Identification and classification o

Identification and classification of selected endophytic
diazotrophic bacteria The selected EDB were identified by phylogenetic analysis of
the 16S rRNA gene. Total DNA of the bacteria was extracted using a modified potassiumacetate method (Prakamhang et al.
2009) and used as a DNA template in PCR reactions.Amplification of the 16S rRNA gene was performed using a
pair of universal primers, fD1 (5′-AGAGTTTGATCCTGGC TCAG-3′) and rP2 (5′-ACGGCTACCTTGTTACGACTT-3′)
(Weisburg et al. 1991). DNA sequencing was performed by MACROGEN (Korea). The DNA sequences were aligned
and compared to sequences available in GenBank. Phylogenetic tree was constructed by neighbor-joining method
using Mega 4 (Tamura et al. 2007), and confidence levels were estimated for 1,000 replicates by bootstrapping.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระบุและจำแนกประเภทของเลือก endophyticระบุแบคทีเรีย diazotrophic EDB เลือก โดยวิเคราะห์ phylogeneticการ 16S rRNA ยีน รวมดีเอ็นเอของแบคทีเรียจะถูกสกัดโดยใช้วิธีแก้ไข potassiumacetate (Prakamhang et al2009) และใช้เป็นแม่แบบดีเอ็นเอในปฏิกิริยา PCR ขยายการ 16S rRNA ยีนถูกดำเนินการโดยใช้การคู่ไพรเมอร์สากล fD1 (5′-AGAGTTTGATCCTGGC TCAG-3′) และ rP2 (5′-ACGGCTACCTTGTTACGACTT-3′)(Weisburg et al. 1991) ลำดับดีเอ็นเอที่ดำเนินการ โดย MACROGEN (เกาหลี) มีจัดลำดับดีเอ็นเอและเมื่อเทียบกับลำดับใน GenBank Phylogenetic tree ถูกสร้าง โดยเพื่อนบ้านเข้าร่วมวิธีการใช้ 4 เมก้า (Tamura et al. 2007), และความเชื่อมั่นที่ระดับถูกประเมินสำหรับ 1000 เหมือนกับ โดย bootstrapping

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การกำหนดและจัดหมวดหมู่ของเอนโดไฟท์ที่เลือก
แบคทีเรีย diazotrophic เลือกกีฬาที่ถูกระบุโดยการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของ
ยีน 16S rRNA ดีเอ็นเอทั้งหมดของเชื้อแบคทีเรียที่ถูกสกัดโดยใช้วิธีการปรับเปลี่ยน potassiumacetate (Prakamhang et al.
2009) และใช้เป็นแม่แบบในดีเอ็นเอ reactions.Amplification PCR ของยีน 16S rRNA ได้รับการดำเนินการโดยใช้
คู่ของไพรเมอร์สากล FD1 (5'-AGAGTTTGATCCTGGC TCAG-3) และ RP2 (5'-ACGGCTACCTTGTTACGACTT-3)
(Weisburg et al. 1991) ลำดับดีเอ็นเอได้ดำเนินการโดย MACROGEN (เกาหลี) ดีเอ็นเอถูกจัดชิด
และเมื่อเทียบกับลำดับที่มีอยู่ใน GenBank Phylogenetic ต้นไม้ถูกสร้างขึ้นโดยวิธีเพื่อนบ้านเข้า
ใช้เมกะ 4 (ทามูระ, et al. 2007) และความเชื่อมั่นในระดับประมาณ 1,000 ซ้ำโดยร่วมมือ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การจำแนกแบคทีเรียและรา
diazotrophic เลือกกีฬาที่เลือกได้ระบุโดยการวิเคราะห์วิวัฒนาการของยีน 16S rRNA
. ดีเอ็นเอทั้งหมดของแบคทีเรียถูกสกัดโดยใช้วิธีที่ดัดแปลง potassiumacetate ( prakamhang et al .
2009 ) และใช้เป็นแม่แบบในการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอปฏิกิริยา PCR ของยีน 16S rRNA ได้โดยใช้คู่ไพรเมอร์
สากลเพื่อการวิเคราะห์ ( 5 ’ - agagtttgatcctggc tcag-3 School ) และ rp2 ( 5 ’ - ’ acggctaccttgttacgactt-3 )
( weisburg et al . 1991 ) การจัดลำดับดีเอ็นเอโดยใช้ macrogen ( เกาหลี ) ดีเอ็นเอลำดับชิด
และเปรียบเทียบลำดับของบริเวณ phylogenetic ต้นไม้ถูกสร้างขึ้นโดยเพื่อนบ้านร่วมใช้วิธี
ใหญ่ 4 ( ทามูระ et al . 2007 ) , และความเชื่อมั่นที่ระดับประมาณ 1 ,000 ซ้ำโดย bootstrapping .