C
เป็นเวลา 5 นาทีแล้ว 40 รอบของ 948C เป็นเวลา 30 วินาที, 608C 90 s
และ 728C 90 S, และลงท้ายด้วย 728C เป็นเวลา 5 นาที
ชิ้นส่วนขยายที่ถูกแยกออกเมื่อวันที่ 5% denaturing
เจลอะคริเลตและมองเห็นโดยการย้อมสีเงินเป็น
อธิบายโดย Benbouza et al, (2006) polymorphic
วงดนตรีที่มี SSRs ถูกตัดและบ่มที่
37 8C เป็นเวลา 2 ชั่วโมงใน 20 มล. น้ำกลั่นผ่านการฆ่าเชื้อ
ชะวงดนตรีดีเอ็นเอ reamplified แล้วและบริสุทธิ์
ก่อนที่จะถูกโคลน การโคลนเศษ SSR ที่มี
ชิ้นส่วนที่ถูกผูกด้วยง่าย pGEM-T
เวกเตอร์และกลายเป็นเชื้อ Escherichia coli DH5a โดย
วิธีการช็อตความร้อนตามที่ผู้ผลิต
คำแนะนำ โคลนบวกถูกเลือกสำหรับการ
จัดลำดับและไพรเมอร์ SSR-ขนาบข้างได้รับการออกแบบ
จากลำดับของโคลนและฐานข้อมูล
โดยใช้ Websat (http://wsmartins.net/websat/) SSRs ถูก
ทดสอบครั้งแรกสำหรับการขยายโดยวิธี PCR และผลิตภัณฑ์
ถูกแยกจากกันโดย polyacrylamide gel electrophoresis เป็น
อธิบายไว้ข้างต้น เครื่องหมายการสร้างความชัดเจนและ scorable
วงดนตรีที่ได้รับการประเมินในทุกตัวอย่างดีเอ็นเอด้วย
เทคนิคเดียวกัน
การแปล กรุณารอสักครู่..
