โครงสร้างองค์กรของยีน polygalacturonase - การเข้ารหัส frompenicilliumO การแปล - โครงสร้างองค์กรของยีน polygalacturonase - การเข้ารหัส frompenicilliumO ไทย วิธีการพูด

โครงสร้างองค์กรของยีน polygalacturo

โครงสร้างองค์กรของยีน polygalacturonase - การเข้ารหัส frompenicillium

O griseoroseumandréa B . C . มาริสาแอนนิต้า ribon V queiroz และ elza F . de araújodepartamento
de microbiologia bioagro universidade Federal de viçosa viçosa
มีนัสเชไรส์บราซิล.

ระบบ pectinolytic abstractthe ของ griseoroseum penicillium ได้รับการศึกษาเป็นรุ่นที่ในการสืบสวนสอบสวน
ในทุกแง่มุมของ geneorganization เห็ด filamentous ณที่นี่เราแสดงให้เห็นว่ายีน endopolygalacturonase - การเข้ารหัสที่ก่อนหน้านี้ isolatedexist
เป็นชุดเดียวในยีนเห็ด ลบการวิเคราะห์ดีเอ็นเอเปิดเผยว่าการมีอยู่ของยีนที่เกี่ยวข้อง inother
สายพันธุ์ penicillium แม้ว่าจะเพียงหนึ่งหรือสองยีนก็พบว่าในการคัดค้าน familyreported ยีน endopg
สำหรับเห็ด filamentous อื่นๆ ซีเควนซ์ nucleotide และกรดอะมิโนของยีนที่ PG penicillium ของ
ธนาคารมีข้อมูล retrievedfrom เมื่อเทียบกับความยาวของ intron codon และจำนวนการใช้งาน
ไซต์และการเริ่มต้นซีเควนซ์ของฉันทามติ fortranslation introns ที่อยู่ในตำแหน่งเดียวกันกับที่แม้ว่าจะไม่มี oftheir
nucleotide ซีเควนซ์ของการอนุรักษ์ โดดเด่นไปด้วยตามลำดับอื่นๆคล้ายกับที่เห็นใน aspergillus neurospora ยีนและ
คำหลัก griseoroseum penicillium เห็ด filamentous pectinase polygalacturonase องค์กรยีน.
ได้รับ วันที่ 26 สิงหาคม 2002 ได้รับการยอมรับ วันที่ 14 พฤศจิกายน 2002 .
introductionthe
penicillium กะกะคือทั่วโลกมีชื่อเสียงในด้าน
ของการผลิตในกระทรวงของตนและ metabolites extracellularenzymes รอง
ของมูลค่าทางการค้าซึ่งรวมถึง thepectinases
ใช้ในอุตสาหกรรมน้ำผลไม้ในระหว่าง thestage
ของ maceration ของโถแยกกากผลไม้น้ำผลไม้กลายเป็นน้ำ ordepectinization
( Cullen และ kersten 1992 ที่ sakaguchi et al .
1992; grassin และ fauquembergue 1996 )
ระบบ pectinolytic ที่ประกอบไปด้วยหลายแบบมีห้องน้ำในตัว
zymes กระจายตัวอยู่ใน 2 กลุ่มหลัก pectinesterases ,
ซึ่งปฏิกริยาที่ De - esterification ของ methoxyl กลุ่ม ofpectin
และ depolymerases ที่ cleaveα -1,4 glycosidic ลิงค์
ช่วงวัยโดยหลักด้วยหรือบริษัทข้ามชาติ - การกำจัดเกิดปฏิกิริยา(พวกซา - ไก etal
. 1993). polygalacturonases ( PGS )มี depolymerases thatspecifically
hydrolyze glycosidic พันธบัตรของ
กรด Poly - galacturonic
การเข้ารหัสในยีนที่ PG penicillium สายพันธุ์ havebeen
จำลองไว้และลักษณะอันเนื่องจากการใช้นี้ enzymein
ที่ทางชีววิทยาการบำบัดของเสียน้ำมี pectinand
ของบทบาทในการติดเชื้อและโรคพืช( ishida et al . 1997;
วากเนอร์ et al . 2000). ความโดดเด่นที่น่าสนใจของ
การ isthe PG เชื้อราของสารตกค้างสงวนไว้บางส่วนที่มี recentlybeen
ได้รับการพิสูจน์ว่ามีความจำเป็นสำหรับการทำงานของเอนไซม์( vansanten
et al . 1999).
การลอกแบบยีนได้เปิดให้บริการรูปแบบใหม่ในการขอรับ fungalstrains
พร้อมด้วยระดับการแสดงออกทางความคิดเห็นเพิ่มมากขึ้นของโปรตีนที่
สำคัญอุตสาหกรรม areof การแนะนำของตำรวจ -
- ของยีนของดอกเบี้ยและยีน - การผสมผสานกลยุทธ์ havebeen
ใช้ในการเพิ่มการผลิตโปรตีนเช่น gluco -
amylase , endoglucanase , xylanase ,วัวอีก prochymosin ,
และมนุษย์ interleukin - 6 ( hata et al . 1991; saarelainen etal
. 1993; sánchez - Fernando Torres et al . 1994; tsuchiya et al . 1994;
gouka et al . 1996).
กลุ่มของเรายังได้รับการศึกษา
griseoroseum penicillium systemof pectinolytic เป็นระบบรุ่นสำหรับยีนหรือ -
ganization และกฎระเบียบในเห็ด filamentous isto จุดมุ่งหมายของเรา
ได้รับพันธุ์ overproducing ที่สามารถนำไปใช้ใน tx -
อุตสาหกรรมกระเบื้องที่จะ degum ไฟเบอร์จากธรรมชาติ Two genes encoding
endoPGs, pgg1 and pgg2, have been cloned and are differ-
entially expressed in response to the growth medium
(Ribon et al. 1999; Ribon et al. 2002). Studies are being
done to investigate the molecular mechanisms that control
their expression. Here we show the organization of both
genes in P. griseoroseum and compare it to the organization
of homologous DNA sequences in the genome of other
Penicillium species. Some features found in Aspergillus
and Neurospora genes are also seen in Penicillium as re-
vealed by the comparison of the structural unit of the genes
encoding PG cloned until now.
Materials and Methods
Fungal strains and inoculum production
Penicillium charlesii (CCT 4752), P. chrysogenum,
P. citrinum (CCT 3281), P. expansum, P. griseoroseum
Genetics and Molecular Biology, 25, 4, 489-493 (2002)
Copyright by the Brazilian Society of Genetics. Printed in Brazil
www.sbg.org.br
Send correspondence to: Elza F. de Araújo. E-mail: ezfa@mail.
ufv.br.
Research Article
(CCT 6241), P. italicum, P. janthinellum (CCT 3162), and
P. purpurogenum (CCT 2008) were employed in this study.
The stock cultures were maintained in glycerol at 4 °C.
Petri dishes containing minimal medium (Pontecorvo et al.
1953) covered with cellophane membrane were inoculated
with 105 conidia and incubated for two days at 28 °C. The
mycelia were removed from the cellophane for DNA ex-
traction.
DNA isolation and Southern blot
Total DNA from the Penicillium species was ex-
tracted as described by Specht et al. (1982), and cleaved
with EcoRI, SacI, and SalI. The reactions were analyzed on
0.8% agarose gel, and then transferred to Duralon mem-
branes (Stratagene) according to Sambrook et al. (1989).
The probe consisted of a DNA fragment amplified from to-
tal DNA from P. griseoroseum, purified from the gel and
radiolabelled with the Random Prime-It II Labeling Kit
(Stratagene). This fragment contains a 420-bp homologous
domain observed in endoPG genes from several filamen-
tous fungi and bacteria, and was generated as described by
Cary et al. (1995). Hybridization was carried out overnight
at 60 °C in standard hybridization buffer (Sambrook et al.
1989), washed twice with 2 X SSC, 0.1% SDS, for 20 min,
and once with 1 X SSC, 0.1% SDS for 10 min. Auto-
radiographs were made by five-day exposure of XOMAT
K film (Kodak), with an intensifying screen.
Nucleotide sequence accession number
GenBank and EMBL databases were scanned for
PG-encoding genes from Penicillium species. Seven genes
were retrieved and employed for the comparisons:
AB015286 (P. digitatum), AF047713 (P. expansum),
AF085238 and AF195790 (P. griseoroseum), D79980 (P.
janthinellum), AJ243521 and AJ243522 (P. olsonii).
Results and Discussion
Genomic organization of PG-encoding genes in
Penicillium griseoroseum
All endoPG genes described until now for filamen-
tous fungi have a homologous domain of approximately
400 bp assumed to contain residues that are relevant for PG
activity. A 420 bp-DNA fragment containing the corre-
sponding domain of P. griseoroseum was used as probe in
Southern blot analysis of the genomic DNA to investigate
the existence of an endoPG gene family in the genome of
this fungus. Few hybridizing fragments were seen even
when low stringency conditions were employed during the
hybridization step (Figure 1). Re-probing of the membrane
with the radiolabelled pgg1 and pgg2 genes was conducted
at 65 °C. The bands detected corresponded to those seen in
Figure 1 confirming the presence of only two endoPG
genes in the fungus genome (data not shown). The exis-
tence of exoPG genes is possible although not detected in
our study due to the low similarity with the endoPG genes.
As seen in Figure 1 we can conclude that the pgg1 and
pgg2 genes exist as single copies in the P. griseoroseum ge-
nome since there are no internal restriction sites for the en-
zymes EcoRI, SacI, and XbaI. Single copies have been
demonstrated for other PG genes including the clpg1 and
clpg2 genes of Colletotrichum lindemuthianum, pg1 and
pg2 of P. olsonii, and bcpg1 of Botrytis cinerea (Centis et
al. 1996; Centis et al. 1997; ten Have et al. 1998; Wagner et
al. 2000). It also seems that pgg1 and pgg2 are present in
the same copy number and that the differential levels of ex-
pression reported for these genes by Ribon et al. (2002) are
probably due to gene position in the genome. The possibil-
ity that they are controlled by different cis-acting factors is
now under investigation.
Occurrence of corresponding PG genes in other
Penicillium species
The presence of DNA sequences homologous to
endoPG genes was investigated throughout the Penicillium
species under low stringency hybridization (Figure 2). All
species tested have at least one endoPG gene. However,
most of them showed two strongly hybridizing bands, al-
though with some length polymorphism, that may corre-
spond to homologous genes. As opposed to Penicillium,
gene families consisting of at least five PG members have
been detected in Aspergillus niger, B. cinerea, and
490 Ribon et al.
Figure 1 - Southern blot analysis of total DNA from Penicillium
griseoroseum. Total DNA was digested
0/5000
จาก: -
เป็น: -
ผลลัพธ์ (ไทย) 1: [สำเนา]
คัดลอก!
โครงสร้างองค์กรของยีน polygalacturonase - การเข้ารหัส frompenicilliumO griseoroseumandréa B . C . มาริสาแอนนิต้า ribon V queiroz และ elza F . de araújodepartamentode microbiologia bioagro universidade Federal de viçosa viçosaมีนัสเชไรส์บราซิล. ระบบ pectinolytic abstractthe ของ griseoroseum penicillium ได้รับการศึกษาเป็นรุ่นที่ในการสืบสวนสอบสวนในทุกแง่มุมของ geneorganization เห็ด filamentous ณที่นี่เราแสดงให้เห็นว่ายีน endopolygalacturonase - การเข้ารหัสที่ก่อนหน้านี้ isolatedexistเป็นชุดเดียวในยีนเห็ด ลบการวิเคราะห์ดีเอ็นเอเปิดเผยว่าการมีอยู่ของยีนที่เกี่ยวข้อง inotherสายพันธุ์ penicillium แม้ว่าจะเพียงหนึ่งหรือสองยีนก็พบว่าในการคัดค้าน familyreported ยีน endopgสำหรับเห็ด filamentous อื่นๆ ซีเควนซ์ nucleotide และกรดอะมิโนของยีนที่ PG penicillium ของธนาคารมีข้อมูล retrievedfrom เมื่อเทียบกับความยาวของ intron codon และจำนวนการใช้งานไซต์และการเริ่มต้นซีเควนซ์ของฉันทามติ fortranslation introns ที่อยู่ในตำแหน่งเดียวกันกับที่แม้ว่าจะไม่มี oftheirnucleotide ซีเควนซ์ของการอนุรักษ์ โดดเด่นไปด้วยตามลำดับอื่นๆคล้ายกับที่เห็นใน aspergillus neurospora ยีนและ คำหลัก griseoroseum penicillium เห็ด filamentous pectinase polygalacturonase องค์กรยีน. ได้รับ วันที่ 26 สิงหาคม 2002 ได้รับการยอมรับ วันที่ 14 พฤศจิกายน 2002 . introductionthepenicillium กะกะคือทั่วโลกมีชื่อเสียงในด้านของการผลิตในกระทรวงของตนและ metabolites extracellularenzymes รองของมูลค่าทางการค้าซึ่งรวมถึง thepectinasesใช้ในอุตสาหกรรมน้ำผลไม้ในระหว่าง thestageของ maceration ของโถแยกกากผลไม้น้ำผลไม้กลายเป็นน้ำ ordepectinization( Cullen และ kersten 1992 ที่ sakaguchi et al . 1992; grassin และ fauquembergue 1996 ) ระบบ pectinolytic ที่ประกอบไปด้วยหลายแบบมีห้องน้ำในตัวzymes กระจายตัวอยู่ใน 2 กลุ่มหลัก pectinesterases ,ซึ่งปฏิกริยาที่ De - esterification ของ methoxyl กลุ่ม ofpectinและ depolymerases ที่ cleaveα -1,4 glycosidic ลิงค์ช่วงวัยโดยหลักด้วยหรือบริษัทข้ามชาติ - การกำจัดเกิดปฏิกิริยา(พวกซา - ไก etal. 1993). polygalacturonases ( PGS )มี depolymerases thatspecificallyhydrolyze glycosidic พันธบัตรของกรด Poly - galacturonic การเข้ารหัสในยีนที่ PG penicillium สายพันธุ์ havebeenจำลองไว้และลักษณะอันเนื่องจากการใช้นี้ enzymeinที่ทางชีววิทยาการบำบัดของเสียน้ำมี pectinandของบทบาทในการติดเชื้อและโรคพืช( ishida et al . 1997;วากเนอร์ et al . 2000). ความโดดเด่นที่น่าสนใจของการ isthe PG เชื้อราของสารตกค้างสงวนไว้บางส่วนที่มี recentlybeenได้รับการพิสูจน์ว่ามีความจำเป็นสำหรับการทำงานของเอนไซม์( vansantenet al . 1999).การลอกแบบยีนได้เปิดให้บริการรูปแบบใหม่ในการขอรับ fungalstrainsพร้อมด้วยระดับการแสดงออกทางความคิดเห็นเพิ่มมากขึ้นของโปรตีนที่สำคัญอุตสาหกรรม areof การแนะนำของตำรวจ -- ของยีนของดอกเบี้ยและยีน - การผสมผสานกลยุทธ์ havebeenใช้ในการเพิ่มการผลิตโปรตีนเช่น gluco -amylase , endoglucanase , xylanase ,วัวอีก prochymosin ,และมนุษย์ interleukin - 6 ( hata et al . 1991; saarelainen etal. 1993; sánchez - Fernando Torres et al . 1994; tsuchiya et al . 1994;gouka et al . 1996).กลุ่มของเรายังได้รับการศึกษาgriseoroseum penicillium systemof pectinolytic เป็นระบบรุ่นสำหรับยีนหรือ -ganization และกฎระเบียบในเห็ด filamentous isto จุดมุ่งหมายของเราได้รับพันธุ์ overproducing ที่สามารถนำไปใช้ใน tx -อุตสาหกรรมกระเบื้องที่จะ degum ไฟเบอร์จากธรรมชาติ Two genes encodingendoPGs, pgg1 and pgg2, have been cloned and are differ-entially expressed in response to the growth medium(Ribon et al. 1999; Ribon et al. 2002). Studies are beingdone to investigate the molecular mechanisms that controltheir expression. Here we show the organization of bothgenes in P. griseoroseum and compare it to the organizationof homologous DNA sequences in the genome of otherPenicillium species. Some features found in Aspergillusand Neurospora genes are also seen in Penicillium as re-vealed by the comparison of the structural unit of the genesencoding PG cloned until now.Materials and MethodsFungal strains and inoculum productionPenicillium charlesii (CCT 4752), P. chrysogenum,P. citrinum (CCT 3281), P. expansum, P. griseoroseumGenetics and Molecular Biology, 25, 4, 489-493 (2002)Copyright by the Brazilian Society of Genetics. Printed in Brazilwww.sbg.org.brSend correspondence to: Elza F. de Araújo. E-mail: ezfa@mail.ufv.br.
Research Article
(CCT 6241), P. italicum, P. janthinellum (CCT 3162), and
P. purpurogenum (CCT 2008) were employed in this study.
The stock cultures were maintained in glycerol at 4 °C.
Petri dishes containing minimal medium (Pontecorvo et al.
1953) covered with cellophane membrane were inoculated
with 105 conidia and incubated for two days at 28 °C. The
mycelia were removed from the cellophane for DNA ex-
traction.
DNA isolation and Southern blot
Total DNA from the Penicillium species was ex-
tracted as described by Specht et al. (1982), and cleaved
with EcoRI, SacI, and SalI. The reactions were analyzed on
0.8% agarose gel, and then transferred to Duralon mem-
branes (Stratagene) according to Sambrook et al. (1989).
The probe consisted of a DNA fragment amplified from to-
tal DNA from P. griseoroseum, purified from the gel and
radiolabelled with the Random Prime-It II Labeling Kit
(Stratagene). This fragment contains a 420-bp homologous
domain observed in endoPG genes from several filamen-
tous fungi and bacteria, and was generated as described by
Cary et al. (1995). Hybridization was carried out overnight
at 60 °C in standard hybridization buffer (Sambrook et al.
1989), washed twice with 2 X SSC, 0.1% SDS, for 20 min,
and once with 1 X SSC, 0.1% SDS for 10 min. Auto-
radiographs were made by five-day exposure of XOMAT
K film (Kodak), with an intensifying screen.
Nucleotide sequence accession number
GenBank and EMBL databases were scanned for
PG-encoding genes from Penicillium species. Seven genes
were retrieved and employed for the comparisons:
AB015286 (P. digitatum), AF047713 (P. expansum),
AF085238 and AF195790 (P. griseoroseum), D79980 (P.
janthinellum), AJ243521 and AJ243522 (P. olsonii).
Results and Discussion
Genomic organization of PG-encoding genes in
Penicillium griseoroseum
All endoPG genes described until now for filamen-
tous fungi have a homologous domain of approximately
400 bp assumed to contain residues that are relevant for PG
activity. A 420 bp-DNA fragment containing the corre-
sponding domain of P. griseoroseum was used as probe in
Southern blot analysis of the genomic DNA to investigate
the existence of an endoPG gene family in the genome of
this fungus. Few hybridizing fragments were seen even
when low stringency conditions were employed during the
hybridization step (Figure 1). Re-probing of the membrane
with the radiolabelled pgg1 and pgg2 genes was conducted
at 65 °C. The bands detected corresponded to those seen in
Figure 1 confirming the presence of only two endoPG
genes in the fungus genome (data not shown). The exis-
tence of exoPG genes is possible although not detected in
our study due to the low similarity with the endoPG genes.
As seen in Figure 1 we can conclude that the pgg1 and
pgg2 genes exist as single copies in the P. griseoroseum ge-
nome since there are no internal restriction sites for the en-
zymes EcoRI, SacI, and XbaI. Single copies have been
demonstrated for other PG genes including the clpg1 and
clpg2 genes of Colletotrichum lindemuthianum, pg1 and
pg2 of P. olsonii, and bcpg1 of Botrytis cinerea (Centis et
al. 1996; Centis et al. 1997; ten Have et al. 1998; Wagner et
al. 2000). It also seems that pgg1 and pgg2 are present in
the same copy number and that the differential levels of ex-
pression reported for these genes by Ribon et al. (2002) are
probably due to gene position in the genome. The possibil-
ity that they are controlled by different cis-acting factors is
now under investigation.
Occurrence of corresponding PG genes in other
Penicillium species
The presence of DNA sequences homologous to
endoPG genes was investigated throughout the Penicillium
species under low stringency hybridization (Figure 2). All
species tested have at least one endoPG gene. However,
most of them showed two strongly hybridizing bands, al-
though with some length polymorphism, that may corre-
spond to homologous genes. As opposed to Penicillium,
gene families consisting of at least five PG members have
been detected in Aspergillus niger, B. cinerea, and
490 Ribon et al.
Figure 1 - Southern blot analysis of total DNA from Penicillium
griseoroseum. Total DNA was digested
การแปล กรุณารอสักครู่..
ผลลัพธ์ (ไทย) 2:[สำเนา]
คัดลอก!
โครงสร้างองค์กรของยีน polygalacturonase - การเข้ารหัส frompenicillium O griseoroseumandréa B C มาริสาแอนนิต้า Ribon V Queiroz และ Elza F เดaraújodepartamento เด Microbiologia Bioagro Universidade ชาติเดอviçosaviçosa มีนัสเชไรส์บราซิล. ระบบ pectinolytic abstractthe ของ griseoroseum Penicillium geneorganization เห็ดใย ณ ที่นี่เราแสดงให้เห็นว่ายีน endopolygalacturonase - การเข้ารหัสที่ก่อนหน้านี้ isolatedexist เป็นชุดเดียวในยีนเห็ด inother สายพันธุ์ Penicillium familyreported ยีน endopg สำหรับเห็ดเส้นใยอื่น ๆ ซีเควนซ์เบสและกรดอะมิโนของยีนที่ PG Penicillium ของธนาคารมีข้อมูล retrievedfrom เมื่อเทียบกับความยาวของ Intron codon fortranslation introns oftheir เบื่อหน่ายซีเควนซ์ของการอนุรักษ์ Aspergillus Neurospora ยีนและคำหลัก griseoroseum Penicillium เห็ดเส้นใยเพคติเน polygalacturonase องค์กรยีน. ได้รับวันที่ 26 สิงหาคม 2002 ได้รับการยอมรับวันที่ 14 พฤศจิกายน 2002. introductionthe Penicillium สาร extracellularenzymes รองของมูลค่าทางการค้าซึ่งรวมถึง thestage ของยุ่ย ordepectinization (คัลเลนและเกอร์สเตน 1992 ที่ซาคา et al. 1992; Grassin และ fauquembergue 1996) ระบบ pectinolytic กระจายตัวอยู่ใน 2 กลุ่มหลัก pectinesterases, ซึ่งปฏิกริยาที่ De - esterification ของเมท ธ อกซิกลุ่ม ofpectin และ depolymerases ที่cleaveα -1,4 glycosidic - การกำจัดเกิดปฏิกิริยา (พวกซา - ไกอีตัล. 1993) polygalacturonases (PGS) มี depolymerases thatspecifically Hydrolyze glycosidic พันธบัตรของกรดโพลี - กาแลคการเข้ารหัสในยีนที่ PG Penicillium สายพันธุ์ pectinand ของบทบาทในการติดเชื้อและโรคพืช (ishida, et al. 1997; . วากเนอร์และคณะ 2000) ความโดดเด่นที่น่าสนใจของการ isthe PG vansanten และคณะ areof การแนะนำของตำรวจ - - ของยีนของดอกเบี้ยและยีน - การผสมผสานกลยุทธ์ havebeen ใช้ในการเพิ่มการผลิตโปรตีนเช่น Gluco - อะไมเลส, endoglucanase, ไซลาเนส, วัวอีก prochymosin, และมนุษย์ interleukin - 6 (แม้กระทั่ง et al, 1991. saarelainen อีตั. 1993; Sánchez - เฟอร์นันโดตอร์เร et al, 1994; Tsuchiya et al, 1994;.. Gouka และคณะ Penicillium ในระบบ pectinolytic เป็นระบบรุ่นสำหรับยีนหรือ - รูปแบบการจัดตั้งและกฎระเบียบในเห็ดเมืองใยจุดมุ่งหมายของเราได้รับพันธุ์ overproducing ที่สามารถนำไปใช้ในเท็กซัส - อุตสาหกรรมกระเบื้องที่จะ degum ไฟเบอร์จากธรรมชาติยีนสองเข้ารหัสendoPGs, pgg1 และ pgg2 ได้รับการโคลนและจะแตกต่างกันแสดง entially ในการตอบสนองต่อสื่อการเจริญเติบโต(Ribon et al, 1999;.. Ribon et al, 2002). การศึกษามีการดำเนินการเพื่อตรวจสอบกลไกระดับโมเลกุลที่มีการควบคุม. การแสดงออกของพวกเขาที่นี่เราแสดงองค์กรของ ทั้งยีนใน griseoroseum P. และเปรียบเทียบกับองค์กรของลำดับดีเอ็นเอคล้ายคลึงกันในจีโนมของอื่น ๆสายพันธุ์ Penicillium. คุณลักษณะบางอย่างที่พบใน Aspergillus และยีน Neurospora จะเห็นยังอยู่ใน Penicillium เป็นทบทวนvealed โดยเปรียบเทียบของหน่วยโครงสร้างของ ยีนเข้ารหัส PG โคลนจนถึงขณะนี้. วัสดุและวิธีการเชื้อราสายพันธุ์และการผลิตหัวเชื้อPenicillium charlesii (CCT 4752), P. chrysogenum, P. citrinum (CCT 3281), P. expansum, P. griseoroseum พันธุศาสตร์และอณูชีววิทยา, 25, 4, 489-493 (2002) ลิขสิทธิ์โดยสมาคมบราซิลพันธุศาสตร์ พิมพ์ในบราซิลwww.sbg.org.br ส่งจดหมายไปที่: Elza เดเอฟAraújo E-mail:. ezfa อีเมล @ ufv.br. บทความวิจัย(CCT 6241), P. italicum, P. janthinellum (CCT 3162) และP. purpurogenum (CCT 2008) ถูกว่าจ้างในการศึกษาครั้งนี้. หุ้นวัฒนธรรมที่ได้รับการเก็บรักษาไว้ในกลีเซอรอลที่ 4 ° C. จานเลี้ยงเชื้อที่มีขนาดกลางน้อยที่สุด (Pontecorvo et al. 1953) ปกคลุมด้วยเยื่อกระดาษแก้วถูกเชื้อกับ 105 สปอร์และบ่มเป็นเวลาสองวันที่ 28 ° C เส้นใยที่ถูกถอดออกจากกระดาษแก้วสำหรับอดีตดีเอ็นเอฉุด. การแยกดีเอ็นเอและภาคใต้เปื้อนดีเอ็นเอรวมจากสายพันธุ์ที่ได้รับการ Penicillium อดีตtracted ตามที่อธิบายไว้โดย Specht และคณะ (1982) และเกาะติดอยู่กับ EcoRI, SACI และสาลี่ ปฏิกิริยาที่ได้มาวิเคราะห์ใน0.8% agarose เจลและโอนไปแล้ว Duralon กั้นBranes (Stratagene) ตาม Sambrook et al, (1989). การสอบสวนประกอบด้วยชิ้นดีเอ็นเอขยายจากจำาดีเอ็นเอตาลจาก P. griseoroseum, บริสุทธิ์จากเจลและรังสีที่มีการสุ่มนายกรัฐมนตรี-มัน ii ฉลาก Kit (Stratagene) ส่วนนี้มีความคล้ายคลึงกัน 420 bp โดเมนสังเกตในยีน endoPG จากหลาย filamen- tous เชื้อราและแบคทีเรียและถูกสร้างขึ้นตามที่อธิบายไว้โดยแครีและคณะ (1995) การผสมพันธุ์ได้ดำเนินการในชั่วข้ามคืนที่ 60 ° C ในบัฟเฟอร์การผสมข้ามพันธุ์มาตรฐาน (Sambrook et al. 1989), การล้างครั้งที่สองมี 2 SSC X 0.1% SDS, 20 นาที, และครั้งเดียวกับ SSC 1 X 0.1% SDS เป็นเวลา 10 นาที อัตโนมัติฉายรังสีจะถูกสร้างขึ้นมาจากการสัมผัสห้าวันของ XOMAT ภาพยนตร์ K (Kodak) กับทวีความรุนแรงหน้าจอ. เบสหมายเลขภาคยานุวัติลำดับGenBank และฐานข้อมูล EMBL ถูกสแกนสำหรับPG-เข้ารหัสยีนจากสายพันธุ์ Penicillium เซเว่นยีนที่ถูกดึงและการจ้างงานสำหรับการเปรียบเทียบ: AB015286 (P. digitatum) AF047713 (P. expansum) AF085238 และ AF195790 (P. griseoroseum) D79980 (P. janthinellum) AJ243521 และ AJ243522 (P. olsonii). ผล และอภิปรายองค์กรจีโนมของ PG-เข้ารหัสยีนในPenicillium griseoroseum ยีน endoPG ทั้งหมดที่อธิบายไว้จนตอนนี้สำหรับ filamen- เชื้อรา tous มีโดเมนคล้ายคลึงกันประมาณ400 bp สันนิษฐานว่าจะมีสารตกค้างที่เกี่ยวข้องสำหรับ PG กิจกรรม ส่วน 420 bp ดีเอ็นเอที่มี corre- โดเมน sponding ของพี griseoroseum ถูกนำมาใช้เป็น probe ในการวิเคราะห์ blot ภาคใต้ของดีเอ็นเอในการตรวจสอบการดำรงอยู่ของครอบครัวยีน endoPG ในจีโนมของเชื้อราชนิดนี้ ไม่กี่ชิ้นส่วน hybridizing ได้เห็นแม้กระทั่งเมื่อมีเงื่อนไขเข้มงวดต่ำเป็นลูกจ้างในระหว่างขั้นตอนการผสมข้ามพันธุ์ (รูปที่ 1) Re-ละเอียดของเมมเบรนที่มี pgg1 รังสีและยีน pgg2 ได้ดำเนินการที่ 65 ° C วงตรวจพบตรงกับที่เห็นในรูปที่ 1 ยืนยันการปรากฏตัวของเพียงสอง endoPG ยีนในจีโนมเชื้อรา (ไม่ได้แสดงข้อมูล) exis- Tence ของยีน exoPG เป็นไปได้แม้ว่าจะไม่ได้พบในการศึกษาของเราเนื่องจากความคล้ายคลึงกันต่ำที่มียีน endoPG. เท่าที่เห็นในรูปที่ 1 เราสามารถสรุปได้ว่า pgg1 และยีน pgg2 อยู่เป็นเล่มเดียวใน P. griseoroseum ge- โนเนื่องจากไม่มีข้อ จำกัด เว็บไซต์ภายในสำหรับ en- EcoRI Zymes, SACI และ XbaI สำเนาเดี่ยวได้รับการแสดงให้เห็นถึงยีนอื่น ๆ PG รวมทั้ง clpg1 และยีน clpg2 ของ Colletotrichum lindemuthianum PG1 และพีจี 2 ของพี olsonii และ bcpg1 Botrytis cinerea ของ (Centis และอัล 1996;. Centis, et al. 1997; สิบมีและคณะ 1998; แว็กเนอร์และอัล 2000). นอกจากนี้ยังดูเหมือนว่า pgg1 และ pgg2 ที่มีอยู่ในจำนวนสำเนาเดียวกันและว่าระดับความแตกต่างของอดีตpression รายงานยีนเหล่านี้โดย Ribon และคณะ (2002) เป็นอาจเป็นเพราะตำแหน่งของยีนในจีโนม possibil- ity ว่าพวกเขาจะถูกควบคุมโดยปัจจัยที่ถูกต้องทำหน้าที่แตกต่างกันคือตอนนี้อยู่ระหว่างการสอบสวน. เกิดที่สอดคล้องยีน PG อื่น ๆ ในสายพันธุ์ Penicillium การปรากฏตัวของดีเอ็นเอลำดับคล้ายคลึงกันเพื่อendoPG ยีนถูกตรวจสอบตลอด Penicillium สายพันธุ์ภายใต้การผสมพันธุ์เข้มงวดต่ำ (รูปที่ 2 ) ทุกสายพันธุ์ที่ผ่านการทดสอบมีอย่างน้อยหนึ่งยีน endoPG แต่ส่วนใหญ่ของพวกเขาแสดงให้เห็นว่าสองวง hybridizing อย่างยิ่งอัลแม้ว่าจะมีความแตกต่างความยาวบางที่อาจ corre- spond ยีนคล้ายคลึงกัน เมื่อเทียบกับ Penicillium, ครอบครัวยีนประกอบด้วยอย่างน้อยห้าสมาชิก PG ได้รับการตรวจพบในประเทศไนเจอร์ Aspergillus, ซีเนเรียบีและ490 Ribon et al. รูปที่ 1 - การวิเคราะห์ blot ภาคใต้ของดีเอ็นเอทั้งหมดจาก Penicillium griseoroseum ดีเอ็นเอทั้งหมดถูกย่อย

























































































































































การแปล กรุณารอสักครู่..
ผลลัพธ์ (ไทย) 3:[สำเนา]
คัดลอก!
โครงสร้างองค์กรของยีน polygalacturonase - การเข้ารหัส frompenicillium

o griseoroseumandr é B . C . มาริสาแอนนิต้าออกวี เคยรอซและ elza F . เดออาราú jodepartamento
de microbiologia bioagro มหาวิทยาลัย 6 5 6 5 เอ เอ
มีนัสเชไรส์บราซิล .

ระบบเพกทิโนไลติกบทคัดย่อของ griseoroseum Penicillium ได้รับการศึกษาเป็นรุ่นที่ในการสืบสวนสอบสวน
ในทุกแง่มุมของ geneorganization เห็ดเป็นณที่นี่เราแสดงให้เห็นว่ายีน endopolygalacturonase - การเข้ารหัสที่ก่อนหน้านี้ isolatedexist
เป็นชุดเดียวในยีนเห็ดลบการวิเคราะห์ดีเอ็นเอเปิดเผยว่าการมีอยู่ของยีนที่เกี่ยวข้องมา
สายพันธุ์ Penicillium แม้ว่าจะเพียงหนึ่งหรือสองยีนก็พบว่าในการคัดค้าน familyreported ยีน endopg
สำหรับเห็ดเป็นอื่นๆซีเควนซ์นิวคลีโอไทด์และกรดอะมิโนของยีนที่ PG Penicillium ของ
ธนาคารมีข้อมูล retrievedfrom เมื่อเทียบกับความยาวของ iNtRON codon และจำนวนการใช้งาน
ไซต์และการเริ่มต้นซีเควนซ์ของฉันทามติ fortranslation introns ที่อยู่ในตำแหน่งเดียวกันกับที่แม้ว่าจะไม่มีของนิวคลีโอไทด์ซีเควนซ์ของการอนุรักษ์โดดเด่นไปด้วยตามลำดับอื่นๆคล้ายกับที่เห็นใน Aspergillus บอดยีนและ

คำหลัก griseoroseum Penicillium เห็ดเอนไซม์ polygalacturonase เป็นองค์กรยีน .
ได้รับวันที่ 26 สิงหาคม 2545 ได้รับการยอมรับ 14 วันที่พฤศจิกายน 2002


introductionthe Penicillium กะกะคือทั่วโลกมีชื่อเสียงในด้านของการผลิตในกระทรวงของตนและสาร extracellularenzymes ทำงานล่อ

ของมูลค่าทางการค้าซึ่งรวมถึง thepectinases ใช้ในอุตสาหกรรมน้ำผลไม้ในระหว่างชั้นพิจารณาของยุ่ยของโถแยกกากผลไม้น้ำผลไม้กลายเป็นน้ำ ordepectinization

การแปล กรุณารอสักครู่..
 
ภาษาอื่น ๆ
การสนับสนุนเครื่องมือแปลภาษา: กรีก, กันนาดา, กาลิเชียน, คลิงออน, คอร์สิกา, คาซัค, คาตาลัน, คินยารวันดา, คีร์กิซ, คุชราต, จอร์เจีย, จีน, จีนดั้งเดิม, ชวา, ชิเชวา, ซามัว, ซีบัวโน, ซุนดา, ซูลู, ญี่ปุ่น, ดัตช์, ตรวจหาภาษา, ตุรกี, ทมิฬ, ทาจิก, ทาทาร์, นอร์เวย์, บอสเนีย, บัลแกเรีย, บาสก์, ปัญจาป, ฝรั่งเศส, พาชตู, ฟริเชียน, ฟินแลนด์, ฟิลิปปินส์, ภาษาอินโดนีเซี, มองโกเลีย, มัลทีส, มาซีโดเนีย, มาราฐี, มาลากาซี, มาลายาลัม, มาเลย์, ม้ง, ยิดดิช, ยูเครน, รัสเซีย, ละติน, ลักเซมเบิร์ก, ลัตเวีย, ลาว, ลิทัวเนีย, สวาฮิลี, สวีเดน, สิงหล, สินธี, สเปน, สโลวัก, สโลวีเนีย, อังกฤษ, อัมฮาริก, อาร์เซอร์ไบจัน, อาร์เมเนีย, อาหรับ, อิกโบ, อิตาลี, อุยกูร์, อุสเบกิสถาน, อูรดู, ฮังการี, ฮัวซา, ฮาวาย, ฮินดี, ฮีบรู, เกลิกสกอต, เกาหลี, เขมร, เคิร์ด, เช็ก, เซอร์เบียน, เซโซโท, เดนมาร์ก, เตลูกู, เติร์กเมน, เนปาล, เบงกอล, เบลารุส, เปอร์เซีย, เมารี, เมียนมา (พม่า), เยอรมัน, เวลส์, เวียดนาม, เอสเปอแรนโต, เอสโทเนีย, เฮติครีโอล, แอฟริกา, แอลเบเนีย, โคซา, โครเอเชีย, โชนา, โซมาลี, โปรตุเกส, โปแลนด์, โยรูบา, โรมาเนีย, โอเดีย (โอริยา), ไทย, ไอซ์แลนด์, ไอร์แลนด์, การแปลภาษา.

Copyright ©2024 I Love Translation. All reserved.

E-mail: