A non-spore-forming, Gram-negative, motile, rod-shaped, boron-accumulating bacterium isolated
from soil was characterized by polyphasic taxonomy. The strain, designated BAM-48T
, was
positive for catalase and oxidase activities and grew at 4–37 6C, 0–1 % NaCl and pH 5–9.
Comparative analysis of the 16S rRNA gene sequence demonstrated that the novel isolate
BAM-48T was closely related to Variovorax paradoxus IAM 12373T (99.3 % sequence similarity),
Variovorax soli GH9-3T (98.3 %) and Variovorax dokdonensis DS-43T (97.0 %). DNA–DNA
hybridization values between strain BAM-48T and V. paradoxus NBRC 15149T
, V. soli KACC
11579T and V. dokdonensis KCTC 12544T were only 49.1, 25.4 and 24.6 %, respectively. The
major respiratory quinone was ubiquinone 8 (Q-8). The DNA G+C content was 71.2 mol%.
Strain BAM-48T contained C16 : 0 (36.1 %), C16 : 1v7c (21.4 %) and C17 : 0 cyclo (19.0 %) as the
major fatty acids. Based on phenotypic, chemotaxonomic and phylogenetic data, strain BAM-48T
should be classified as a member of a novel species in the genus Variovorax, for which the
name Variovorax boronicumulans sp. nov. is proposed. The type strain is BAM-48T (5NBRC
103145T 5KCTC 22010T
).
ไม่ใช่สร้างสปอร์, แกรมลบ, เคลื่อนที่, รูปแท่ง, โบรอนสะสมแบคทีเรียที่แยกได้
จากดินก็มีลักษณะอนุกรมวิธาน polyphasic สายพันธุ์ที่ได้รับมอบหมายให้ BAM-48T
เป็น
บวกสำหรับ catalase และ oxidase กิจกรรมและการขยายตัวที่ 4-37 6C, 0-1% โซเดียมคลอไรด์และพีเอช 5-9.
การวิเคราะห์เปรียบเทียบของยีน 16S rRNA แสดงให้เห็นว่านวนิยายเรื่องนี้แยก
BAM-48T มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับ Variovorax paradoxus IAM 12373T (99.3% ลำดับความคล้ายคลึงกัน)
Variovorax soli GH9-3T (98.3%) และ Variovorax dokdonensis DS-43T (97.0%) ดีเอ็นเอดีเอ็นเอ
ค่าการผสมพันธุ์ระหว่างสายพันธุ์ BAM-48T โวลต์และ paradoxus NBRC 15149T
โวลต์ soli KACC
11579T โวลต์และ dokdonensis KCTC 12544T เพียง 49.1, 25.4 และ 24.6% ตามลำดับ
quinone ระบบทางเดินหายใจที่สำคัญคือ ubiquinone 8 (Q-8) เนื้อหาดีเอ็นเอ G + C เป็น 71.2 mol%.
สายพันธุ์ BAM-48T มี C16: 0 (36.1%) C16: 1v7c (21.4%) และ C17: 0 Cyclo (19.0%) ในขณะที่
กรดไขมันที่สำคัญ ขึ้นอยู่กับฟีโนไทป์, chemotaxonomic และข้อมูล phylogenetic ความเครียด BAM-48T
จะจัดว่าเป็นสมาชิกคนหนึ่งของสายพันธุ์นวนิยายในประเภท Variovorax สำหรับที่
ชื่อ Variovorax boronicumulans SP พฤศจิกายน มีการเสนอ สายพันธุ์คือชนิด BAM-48T (5NBRC
103145T 5KCTC 22010T
)
การแปล กรุณารอสักครู่..
ที่ไม่สร้างสปอร์ เป็นแกรมลบ เคลื่อนที่ rod-shaped , โบรอน , สะสมแบคทีเรียที่แยกได้จากดินตามลักษณะอนุกรมวิธาน polyphasic . ความเครียด , เขต bam-48tคือบวกและกิจกรรมสามารถ oxidase และขยายตัวที่ 4 – 37 6 , 0 – 1 โซเดียมคลอไรด์พีเอช 5 – 9การวิเคราะห์เปรียบเทียบลำดับเบส 16S rRNA ของยีนพบว่านวนิยายแยกbam-48t คือเกี่ยวข้องกับ variovorax paradoxus เอี่ยม 12373t ( ลำดับ 99.3 % ความเหมือน )variovorax Soli gh9-3t ( ดีเอ็นเอ ) และ variovorax dokdonensis ds-43t ( 97.0 % ) ดีเอ็นเอ - ดีเอ็นเอลูกผสมระหว่างสายพันธุ์และค่า bam-48t paradoxus nbrc 15149t Vkacc Soli V11579t และ V . dokdonensis kctc 12544t เป็น 49.1 25.4 และ 24.6 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ ที่สาขาระบบทางเดินหายใจควิโนนถูกบิควิโนน 8 ( q-8 ) ดีเอ็นเอ G + C เนื้อหา 71.2 โมล %สายพันธุ์ bam-48t ที่มีอยู่ c16 : 0 ( 80% ) , c16 : 1v7c ( 21.4% ) และ c17 : 0 คือ cyclo ( 19.0% ) เป็นกรดไขมันที่สำคัญ ขึ้นอยู่กับคุณสมบัติและข้อมูลต่างๆ bam-48t chemotaxonomic , ความเครียด ,ควรจัดเป็น สมาชิกของนวนิยายชนิดในสกุล variovorax , ซึ่งชื่อ variovorax boronicumulans sp . เป็นเสนอ ประเภท bam-48t ( 5nbrc สายพันธุ์คือ103145t 5kctc 22010t)
การแปล กรุณารอสักครู่..