2.8. Statistical analysisStatistica

2.8. Statistical analysis
Statistical evaluation was performed with Graph pad prism
for categorical variables. Fisher exact test was performed in
the instance of 2 and 3 variables.
(G12D) and of DNA from MCF-7 cells, that have wt KRAS, and
then spiked the DNA from the PANC1 cells into the DNA
from the MCF-7 cells. The results show that this assay is
able to discriminate at least 5 copies of mutant allele for
100,000 wt copies (i.e. an abundance ratio of 0.05%)
(Figure 1C and D). Additionally, we found that the performance
of ddPCR is at least 10-fold more sensitive than TaqMelt
(using Cobas z480) and HRM (using LC480 analyzer)
with a sensitivity limit for both techniques close to 0.5e1%
(Supp. Data 1). Next, we compared the capacity of ddPCR,
Sanger sequencing, TaqMelt and HRM to detect KRAS mutant
cells in whole blood (Figure 2). For this purpose, we spiked 100,
75, 50, 10 or 5 cells into healthy donor blood and then used the
size-based ScreenCell technology to enrich the fraction of
mutant cells from the leucocyte background. Next, DNA was
extracted and amplified from the enriched cell fraction and
then processed by the different molecular detection methods.
For ddPCR, we defined a threshold after processing of three independent
samples from healthy blood donor as “mean of the
abundance ratio þ 3 SD” thereby allowing us to fix the

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.8. สถิติวิเคราะห์ดำเนินการประเมินผลทางสถิติ ด้วยกราฟแผ่นปริซึมสำหรับตัวแปรที่แน่ชัด ฟิชเชอร์ที่ทำการทดสอบที่แน่นอนในอินสแตนซ์ของตัวแปร 2 และ 3(G12D) และดีเอ็นเอจากเซลล์ MCF-7 ที่มี wt คราส และจากนั้น ได้ถูกแทงดีเอ็นเอจากเซลล์ PANC1 เป็นดีเอ็นเอจากเซลล์ MCF-7 ผลลัพธ์แสดงว่า การทดสอบนี้เป็นสามารถที่จะแยกแยะสำเนาน้อย 5 อัลลีลกลายพันธุ์สำหรับwt 100,000 เล่ม (เช่นความอุดมสมบูรณ์อัตรา 0.05%)(รูปที่ 1 c และ D) นอกจากนี้ เราพบว่าประสิทธิภาพการทำงานเป็น ddPCR น้อย 10-fold ความไวมากกว่า TaqMelt(ใช้ Cobas z480) และ HRM (ใช้วิเคราะห์ LC480)มีขีดจำกัดความไวแสงสำหรับทั้งสองเทคนิคใกล้ 0.5e1%(ข้อมูล supp. 1) ถัดไป เราเปรียบเทียบความจุของ ddPCRการจัดลำดับ TaqMelt และ HRM เพื่อตรวจหาการกลายพันธุ์คราส Sangerเซลล์ในเลือด (รูป 2) สำหรับวัตถุประสงค์นี้ เราได้ถูกแทง 10075, 50, 10 หรือ 5 เซลล์ในสุขภาพผู้บริจาคเลือด และใช้การใช้ขนาด ScreenCell เทคโนโลยีที่เหนือกว่าอำนาจเซลล์ที่กลายพันธุ์จากพื้นหลัง leucocyte ถัดไป ดีเอ็นเอได้แยก และขยายจากเศษเซลล์เข้มข้น และการ ประมวลผล โดยวิธีการตรวจจับโมเลกุลที่แตกต่างกันDdPCR เรากำหนดเกณฑ์หลังจากประมวลผลอิสระสามตัวอย่างจากผู้บริจาคโลหิตเป็น "หมายถึงของอุดมสมบูรณ์สมþ 3 SD"ซึ่งเราได้แก้ไขปัญหา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.8 การวิเคราะห์สถิติ
การประเมินผลทางสถิติได้ดำเนินการกับกราฟปริซึมแผ่น
สำหรับตัวแปรเด็ดขาด ฟิชเชอร์การทดสอบที่แน่นอนได้รับการดำเนินการใน
อินสแตนซ์ที่ 2 และ 3 ตัวแปร
(G12D) และดีเอ็นเอจาก MCF-7 เซลล์ที่ได้ WT KRAS และ
แล้วถูกแทงดีเอ็นเอจากเซลล์ PANC1 ลงในดีเอ็นเอ
จากเซลล์ MCF-7 ผลปรากฏว่าการทดสอบนี้จะ
สามารถที่จะเห็นความแตกต่างอย่างน้อย 5 สำเนาของอัลลีลกลายพันธุ์สำหรับ
100,000 เล่ม WT (เช่นอัตราส่วนความอุดมสมบูรณ์ของ 0.05%)
(รูปที่ 1C และ D) นอกจากนี้เรายังพบว่าผลการดำเนินงาน
ของ ddPCR อย่างน้อย 10 เท่าไวกว่า TaqMelt
(ใช้ z480 Cobas) และการบริหารทรัพยากรมนุษย์ (โดยใช้การวิเคราะห์ LC480)
มีวงเงินความไวสำหรับเทคนิคทั้งใกล้กับ 0.5e1%
(ภาคผนวก. ข้อมูล 1) ถัดไปเราเมื่อเทียบกับความจุของ ddPCR ที่
แซงเจอร์ลำดับ TaqMelt และการบริหารทรัพยากรมนุษย์ในการตรวจสอบ KRAS กลายพันธุ์
เซลล์ในเลือด (รูปที่ 2) เพื่อจุดประสงค์นี้เราถูกแทง 100,
75, 50, 10 หรือ 5 เซลล์เข้าสู่กระแสเลือดของผู้บริจาคที่มีสุขภาพดีและจากนั้นใช้
ขนาดตามเทคโนโลยี ScreenCell เพื่อเพิ่มส่วนของการ
เซลล์กลายพันธุ์จากพื้นหลังเม็ดโลหิตขาว ถัดไปดีเอ็นเอ
ที่สกัดและขยายจากเซลล์ส่วนที่อุดมด้วยและ
แล้วการประมวลผลโดยวิธีการตรวจสอบในระดับโมเลกุลที่แตกต่างกัน
สำหรับ ddPCR เรากำหนดเกณฑ์หลังจากการประมวลผลสามอิสระ
ตัวอย่างจากผู้บริจาคโลหิตเป็น "ค่าเฉลี่ยของ
อัตราส่วนความอุดมสมบูรณ์ 3 Th SD" ซึ่งจะช่วยให้เราในการแก้ไขปัญหา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.8 . สถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลการประเมินผลทางสถิติแสดงกับแผ่นกราฟปริซึมสำหรับตัวแปรเด็ดขาด Fisher Exact Test ในการปฏิบัติอินสแตนซ์ของ 2 และ 3 ตัวแปร( g12d ) และดีเอ็นเอจาก mcf-7 เซลล์ที่มีน้ำหนัก kras , และแล้วจากดีเอ็นเอจากเซลล์ panc1 ในดีเอ็นเอจาก mcf-7 เซลล์ ผลการทดลองแสดงให้เห็นว่า วิธีนี้คือสามารถเลือกปฏิบัติอย่างน้อย 5 ชุดของยีนที่กลายพันธุ์100000 WT เล่ม ( เช่นความอุดมสมบูรณ์เท่ากับ 0.05 % )( ในรูป และ D ) นอกจากนี้ เราพบว่า ประสิทธิภาพของ ddpcr อย่างน้อย 10 เท่า taqmelt อ่อนไหวมากกว่า( ใช้ cobas z480 ) และการบริหาร ( โดยใช้เครื่องวิเคราะห์ lc480 )ที่มีความไวสูงสุดเทคนิคทั้งใกล้ 0.5e1 %( ร่วมกับข้อมูล 1 ) ต่อไปเรา ddpcr เปรียบเทียบความจุของ ,แซงเจอร์ลำดับการผลิตและการตรวจสอบ kras กลายพันธุ์ taqmelt .เซลล์ในเลือดทั้งหมด ( รูปที่ 2 ) สำหรับวัตถุประสงค์นี้ เราถูกแทง 10075 , 50 , 10 หรือ 5 เซลล์ในเลือดของผู้บริจาคมีสุขภาพดี และใช้ขนาด screencell เทคโนโลยีที่ใช้เพื่อเพิ่มสัดส่วนของเซลล์ที่กลายพันธุ์จากระดับพื้นหลัง ดีเอ็นเอ ต่อไปการสกัดและการขยายจากเซลล์และอุดมด้วยเศษส่วนแล้วประมวลผลด้วยวิธีตรวจจับโมเลกุลที่แตกต่างกัน .สำหรับ ddpcr เรากำหนดเกณฑ์หลังจากการประมวลผลสามอิสระตัวอย่างจากผู้บริจาคโลหิตมีสุขภาพดีเป็น " หมายถึงของไพบูลย์ อัตราส่วนþ 3 SD " เพื่อให้เราแก้ไข