Peptide hormones are small, process

Peptide hormones are small, processed, and secreted peptides that signal via membrane receptors and play critical roles in normal and pathological physiology. The search for novel peptide hormones has been hampered by their small size, low or restricted expression, and lack of sequence similarity. To overcome these difficulties, we developed a bioinformatics search tool based on the hidden Markov model formalism that uses several peptide hormone sequence features to estimate the likelihood that a protein contains a processed and secreted peptide of this class. Application of this tool to an alignment of mammalian proteomes ranked 90% of known peptide hormones among the top 300 proteins. An analysis of the top scoring hypothetical and poorly annotated human proteins identified two novel candidate peptide hormones. Biochemical analysis of the two candidates, which we called spexin and augurin, showed that both were localized to secretory granules in a transfected pancreatic cell line and were recovered from the cell supernatant. Spexin was expressed in the submucosal layer of the mouse esophagus and stomach, and a predicted peptide from the spexin precursor induced muscle contraction in a rat stomach explant assay. Augurin was specifically expressed in mouse endocrine tissues, including pituitary and adrenal gland, choroid plexus, and the atrio-ventricular node of the heart. Our findings demonstrate the utility of a bioinformatics approach to identify novel biologically active peptides. Peptide hormones and their receptors are important diagnostic and therapeutic targets, and our results suggest that spexin and augurin are novel peptide hormones likely to be involved in physiological homeostasis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เพปไทด์ฮอร์โมนมีขนาดเล็ก ประมวลผล และเปปไทด์ secreted ที่สัญญาณผ่านเมมเบรน receptors และเล่นบทบาทสำคัญในสาขาสรีรวิทยาทางพยาธิวิทยา และปกติ หาฮอร์โมนเพปไทด์นวนิยายได้ถูกขัดขวาง โดยขนาดเล็ก นิพจน์ต่ำ หรือจำกัด และขาดการลำดับความคล้ายคลึงกัน เพื่อเอาชนะความยากลำบากเหล่านี้ เราพัฒนาเครื่องมือค้นหา bioinformatics ตาม formalism รุ่น Markov ซ่อนที่ใช้หลายเพปไทด์ฮอร์โมนลำดับคุณลักษณะเพื่อประเมินความเป็นไปได้ว่า โปรตีนที่ประกอบด้วยเพปไทด์ secreted และประมวลผลระดับนี้ ใช้เครื่องมือนี้เพื่อการจัดตำแหน่งของ mammalian proteomes อันดับ 90% รู้จักเพปไทด์ฮอร์โมนระหว่างโปรตีน 300 สูงสุด การวิเคราะห์ด้านคะแนนสมมุติ และงานประกอบมนุษย์โปรตีนระบุสองผู้สมัครนวนิยายเพปไทด์ฮอร์โมน วิเคราะห์อันดับสอง ซึ่งเราเรียกว่า spexin และ augurin ชีวเคมีแสดงให้เห็นว่า ทั้งสองได้รับการแปล secretory เม็ดในบรรทัด transfected เซลล์ตับอ่อน และถูกกู้คืนจาก supernatant เซลล์ Spexin ได้แสดงออกในชั้น submucosal เมาส์หลอดอาหารและกระเพาะอาหาร และเพปไทด์คาดการณ์จากสารตั้งต้น spexin เกิดจากการหดตัวของกล้ามเนื้อในการทดสอบ explant ท้องหนู Augurin ได้โดยแสดงในเมาส์ต่อมไร้ท่อเนื้อเยื่อ ต่อมใต้สมอง และต่อมหมวกไต ข่ายประสาท choroid และโหน atrio หัวใจห้องล่างของหัวใจ ผลการวิจัยของเราแสดงให้เห็นถึงอรรถประโยชน์ของวิธี bioinformatics ระบุเปปนวนิยายชิ้นงาน เพปไทด์ฮอร์โมนและ receptors ของการวินิจฉัย และรักษาเป้าหมายสำคัญ และผลของเราแนะนำว่า spexin และ augurin มีแนวโน้มที่จะเกี่ยวข้องกับภาวะธำรงดุลสรีรวิทยาฮอร์โมนเพปไทด์นวนิยาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ฮอร์โมนเปปไทด์ขนาดเล็กที่มีการประมวลผลและการหลั่งเปปไทด์ที่ส่งสัญญาณผ่านตัวรับเมมเบรนและมีบทบาทสำคัญในการสรีรวิทยาและพยาธิสภาพปกติ ค้นหาฮอร์โมนเปปไทด์นวนิยายเรื่องนี้ได้รับการขัดขวางโดยขนาดที่เล็กของพวกเขาแสดงออกต่ำหรือ จำกัด และขาดความคล้ายคลึงกันตามลำดับ เพื่อเอา​​ชนะปัญหาเหล​​่านี้เราพัฒนาเครื่องมือในการค้นหาชีวสารสนเทศขึ้นอยู่กับรูปแบบแบบมาร์คอฟที่ซ่อนอยู่ที่จะใช้ลำดับฮอร์โมนเปปไทด์มีหลายที่จะประเมินโอกาสที่โปรตีนเปปไทด์ที่มีการประมวลผลและการหลั่งของชั้นนี้ การประยุกต์ใช้เครื่องมือนี้ในการจัดตำแหน่งของ proteomes เลี้ยงลูกด้วยนมในอันดับที่ 90% ของฮอร์โมนเปปไทด์ที่รู้จักกันในด้านบน 300 โปรตีน การวิเคราะห์การให้คะแนนด้านบนสมมติฐานและข้อเขียนไม่ดีโปรตีนของมนุษย์ระบุสองผู้สมัครนวนิยายฮอร์โมนเปปไทด์ การวิเคราะห์ทางชีวเคมีของผู้สมัครทั้งสองซึ่งเราเรียกว่า spexin augurin และแสดงให้เห็นว่าทั้งสองถูกหน่วงเม็ดหลั่งในเซลล์ตับอ่อน transfected และหายจากสารละลายเซลล์ Spexin ได้แสดงออกในชั้น submucosal หลอดอาหารเมาส์และกระเพาะอาหารและเปปไทด์ที่คาดการณ์จากสารตั้งต้น spexin กล้ามเนื้อหดตัวเหนี่ยวนำให้เกิดในท้องหนูทดสอบชิ้น Augurin ได้แสดงออกโดยเฉพาะในเนื้อเยื่อต่อมไร้ท่อเมาส์รวมทั้งต่อมใต้สมองและต่อมหมวกไต, choroid ช่องท้องและโหนด Atrio-กระเป๋าหน้าท้องของหัวใจ ค้นพบของเราแสดงให้เห็นถึงประโยชน์ของว​​ิธีชีวสารสนเทศเพื่อระบุนวนิยายเปปไทด์ชีวภาพ เปปไทด์ฮอร์โมนและผู้รับมีความสำคัญเป้าหมายวินิจฉัยและการรักษาและผลของเราแสดงให้เห็นว่า spexin และ augurin มีฮอร์โมนเปปไทด์นวนิยายมีแนวโน้มที่จะมีส่วนร่วมในสภาวะสมดุลทางสรีรวิทยา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เปปไทด์ฮอร์โมนมีขนาดเล็ก การประมวลผล และการหลั่งเปปไทด์ที่สัญญาณผ่านเมมเบรนตัวรับและเล่นบทบาทสําคัญในสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยา ค้นหาฮอร์โมนเปปไทด์นวนิยายได้รับการขัดขวางโดยขนาดที่เล็กของพวกเขาต่ำ หรือถูกจำกัดการแสดงออก และขาดความเหมือนของลำดับ เพื่อเอาชนะปัญหาเหล่านี้เราพัฒนารสนเครื่องมือค้นหาบนพื้นฐานของแบบจำลองฮิดเดนมาร์คอฟ ซึ่งเป็นพิธีที่ใช้คุณลักษณะลำดับเปปไทด์ฮอร์โมนหลายเพื่อประเมินโอกาสที่มีการประมวลผลและการหลั่งโปรตีนเปปไทด์ของคลาสนี้ การใช้เครื่องมือนี้จะเป็นแนวของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม proteomes อันดับ 90% ของเปปไทด์ฮอร์โมนที่รู้จักกันในหมู่ด้านบน 300 โปรตีนการวิเคราะห์คะแนนสูงสุดสมมุติ และงานบันทึกย่อนวนิยายฮอร์โมนเปปไทด์โปรตีนของมนุษย์ระบุสองผู้สมัคร การวิเคราะห์ทางชีวเคมีของผู้สมัครทั้งสอง ซึ่งเราเรียกว่า spexin augurin และพบว่าทั้งสองถูกแปลเป็นภาษาท้องถิ่นเพื่อเม็ดบางๆ ใน transfected เซลล์ตับอ่อน และพบเซลล์ที่นำ .spexin ถูกแสดงในชั้น submucosal เมาส์ของหลอดอาหารและกระเพาะอาหาร และคาดการณ์ เปปไทด์จาก spexin สารตั้งต้นเกิดการหดตัวของกล้ามเนื้อในกระเพาะอาหารหนูขาวต่อการทดสอบ augurin ถูกเฉพาะแสดงออกในเมาส์การขับถ่ายต่อมไร้ท่อ , ต่อมใต้สมอง และรวมทั้งต่อมหมวกไตต่อม อิทธิผล และ มาตรฐาน มอก. ( โหนดของหัวใจผลของเราแสดงให้เห็นถึงอรรถประโยชน์ของชีวสารสนเทศศาสตร์วิธีการระบุนวนิยายที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เปปไทด์ ตัวรับฮอร์โมนเปปไทด์และการวินิจฉัยและการรักษาของพวกเขาเป็นเป้าหมายสำคัญ และจากผลการศึกษานี้ และ spexin augurin เป็นนวนิยาย เปปไทด์ฮอร์โมนน่าจะเกี่ยวข้องกับสมดุลทางสรีรวิทยา