The general principle of DGGE and T

The general principle of DGGE and TGGE is the
separation of individual rRNA genes based on differences
in their chemical stability or melting temperature.
Polyacrylamide gels consisting of a linear denaturing
gradient formed by urea and formamide are employed
for DGGE, whereas a linear temperature gradient is
used during TGGE. DGGE of PCR-amplified rRNA
gene amplicons is a useful technique for monitoring
dynamic changes in mixed bacterial populations over
time.54,55 The rRNA gene sequences from bacterial
species in a mixed culture are first amplified using
conserved bacterial primers that bracket a hypervariable
region of the rRNA gene, producing amplicons of the
same length but with differing sequences that are
specific to a given species. DGGE allows the separation
of these amplicons, producing a molecular fingerprint
of the bacterial species.54,55 DGGE and other similar
techniques have been shown to be useful to analyze
human fecal microflora.56,57 For example, DGGE may
be useful to assess the effect of antibiotic therapy on
the fecal microflora of hospitalized patients.58 Since
the bacterial microbiota of different individuals may
vary significantly the ability to provide a detailed analysis
of multiple individuals is limited.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หลักการทั่วไปของ DGGE และ TGGE เป็นการการแยกยีน rRNA แต่ละความแตกตความเสถียรทางเคมีหรืออุณหภูมิหลอมเหลวตรวจสอบวิเคราะห์เจ denaturing เชิงเส้นประกอบด้วยใช้ยูเรียและ formamide ไล่ระดับสีสำหรับ DGGE ในขณะที่มีการไล่ระดับสีอุณหภูมิเชิงเส้นใช้ในระหว่าง TGGE DGGE ของ rRNA ขยาย PCRยีน amplicons เป็นเทคนิคมีประโยชน์สำหรับการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงแบบไดนามิกในประชากรแบคทีเรียผสมมากกว่าtime.54,55 ลำดับยีนใน rRNA จากแบคทีเรียพันธุ์ผสมวัฒนธรรมจะขยายใช้ครั้งแรกไพรเมอร์แบคทีเรียภัตที่ยึดแบบ hypervariableของยีนใน rRNA ผลิต amplicons ของการความยาวเดียวกันแต่ มีลำดับที่แตกต่างกันที่เฉพาะในสายพันธุ์กำหนด DGGE ช่วยให้การแยกของ amplicons เหล่านี้ ลายนิ้วมือระดับโมเลกุลในการผลิตspecies.54,55 แบคทีเรีย DGGE และอื่น ๆ คล้ายคลึงกันได้แสดงให้เป็นประโยชน์ในการวิเคราะห์เทคนิคmicroflora.56,57 อุจจาระมนุษย์เช่น DGGE อาจเป็นประโยชน์ในการประเมินผลของการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะในจุลินทรีย์ในอุจจาระของพี่จึ patients.58 ตั้งแต่จุลินทรีย์แบคทีเรียของบุคคลแตกต่างกันอาจความสามารถในการให้การวิเคราะห์รายละเอียดที่แตกหลายคนมีจำกัด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หลักการทั่วไปของ DGGE และ TGGE คือ
การแยกของยีน rRNA บุคคลบนพื้นฐานของความแตกต่าง
ในความคงตัวทางเคมีหรืออุณหภูมิหลอมเหลว. ของพวกเขา
เจลอะคริเลตประกอบด้วย denaturing เชิงเส้น
ลาดที่เกิดขึ้นจากยูเรียและ formamide มีการจ้างงาน
สำหรับ DGGE ในขณะที่อุณหภูมิลาดเชิงเส้นจะถูก
นำมาใช้ ในช่วง TGGE DGGE ของ PCR-amplified rRNA
amplicons ยีนเป็นเทคนิคที่มีประโยชน์สำหรับการตรวจสอบ
การเปลี่ยนแปลงแบบไดนามิกในประชากรแบคทีเรียผสมมากกว่า
time.54,55 rRNA ลำดับยีนจากแบคทีเรีย
ชนิดในวัฒนธรรมผสมจะขยายครั้งแรกที่ใช้
ไพรเมอร์ของแบคทีเรียอนุรักษ์ที่วงเล็บ hypervariable
ภูมิภาค ยีน rRNA ผลิต amplicons ของ
ยาวเท่ากัน แต่มีลำดับที่มีความแตกต่างกัน
ที่เฉพาะเจาะจงเพื่อเป็นสายพันธุ์ที่ได้รับ DGGE ช่วยให้การแยก
ของ amplicons เหล่านี้ผลิตลายนิ้วมือในระดับโมเลกุล
ของเชื้อแบคทีเรีย species.54,55 DGGE และอื่น ๆ ที่คล้าย
เทคนิคได้รับการแสดงที่จะเป็นประโยชน์ในการวิเคราะห์
microflora.56,57 อุจจาระของมนุษย์ตัวอย่างเช่น DGGE อาจ
จะมีประโยชน์ในการประเมิน ผลของการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะใน
จุลินทรีย์ในอุจจาระของ patients.58 รักษาในโรงพยาบาลตั้งแต่
microbiota แบคทีเรียของบุคคลที่แตกต่างกันอาจ
จะแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญสามารถที่จะให้การวิเคราะห์รายละเอียด
ของบุคคลหลาย ๆ มี จำกัด