Derivation of fMaSC- and fSTR-Speci

Derivation of fMaSC- and fSTR-Specific Gene
Expression Signatures
We performed microarray expression analyses on the fMaSC,
fSTR, and aMaSC populations to ascertain molecular pathways
with potential relevance to fetal mammary development, fMaSC
biology, and breast cancer. We obtained reproducible expres-
sion profiles from independent biological pools representing
each population and identified differentially expressed genes
comprising fMaSC, fSTR, and aMaSC signatures (Figure 3A
and Table S4; significance analysis of microarrays; false
discovery rate (FDR) < 10%; [Tusher et al., 2001]). We identified
869 unique genes more highly expressed in the fMaSC popula-
tion (the fMaSC signature) than in the fSTR and 812 unique genes
more highly expressed in the fSTR population (the fSTR signa-
ture) than in the fMaSC. Among the fMaSC signature genes,

34% were common to both the fMaSC and aMaSC popula-
tionswhen compared to fSTR, but
40%were significantly over-
expressed in the fMaSC relative to the aMaSC (Figure 3A).
We confirmed the differential gene expression patterns
between the fMaSC and fSTR populations on a panel of genes
selected from putative stem cell, developmental, and cancer
relevant pathways (Figures 3B and 3C). Furthermore, high-
throughput single-cell qRT-PCR analyses confirmed expression
of a partially overlapping selection of 46 genes in individual cells
of the fMaSC population (Figure 3D). This approach also verified
that individual fetal cells coexpress luminal keratins, myoepithe-
lial keratins, and vimentin (Figure 3D).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มาของ fMaSC - และ fSTR-Specific ยีนลายเซ็นของนิพจน์เราทำ microarray วิเคราะห์นิพจน์บน fMaSCfSTR และ aMaSC ประชากรการตรวจระดับโมเลกุลมนต์ที่อาจเกี่ยวข้องกับพัฒนาทางหน้าอกและทารกในครรภ์ fMaSCชีววิทยา และมะเร็งเต้านม เราได้จำลอง expres-น profiles จากกลุ่มชีวภาพอิสระแทนแต่ละประชากรและยีน identified differentially แสดงประกอบด้วยลายเซ็น fMaSC, fSTR และ aMaSC (รูปที่ 3Aและ S4 significance วิเคราะห์ microarrays เป็นเท็จค้นพบอัตรา (FDR) < 10% [Tusher et al., 2001]) เรา identified869 เฉพาะยีนมากกว่าแสดงใน fMaSC populaสเตรชัน (ลายเซ็น fMaSC) มากกว่าในการ fSTR และยีนเฉพาะ 812แสดงมากกว่าในประชากร fSTR (fSTR signa-ture) มากกว่าในการ fMaSC ระหว่างยีนลายเซ็น fMaSC34% มีทั่วไปทั้ง fMaSC และ aMaSC popula-tionswhen เปรียบเทียบกับ fSTR แต่ 40% ไม่เกิน significantly-แสดงใน fMaSC สัมพันธ์ aMaSC (รูปที่ 3A)เรา confirmed รูปแบบนิพจน์ของยีนที่แตกต่างระหว่างประชากร fMaSC และ fSTR บนแผงของยีนเลือกจากเซลล์ต้นกำเนิด putative พัฒนา และโรคมะเร็งหลักที่เกี่ยวข้อง (ตัวเลข 3B และ 3C) นอกจากนี้ สูง-นิพจน์สามารถประมวลผลได้เซลล์เดียว qRT PCR วิเคราะห์ confirmedเลือกที่ทับซ้อนกันบางส่วนของยีน 46 ในเซลล์แต่ละเซลล์ประชากร fMaSC (ภาพ 3D) นี้เข้า verifiedว่า เซลล์แต่ละครรภ์ coexpress luminal keratins, myoepithe-lial keratins และ vimentin (ภาพ 3D)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รากศัพท์ของ fmasc - fstr speci ถ่ายทอดยีนการแสดงออกลายเซ็น

C เราแสดงสีหน้า microarray วิเคราะห์บน fmasc
fstr , และ amasc ประชากรวินิจฉัยโมเลกุลเซลล์
ที่มีศักยภาพที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาของต่อมน้ำนม ชีววิทยา fmasc
และมะเร็งเต้านม เราได้รับ expres ) -
Sion Pro จึงเลสจากอิสระชีวภาพแทน
สระแต่ละประชากรและ identi จึงเอ็ดแสดงออกแตกต่างกันยีน
ประกอบด้วย fmasc fstr , และลายเซ็น amasc ( รูปที่ 3A
และตาราง S4 ; signi ถ่ายทอดมะเร็งการวิเคราะห์การแสดง ; อัตราการค้นพบเท็จ
( FDR ) < 10% ; [ tusher et al . , 2544 ) เรา identi จึงเอ็ด
แต่เฉพาะยีนเพิ่มเติมขอแสดงใน fmasc ประชากร -
tion ( fmasc ลายเซ็น ) กว่าใน fstr 812 ยีนเฉพาะตัว
และเพิ่มเติมขอแสดงใน fstr ประชากร ( fstr ซิกน่า -
ture ) กว่าใน fmasc . ระหว่าง fmasc ลายเซ็นยีน ,

34% อยู่ทั่วไปทั้ง fmasc amasc และประชากร -
tionswhen เมื่อเทียบกับ fstr แต่
40% มี signi จึงลดลงอย่างมีนัยสําคัญเมื่อกว่า -
แสดงใน fmasc เมื่อเทียบกับ amasc ( รูปที่ 3 ) .
เราหลอกจึง rmed แตกต่างรูปแบบ
การแสดงออกของยีนระหว่างประชากรใน fmasc และ fstr บนแผงของยีน
เลือกจากนอกจากนี้เซลล์ต้นกําเนิด พัฒนาการ และมะเร็ง
ที่เกี่ยวข้อง ( ตัวเลขและเส้นทาง 3B 3C ) นอกจากนี้ สูง -
ผ่านเซลล์เดียวข้าพเจ้า PCR วิเคราะห์คอน จึง rmed การแสดงออก
ของบางส่วนซ้อนเลือก 46 ยีนในเซลล์ของแต่ละคน
fmasc ประชากร ( รูปที่ 3 ) วิธีการนี้ยังข้อมูลจึงเอ็ด
แต่ละเซลล์ของทารกในครรภ์ coexpress เคอราติน myoepithe + , -
lial เคอราติน และ vimentin ( รูปที่ 3 )