As bioinformatics represents an arr

As bioinformatics represents an array of themes such as genomics, phylogenetic analysis, and molecular modeling, teaching such a course is an interesting and challenging task. This study considered a problem-based case that aimed to cover certain specialized areas including: biological database access and retrieval; sequence comparison and phylogenetic analysis. In addition, probe design and in silico PCR-RFLP were also introduced as examples of applications in molecular genetics. While there were many topics to deal with, because they were related, it was possible for them to be taught in the one course. The Genus Bacillus was selected for the study, with students assigned to gather the names of Bacillus species as well as their 16S rRNA sequences, as the use of rRNA genes in determining the phylogenetic relationships among living organisms is now widely accepted, since: they are present in all living organisms; have conserved structures and functions; and they have been collated into a comprehensive database. Based on the nucleotide NCBI database, thirty four
Kasetsart J. (Nat. Sci.) 42(4) 695
Bacillus species were selected and their 16S rRNA gene sequences were retrieved by their accession number (Table 1). The 16S rRNA sequences of Escherichia coli, Lactobacillus delbrueckii subsp.
bulgaricus and Staphylococcus aureus were also compiled to use for outgroup analysis. These 16S rRNA sequences were then subjected to multiple sequence analysis in which the dendogram was

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เป็น bioinformatics แสดงหลากหลายรูปแบบเช่น genomics ผลวิเคราะห์ และการสร้างแบบจำลองโมเลกุล การเรียนการสอนในหลักสูตรเป็นงานน่าสนใจ และท้าทาย การศึกษานี้ถือว่าเป็นกรณีที่มุ่งบางพื้นที่เฉพาะรวมทั้งปัญหา: เข้าถึงฐานข้อมูลชีวภาพและเรียก ลำดับการเปรียบเทียบและวิเคราะห์ผล นอกจากนี้ โพรบออกแบบ และในรูปดอกไม้ PCR-RFLP ถูกยังนำมาใช้เป็นตัวอย่างของโปรแกรมประยุกต์ในอณูพันธุศาสตร์ ในขณะที่มีหลายหัวข้อในการจัดการกับ เนื่องจากพวกเขาเกี่ยวข้อง มันเป็นไปได้สำหรับพวกเขาจะได้รับการสอนในหลักสูตรหนึ่ง เชื้อสกุลเลือกสำหรับการศึกษา นักเรียนกำหนดเพื่อรวบรวมชื่อของสายพันธุ์บาซิลลัสเป็นของ 16S rRNA ลำดับ การใช้ยีนใน rRNA ในการกำหนดความสัมพันธ์ทางระหว่างชีวิตตอนนี้ยอมรับกันอย่างแพร่หลาย ตั้งแต่: มีอยู่ในทุกชีวิต มีอนุรักษ์โครงสร้างและฟังก์ชั่น และมีการรวบรวมเป็นฐานข้อมูลครอบคลุม ตามฐานข้อมูล NCBI นิวคลีโอไทด์ สามสิบสี่42(4) J. เกษตรศาสตร์ (วิทย์. nat.) 695คัดเลือกสายพันธุ์ bacillus และของ 16S rRNA ยีนลำดับถูกเรียก โดยหมายเลขลงทะเบียน (ตาราง 1) ลำดับที่ rRNA 16S ของ Escherichia coli, subsp. delbrueckii แลคโตบาซิลลัสbulgaricus และ Staphylococcus หมอเทศข้างลายยังถูกรวบรวมเพื่อใช้สำหรับวิเคราะห์ outgroup เหล่านี้ 16S rRNA ลำดับแล้วถูกแยกวิเคราะห์ลำดับหลายที่ dendogram การแก้ไข

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นวิศวกรรมซอฟต์แวร์เป็นอาร์เรย์ของรูปแบบเช่นไร การวิเคราะห์ต่างๆ และแบบจำลองโมเลกุล การสอนหลักสูตรดังกล่าวเป็นที่น่าสนใจและท้าทาย งาน การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพิจารณากรณีปัญหาที่ครอบคลุมเฉพาะบางพื้นที่ ได้แก่ การเข้าถึงฐานข้อมูลทางชีวภาพและการค้นคืน การเปรียบเทียบและการวิเคราะห์ลำดับวิวัฒนาการ . นอกจากนี้ สำรวจออกแบบ และสำหรับนอกจากนี้ยังแนะนำว่าเป็นตัวอย่างของการประยุกต์ใช้พันธุศาสตร์โมเลกุล ในขณะที่มีหลายหัวข้อที่จะจัดการกับเพราะพวกเขากำลังที่เกี่ยวข้อง มันเป็นไปได้สำหรับพวกเขาที่จะสอนในคอร์สเดียว จีนัส Bacillus ถูกเลือกศึกษากับนักเรียนได้รับมอบหมายให้รวบรวมชื่อ Bacillus สายพันธุ์เช่นเดียวกับของลำดับเบส 16S rRNA เป็นใช้ของ rRNA ยีนในการกำหนดความสัมพันธ์ระหว่างสิ่งมีชีวิต ซึ่งขณะนี้ได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวาง เนื่องจากพวกเขามีอยู่ในสิ่งมีชีวิต มีป่าสงวนโครงสร้างและหน้าที่ และพวกเขา ได้รวบรวมเป็นฐานข้อมูลที่ครอบคลุม ตามฐานข้อมูลลำดับเบส ncbi สามสิบสี่มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ . ( ชัยนาท Sci . ) 42 ( 4 ) ไม่Bacillus สายพันธุ์ถูกเลือกและลำดับเบส 16S rRNA ยีนถูกดึงโดยหมายเลขภาคยานุวัติของพวกเขา ( ตารางที่ 1 ) การลำดับเบส 16S rRNA ของ Escherichia coli , Lactobacillus delbrueckii subsp .bulgaricus และ Staphylococcus aureus ยังรวบรวมเพื่อใช้ในการวิเคราะห์กลุ่ม เหล่านี้เบส 16S rRNA ลำดับแล้วอาจมีหลายลำดับการวิเคราะห์ที่ dendogram คือ