A potential pitfall in using the mc

A potential pitfall in using the mcrA gene for detection is the high degree of DNA sequence conservation between mcrA and mrtA, the equivalent gene in the MCRII complex, a complex found in a limited number of methanogen species. This means that detection based on primers for PCR designed to conserved regions in mcrA is also likely to detect mrtA sequences, complicating the analysis. Fortunately, the mrtA gene sequences form a coherent group close to the Methanococcales (Fig. 3) and therefore are readily distinguishable from mcrA gene sequences. This close proximity has been reported previously and led to the suggestion that the mrtA gene has arisen by lateral transfer from the Methanococcales rather than gene duplication (Reeve et al., 1997). There were, however, noticably more mrtA sequences than mcrA Methanobacteriales sequences, suggesting overrepresentation of this sequence type in the analysis. This is likely to be due to PCR bias, amplifying the mrtA sequences preferentially, rather than a wider distribution of mrtA genes in the methanogen community, as the mrtA gene sequences group closely with a single Methanobacteriales mrtA sequence from Methanobacterium formicicum.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ที่อาจเกิดอันตรายในการใช้ยีน mcra สำหรับการตรวจสอบเป็นระดับสูงของการอนุรักษ์ลำดับดีเอ็นเอระหว่าง mcra และรถไฟฟ้ายีนเทียบเท่าในที่ซับซ้อน mcrii ที่ซับซ้อนที่พบในจำนวนที่ จำกัด ของสายพันธุ์ methanogen นี้หมายถึงการตรวจสอบขึ้นอยู่กับไพรเมอร์สำหรับ PCR ออกแบบมาเพื่อพื้นที่ป่าสงวนใน mcra ที่ยังมีแนวโน้มที่จะตรวจสอบลำดับรถไฟฟ้าแทรกซ้อนวิเคราะห์ โชคดี,รฟม. ลำดับยีนแบบใกล้ชิดกลุ่มที่เชื่อมโยงกันเพื่อ methanococcales (รูปที่ 3) จึงมีความแตกต่างได้อย่างง่ายดายจาก mcra ลำดับยีน นี้บริเวณใกล้เคียงกับที่เคยมีรายงานก่อนหน้านี้และนำไปสู่​​ข้อเสนอแนะว่ายีนรถไฟฟ้าได้เกิดขึ้นโดยการโอนจากด้านข้าง methanococcales มากกว่ายีนซ้ำ (รีฟ, et al., 1997) มี แต่noticably ขึ้นลำดับ รฟม. กว่า mcra ลำดับ methanobacteriales, overrepresentation แนะนำประเภทลำดับนี้ในการวิเคราะห์ นี้มีแนวโน้มที่จะเป็นเพราะอคติ PCR ปรากฏการณ์ลำดับ รฟม. ชอบมากกว่าการกระจายกว้างของยีน รฟม. ในชุมชน methanogen,เป็นยีน รฟม. ลำดับกลุ่มอย่างใกล้ชิดกับลำดับ methanobacteriales เดียว รฟม. จาก methanobacterium formicicum

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Pitfall ที่มีศักยภาพในการใช้ยีน mcrA ตรวจอนุรักษ์ลำดับดีเอ็นเอระหว่าง mcrA และรถไฟ ยีนเท่ากับใน MCRII ซับซ้อน พบจำนวนจำกัดพันธุ์เมทาโนเจนที่ซับซ้อนในระดับสูงได้ ซึ่งหมายความ ว่า ตรวจตามไพรเมอร์สำหรับ PCR เพื่อภูมิภาคนำใน mcrA จะยังตรวจพบสถานีลำดับ complicating วิเคราะห์ โชคดี ลำดับยีนอีกรูปแบบกลุ่ม coherent ใกล้กับ Methanococcales (Fig. 3) และดังนั้น จะแตกต่างจากลำดับยีน mcrA พร้อม ห้องนี้มีการรายงานก่อนหน้านี้ และนำไปสู่ข้อเสนอแนะว่า มีเกิดยีนอีก โดยโอนด้านข้างจากสำเนาที่ Methanococcales มากกว่ายีน (รีฟและ al., 1997) มี แต่ ลำดับสถานีเพิ่มเติม noticably มากกว่า mcrA Methanobacteriales ลำดับ overrepresentation ชนิดนี้ลำดับในการวิเคราะห์แนะนำ เรื่องนี้น่าจะมีสาเหตุมาจากความโน้มเอียงของ PCR มือลำดับอีกแทนที่จะกระจายกว้างของรถไฟในชุมชนเมทาโนเจน โน้ต กลุ่มลำดับยีนอีกอย่างใกล้ชิดกับลำดับสถานี Methanobacteriales เดียวจาก Methanobacterium formicicum

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

"อาหารอร่อยเพื่อ สุขภาพ ที่อาจเกิดขึ้นในการใช้ยีน mcra สำหรับการตรวจจับมีระดับสูงในการอนุรักษ์ตามลำดับดีเอ็นเอระหว่างรฟม.และ mcra ยีนเทียบเท่ากับที่ในคอมเพล็กซ์ mcrii ที่คอมเพล็กซ์ที่พบได้ในจำนวนจำกัด(มหาชน)ของสายพันธุ์ methanogen ซึ่งหมายความว่าการตรวจจับที่ใช้ primers สำหรับ pcr ได้รับการออกแบบในเขตพื้นที่ใน mcra คือยังมีแนวโน้มที่จะตรวจจับลำดับรฟม.ทำให้สถานการณ์ซับซ้อนยิ่งขึ้นคือการวิเคราะห์ โชคยังดีซีเควนซ์ของยีนที่รฟม.เป็นกลุ่มที่เกี่ยวเนื่องกันอยู่ใกล้กับ methanococcales (รูปที่ 3 )และดังนั้นจึงได้อย่างโดดเด่นจากยีน mcra ซีเควนซ์ อยู่ใกล้กับโรงแรมแห่งนี้ได้รับการรายงานก่อนหน้านี้และนำไปสู่ความคิดที่ว่ายีนที่รฟม.ได้เป็นผลมาจากการโอนจากด้านข้าง methanococcales ที่มากกว่าการทำซ้ำยีน(ถึงแก่กรรม et al . 1997 ) มีแต่ถึงอย่างไรก็ตามnoticably มากรฟม.ลำดับกว่า methanobacteriales mcra ลำดับแนะนำ overrepresentation ของ ประเภท ตามลำดับนี้ในการวิเคราะห์ โรงแรมแห่งนี้คือมีแนวโน้มที่จะได้รับจากการทำงาน, pcr ขยายเสียง ได้ในลำดับของรฟม.ที่ระบุกันไว้ก่อนสำหรับมากกว่าการกระจายของยีนที่กว้างขึ้นรฟม.ในชุมชน methanogen ได้เป็นยีนรฟม.ให้ซีเควนซ์ของกลุ่มอย่างใกล้ชิดกับ methanobacteriales เดียวตามลำดับรฟม.จาก formicicum methanobacterium