A data set of 46 studied flavone in

A data set of 46 studied flavone inhibitors of ALR2 was selected from the published literature [17]. The ALR2 inhibitory activity of the selected molecules was reported as pIC50 value in the literature, which corresponds to the negative logarithm of dose required to produce 50% ALR2 inhibition (−log IC50). The ALR2 inhibitory activity of the selected molecules was determined using a same experimental protocol, and pIC50 value spanned over a wide range, i.e. 7.55–3.00. The chemical structures of all molecules were sketched using “builder tools” option of “Maestro” program version 9.3 [31], and then their 3D geometries were energy optimized in “LigPrep” program version 2.5 [32] using “OPLS_2005” force field [33]. The least energy conformers of all molecules were generated employing ‘systematic torsional sampling’ algorithm, and thereafter the ionic states were generated at pH value of 7.0 ± 0.2—a pH value used during ALR2 activity (pIC50) determination of 46 studied molecules

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ชุดข้อมูลของ inhibitors flavone ศึกษา 46 ของ ALR2 ถูกเลือกจากเอกสารประกอบการเผยแพร่ [17] มีรายงานกิจกรรม ALR2 ลิปกลอสไขของโมเลกุลที่เลือกเป็นค่า pIC50 ในวรรณคดี ซึ่งสอดคล้องกับลอการิทึมของปริมาณที่ต้องผลิต 50% ALR2 ยับยั้ง (−log IC50) ลบ ลิปกลอสไขกิจกรรม ALR2 ของโมเลกุลที่เลือกถูกกำหนดโดยใช้โพรโทคอลการทดลองเดียวกัน และขยายช่วงกว้าง เช่น 7.55 – 3.00 ค่า pIC50 โครงสร้างทางเคมีของโมเลกุลทั้งหมดได้ร่างแผนโดยใช้ตัวเลือก "เครื่องมือสร้าง" ของ "Maestro" โปรแกรมเวอร์ชัน 9.3 [31], แล้ว รูปทรงเรขาคณิต 3 มิติการมีพลังงานที่สุดใน "LigPrep" โปรแกรมเวอร์ชัน 2.5 [32] โดยใช้ฟิลด์บังคับ "OPLS_2005" [33] Conformers พลังงานน้อยที่สุดของโมเลกุลทั้งหมดสร้างขึ้นใช้ 'ระบบสุ่ม torsional' อัลกอริทึม และหลังจากนั้นอเมริกา ionic สร้างขึ้นที่ค่า pH 7.0 ± 0.2 ซึ่งค่า pH ที่ใช้ในระหว่างการกำหนดกิจกรรม (pIC50) ALR2 โมเลกุลศึกษา 46

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ชุดข้อมูลของสารยับยั้งการศึกษา 46 flavone ของ ALR2 ได้รับเลือกจากวรรณกรรมที่ตีพิมพ์ [17] กิจกรรมการยับยั้ง ALR2 ของโมเลกุลที่เลือกได้รับรายงานว่าค่า pIC50 ในวรรณคดีซึ่งสอดคล้องกับลอการิทึมเชิงลบของยาที่จำเป็นในการผลิต 50% การยับยั้ง ALR2 (IC50 -log) กิจกรรมการยับยั้ง ALR2 ของโมเลกุลที่เลือกถูกกำหนดโดยใช้โปรโตคอลเดียวกันการทดลองและความคุ้มค่า pIC50 ทอดในช่วงที่กว้างคือ 7.55-3.00 โครงสร้างทางเคมีของโมเลกุลทั้งหมดถูกร่างโดยใช้ "เครื่องมือสร้าง" ตัวเลือกของ "เกจิ" โปรแกรมเวอร์ชัน 9.3 [31] และจากนั้นรูปทรง 3 มิติของพวกเขาถูกพลังงานที่ดีที่สุดใน "LigPrep" โปรแกรมเวอร์ชัน 2.5 [32] การใช้ "OPLS_2005" สนามพลัง [ 33] อย่างน้อย conformers พลังงานของโมเลกุลถูกสร้างอัลกอริทึมการจ้าง 'ระบบการสุ่มตัวอย่างบิด' และหลังจากนั้นรัฐอิออนที่ถูกสร้างขึ้นที่ค่าพีเอช 7.0 ± 0.2 ค่าพีเอชที่ใช้ในระหว่างกิจกรรม ALR2 (pIC50) กำหนด 46 ศึกษาโมเลกุล

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ชุดข้อมูล 46 เรียนฟลาโวนน alr2 ได้รับเลือกจากการตีพิมพ์วรรณกรรม [ 17 ] การ alr2 ยับยั้งกิจกรรมของโมเลกุลที่ถูกรายงานว่าเป็น pic50 คุณค่าในวรรณคดี ซึ่งสอดคล้องกับลอการิทึมเชิงลบของยาต้องผลิต 50% alr2 ยับยั้ง ( − log ic50 )การ alr2 ยับยั้งกิจกรรมของโมเลกุลที่ถูกกำหนดโดยใช้โปรโตคอลการทดลองเดียวกัน และ pic50 มูลค่าถูกมากกว่าที่หลากหลาย เช่น ทุน - 3.00 . โครงสร้างทางเคมีของโมเลกุลเป็นร่างที่ใช้สร้าง " เครื่องมือ " เลือก " มาสเตอร์ " โปรแกรมเวอร์ชั่น 9.3 [ 31 ] , และรูปแบบ 3D ของพวกเขาจัดการพลังงานใน " ligprep โปรแกรม " รุ่นที่ 25 [ 32 ] ใช้ " opls_2005 " สนามพลัง [ 33 ] พลังงานน้อย โครงสร้างของโมเลกุลถูกสร้างขึ้นโดยการบิดตัวอย่าง ' ' ขั้นตอนวิธี และหลังจากนั้นรัฐไอออนที่ถูกสร้างขึ้นที่ค่า pH 7.0 ± 0.2-a ค่า pH ที่ใช้ในกิจกรรม alr2 ( 46 ) pic50 ) การวิเคราะห์โมเลกุล