For this study, we used mitochondri

For this study, we used mitochondrial DNA (mtDNA) sequences to infer the relationships among the different taxa of spider monkeys we sampled. Mitochondrial DNA has been suggested as an ideal marker to conduct studies of species and subspecies relationships as this marker (1) displays extensive intraspecific polymorphism, (2) typically evolves faster than nuclear DNA, and (3) is
present at higher copy number and thus is more readily extracted and amplified from a variety of sample types (feces, hair) than is nuclear DNA (Avise, 2000). However, the use of mtDNA also has
its limitations. In particular, because it is inherited as a single locus it provides only a single independent estimate of a species tree, and its maternal pattern of inheritance only provides insight into the evolutionary history of maternal lineages (Hoelzer, 1997; Moore,
1995). Still, because females are the individuals that predominantly disperse in spider monkeys (Ahumada, 1989; Symington, 1988, 1990; Di Fiore et al., 2009), a mtDNA tree should in fact
reflect the relationships between taxa better than it would in a taxon where females are philopatric, as in many other primates and most non-primate social mammals. This is because the phylogenetic signal present in this maternally inherited and non-recombining marker is likely to be less obscured by restricted gene flow (which results in geographically-structured intra-species divergence)in a species where females are the dispersing rather than
the philopatric sex. In this study, we used a suite of differentmtDNA genes that evolve at different rates (Mueller, 2006) and therefore can provide insights into divergences that occurred at different time depths within the Ateles phylogeny. Specifically, we sequenced a total of 3.5 kb of the mitochondrial NAD5, NAD6, and cytochrome B genes and 0.4 kb of associated flanking sequence. All of these mitochondrial markers have been used in other phylogenetic studies of various New World monkeys (Casado et al., 2007; Córtes-Ortiz et al., 2003; Nascimento et al., 2005; Pastorini et al., 1998) as well as Old World primates (Karanth et al., 2008; Ting, 2008; Wildman et al., 2004).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สำหรับการศึกษานี้ เราใช้ mitochondrial DNA (mtDNA) ลำดับการเข้าใจความสัมพันธ์ระหว่าง taxa ที่แตกต่างกันของเราความลิงแมงมุม มีการแนะนำ mitochondrial DNA เป็นเครื่องหมายที่เหมาะจะทำการศึกษาความสัมพันธ์ของชนิดและชนิดย่อย ตามเครื่องหมายนี้ (1) แสดงอย่างละเอียด intraspecific โพลีมอร์ฟิซึม, (2) จะวิวัฒนาการเร็วกว่าดีเอ็นเอนิวเคลียร์ และ (3) เป็นนำเสนอที่คัดลอกหมายเลขที่สูง และดังมากขึ้นสกัด และขยายจากความหลากหลายของชนิดของตัวอย่าง (อุจจาระ ผม) กว่าดีเอ็นเอนิวเคลียร์ (Avise, 2000) อย่างไรก็ตาม การใช้ของ mtDNA มีข้อจำกัดของ โดยเฉพาะ เนื่องจากสืบทอดมาเป็นโลกัสโพลเดียว มันให้เท่านั้นเป็นอิสระประเมินของต้นไม้ชนิด และแม่รูปแบบการสืบทอดเฉพาะให้ความเข้าใจถึงประวัติวิวัฒนาการของแม่เชื้อชาติ (Hoelzer, 1997 มัวร์1995) นั้นยังคง เพราะฉันคือ บุคคลที่ส่วนใหญ่กระจายในลิงแมงมุม (Ahumada, 1989 Symington, 1988, 1990 Di ฟิออเร่ et al., 2009), ทรี mtDNA ควรในความเป็นจริงสะท้อนความสัมพันธ์ระหว่าง taxa ดีกว่ามันจะเป็น taxon ที่หญิงมี philopatric ใน primates และมากที่สุดไม่ใช่ถือสังคมเลี้ยงลูกด้วยนมอื่น ๆ อีกหลาย เนื่องจากสัญญาณ phylogenetic อยู่ในเครื่องหมาย maternally สืบทอด และไม่ recombining นี้เป็นแนวโน้มที่จะน้อยกว่าบดบัง โดยจำกัดยีนกระแส (ซึ่งผลลัพธ์ในโครงสร้างกันทางภูมิศาสตร์ภายในพันธุ์ divergence) ในชนิดที่หญิงมีการสลาย rather กว่าthe philopatric sex. In this study, we used a suite of differentmtDNA genes that evolve at different rates (Mueller, 2006) and therefore can provide insights into divergences that occurred at different time depths within the Ateles phylogeny. Specifically, we sequenced a total of 3.5 kb of the mitochondrial NAD5, NAD6, and cytochrome B genes and 0.4 kb of associated flanking sequence. All of these mitochondrial markers have been used in other phylogenetic studies of various New World monkeys (Casado et al., 2007; Córtes-Ortiz et al., 2003; Nascimento et al., 2005; Pastorini et al., 1998) as well as Old World primates (Karanth et al., 2008; Ting, 2008; Wildman et al., 2004).

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สำหรับการศึกษานี้เราใช้ยลดีเอ็นเอ (mtDNA) ลำดับเพื่อสรุปความสัมพันธ์ระหว่างแท็กซ่าที่แตกต่างกันของลิงแมงมุมเราตัวอย่าง ยลดีเอ็นเอได้รับการแนะนำในฐานะที่เป็นเครื่องหมายที่เหมาะที่จะดำเนินการศึกษาของสายพันธุ์และความสัมพันธ์ย่อยเป็นเครื่องหมายนี้ (1) แสดงความแตกต่างสำนวนที่กว้างขวาง (2) มักจะมีวิวัฒนาการเร็วกว่านิวเคลียร์ดีเอ็นเอและ (3)
เป็นของขวัญที่จำนวนสำเนาที่สูงขึ้นและทำให้สกัดมากขึ้นได้อย่างง่ายดายและขยายจากความหลากหลายของประเภทตัวอย่าง (อุจจาระผม) กว่านิวเคลียร์ดีเอ็นเอ (Avise, 2000) แต่การใช้งานของ mtDNA
นอกจากนี้ยังมีข้อจำกัด ของมัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งเพราะมันเป็นมรดกที่ได้รับเป็นสถานที่เดียวที่จะให้เพียงการประมาณการอิสระเดียวของต้นไม้ชนิดและรูปแบบของมารดาของมรดกเพียง แต่ให้ข้อมูลเชิงลึกในประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของ lineages มารดา (Hoelzer, 1997; มัวร์,
1995) ยังคงเพราะหญิงเป็นบุคคลที่ส่วนใหญ่กระจายในลิงแมงมุม (Ahumada 1989; Symington, 1988, 1990;. Di Fiore et al, 2009), ต้นไม้ mtDNA
ควรในความเป็นจริงสะท้อนให้เห็นถึงความสัมพันธ์ระหว่างแท็กซ่าดีกว่ามันจะอยู่ในแท็กซอนที่เพศหญิงมี philopatric ในขณะที่บิชอพอื่น ๆ อีกมากมายและเลี้ยงลูกด้วยนมทางสังคมที่ไม่เจ้าคณะมากที่สุด นี้เป็นเพราะในปัจจุบันสัญญาณสายวิวัฒนาการในการรับมรดกมารดาและเครื่องหมายที่ไม่ recombining มีแนวโน้มที่จะถูกบดบังน้อยโดยการไหลของยีน จำกัด (ซึ่งจะส่งผลในทางภูมิศาสตร์ที่มีโครงสร้างแตกต่างภายในชนิด) ในสายพันธุ์ที่หญิงเป็นกระจายมากกว่า
philopatric เพศ. ในการศึกษานี้เราใช้ชุดของยีน differentmtDNA ที่พัฒนาขึ้นในอัตราที่แตกต่างกัน (มูลเลอร์, 2006) และดังนั้นจึงสามารถให้ข้อมูลเชิงลึกในความแตกต่างที่เกิดขึ้นที่ระดับความลึกเวลาที่แตกต่างภายใน Ateles เชื้อชาติ โดยเฉพาะเราติดใจทั้งหมด? 3.5 กิโลของยล NAD5, NAD6 และยีน cytochrome b และ? 0.4 กิโลลำดับขนาบเกี่ยวข้อง ทั้งหมดของเครื่องหมายยลเหล่านี้ได้ถูกนำมาใช้ในการศึกษาวิวัฒนาการอื่น ๆ ของลิงต่างๆโลกใหม่ (Casado et al, 2007;. Cortes-ออร์ติซ, et al, 2003;. Nascimento et al, 2005;. Pastorini et al, 1998.) เช่นเดียวกับ เป็นลิงโลกเก่า (Karanth et al, 2008;. ติ่ง, 2008. Wildman, et al, 2004)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ครั้งนี้เราใช้ดีเอ็นเอ ( แสดง ) ลำดับการอนุมานความสัมพันธ์ระหว่างความสูงที่แตกต่างกันของแมงมุมลิงเราเก็บตัว . ดีเอ็นเอที่ได้รับการแนะนำเป็นเครื่องหมายที่เหมาะที่จะศึกษาความสัมพันธ์ของชนิดและชนิดย่อยเครื่องหมายนี้แสดงอย่างละเอียด ( 1 ) เซ็นต์ polymorphism ( 2 ) โดยปกติวิวัฒนาการเร็วกว่านิวเคลียร์ ดีเอ็นเอ และ ( 3 )
ปัจจุบัน คัดเลขสูงกว่า และดังนั้นจึง เพิ่มเติมพร้อมสกัดจากการเพิ่มความหลากหลายของประเภทตัวอย่างอุจจาระ ผม ) กว่านิวเคลียร์ดีเอ็นเอ ( วีเซ่ , 2000 ) อย่างไรก็ตาม การใช้แสดงก็มี
ข้อ จำกัด ของมัน โดยเฉพาะ เพราะมันคือการสืบทอดอย่างเดียวมันมีเพียงตนเดียวที่เป็นอิสระประมาณของต้นไม้ชนิดและรูปแบบของมารดาของมรดกเพียงให้ลึกเข้าไปในประวัติศาสตร์ของวิวัฒนาการของเผ่าพันธุ์ ( Hoelzer , 1997 ; มัวร์ ,
1995 ) ก็เพราะผู้หญิงเป็นบุคคลที่เด่นกระจายในแมงมุมลิง ( ahumada , 1989 ; ซีมิงตัน , 1988 , 1990 ; Di Fiore et al . , 2009 ) , แสดงต้นไม้ที่ควรในความเป็นจริง
สะท้อนให้เห็นถึงความสัมพันธ์ระหว่างความสูง มากกว่าจะเป็นชนิดที่ผู้หญิง philopatric เช่นเดียวกับสัตว์อื่น ๆ มาก และส่วนใหญ่ไม่ใช่สังคมสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมนี้เป็นเพราะสัญญาณ ซึ่งปัจจุบันในความเป็นแม่สืบทอดและไม่ใช่ recombining เครื่องหมายมีแนวโน้มที่จะน้อยกว่าบดบัง โดยการแลกเปลี่ยนยีน จำกัด ( ซึ่งผลลัพธ์ในโครงสร้างทางภูมิศาสตร์ภายในชนิดความแตกต่างในสายพันธุ์ที่เพศหญิงเป็นเพศ philopatric กระจายมากกว่า
. ในการศึกษานี้เราใช้ชุดของ differentmtdna ยีนที่พัฒนาในอัตราที่แตกต่างกัน ( Mueller , 2006 ) และดังนั้นจึงสามารถให้ข้อมูลเชิงลึกใน divergences เกิดขึ้นที่ระดับความลึกต่างๆ ภายใน ateles ระบบเชื้อชาติ . โดยเฉพาะ เราลำดับทั้งหมดของ  3.5 kb ของไมโตคอนเดรีย nad5 nad6 , และไซโตโครม บี ยีนและ  0.4 จบางครั้งที่ลำดับทั้งหมดเหล่านี้เครื่องหมายอุตสาหกรรม ได้ถูกใช้ในการศึกษาอื่น ๆ ชนิดต่าง ๆลิงโลกใหม่ คาซาโด้ et al . , 2007 ; C ó rtes Ortiz et al . , 2003 ; nascimento et al . , 2005 ; pastorini et al . , 1998 ) รวมทั้งพวกลิงโลกเก่า ( karanth et al . , 2008 ; ติง 2551 ; ไวลด์เมิน et al . , 2004 )