All raw intensity files were loaded

All raw intensity files were loaded in Illumina's GenomeStudio v3, normalized and clustered using the SNP manifest and cluster files for build37 of the human genome. In all our analyses we used the total signal intensity R for each SNP, which is the sum of the normalized X (“A” allele, Cy5 red) and Y (“B” allele, Cy3 green) intensities. We also used the B allele frequency (BAF), which is a modified version of the allelic intensity ratio theta (θ = 2/p*arctan(Y/X)), to reduce SNP-to-SNP variation in theta using the canonical clusters.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไฟล์ raw ความเข้มทั้งหมดถูกโหลดในของ Illumina GenomeStudio v3 ตามปกติ และคลัสเตอร์ที่ใช้ SNP รายการและคลัสเตอร์แฟ้มสำหรับ build37 ของมมนุษย์ ในทั้งหมดของเราวิเคราะห์เราใช้ความเข้มสัญญาณรวม R สำหรับแต่ละ SNP ซึ่งเป็นผลรวมของค่ามาตรฐาน ("A" อัลลีล Cy5 แดง) X และ Y (อัลลีล B" สีเขียว Cy3) ความเข้ม นอกจากนี้เรายังใช้ความถี่อัลลีล B (บริษัทบัฟ), ซึ่งเป็นรุ่นที่แก้ไขของทีอัตราความเข้ม allelic (ค่าθ = 2/p*arctan(Y/X)) เพื่อลดความผันแปร SNP-SNP ในทีที่ใช้กลุ่มเป็นที่ยอมรับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไฟล์ทั้งหมดเข้มดิบถูกโหลดใน Illumina ของ GenomeStudio V3, ปกติและคลัสเตอร์ใช้ SNP ประจักษ์และคลัสเตอร์ไฟล์สำหรับการ build37 ของจีโนมมนุษย์ ในการวิเคราะห์ของเราทั้งหมดที่เราใช้ในการวิจัยความเข้มของสัญญาณรวมสำหรับแต่ละ SNP ซึ่งเป็นผลรวมของปกติเอ็กซ์ ( "A" อัลลีล, Cy5 สีแดง) และ Y ( "B" อัลลีล, Cy3 สีเขียว) ความเข้ม นอกจากนี้เรายังใช้ความถี่ B อัลลีล (BAF) ซึ่งเป็นรุ่นที่แก้ไขของทีอัตราส่วนความเข้ม allelic (θ = 2 / p * arctan (Y / X)) เพื่อลดการเปลี่ยนแปลง SNP ไป SNP ในทีใช้เป็นที่ยอมรับ กลุ่ม