2.5. Sequence analysisThe phylogene

2.5. Sequence analysis
The phylogenetic dendrogram was constructed by comparing rotavirus sequences from various groups, including group A (from humans and animals), group D (chicken/05V0049/DEU/2005 [U733448]), group F (chicken/03V0568/DEU/2003 [HQ403603]), and group G (chicken/03V0567/DEU/2003 [HQ403604]). The analysis included the entire 742-bp sequence amplified by PCR, which corresponded to nucleotides 3-744 of the coding region of the VP6 gene, using the group D prototype sequence as a reference (Trojnar et al., 2010). The sequences obtained for the VP6 gene were aligned and edited using BioEdit (v.7.0.5.3), and the dendrogram was generated by MEGA 5 (v.5.05) using the neighbor-joining method and Kimura 2-parameter model (Kimura, 1980); the reliability was tested by a nonparametric bootstrap analysis with 2000 replicates

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.5. การวิเคราะห์หาสร้าง dendrogram ผล โดยการเปรียบเทียบลำดับโรตาไวรัสจากกลุ่มต่าง ๆ รวมทั้งกลุ่ม A (จากมนุษย์และสัตว์), กลุ่ม D (ไก่/05V0049/DEU/2005 [U733448]), F (ไก่/03V0568/DEU/2003 [HQ403603]), และกลุ่ม G (ไก่/03V0567/DEU/2003 [HQ403604]) การวิเคราะห์รวมทั้งลำดับ 742-bp ขยาย โดย PCR ซึ่งความผูกพันในการนิวคลีโอไทด์ 3-744 ของภูมิภาครหัสของยีน vp6 มัน ใช้กลุ่ม D แบบลำดับเป็นการอ้างอิง (Trojnar et al. 2010) ลำดับที่ได้ยีน vp6 มันสอดคล้อง และใช้แก้ไข BioEdit (v.7.0.5.3), และ dendrogram สร้างขึ้น โดย 5 ล้าน (v.5.05) โดยใช้วิธีเข้าร่วมบ้านและรุ่น 2-พารามิเตอร์คิมุระ (คิมุระ 1980); ทดสอบความน่าเชื่อถือ โดยการวิเคราะห์เริ่มต้น nonparametric ด้วยเหมือนกับ 2000

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.5 การวิเคราะห์ลำดับ
dendrogram phylogenetic ถูกสร้างขึ้นโดยการเปรียบเทียบลำดับโรตาไวรัสจากกลุ่มต่าง ๆ รวมทั้งกลุ่ม (จากมนุษย์และสัตว์) กลุ่ม D (ไก่ / 05V0049 / DEU / 2005 [U733448]) กลุ่ม F (ไก่ / 03V0568 / DEU / 2003 [HQ403603]) และกลุ่ม บริษัท จี (ไก่ / 03V0567 / DEU / 2003 [HQ403604]) รวมถึงการวิเคราะห์ลำดับ 742-BP ทั้งขยายโดยวิธี PCR ซึ่งตรงกับนิวคลีโอ 3-744 ของภูมิภาคการเข้ารหัสของยีน VP6 โดยใช้กลุ่ม D ลำดับต้นแบบเป็นข้อมูลอ้างอิง (Trojnar et al., 2010) ลำดับที่ได้รับยีน VP6 ถูกชิดและแก้ไขได้โดยใช้ BioEdit (v.7.0.5.3) และ dendrogram ที่ถูกสร้างขึ้นโดย MEGA 5 (v.5.05) โดยใช้วิธีเพื่อนบ้านเข้าและคิมูระรุ่น 2-พารามิเตอร์ (คิมูระ 1980 ); ความน่าเชื่อถือได้รับการทดสอบโดยการวิเคราะห์บูตไม่อิงพารามิเตอร์ 2000 ซ้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.5 การวิเคราะห์ลำดับพันธุกรรมซึ่งถูกสร้างขึ้นโดยการเปรียบเทียบโรตาลำดับจากกลุ่มต่างๆ รวมทั้งกลุ่มหนึ่ง ( จากมนุษย์และสัตว์ ) , กลุ่ม D ( ไก่ / 05v0049 / ดื้อ / 2005 [ u733448 ] ) , กลุ่ม F ( ไก่ / 03v0568 / ดื้อ / 2003 [ hq403603 ] ) และ กลุ่ม G ( ไก่ / 03v0567 / ดื้อ / 2546 [ hq403604 ] ) การวิเคราะห์ลำดับเบส รวมทั้งเป็น BP โดยวิธี PCR ซึ่งสอดคล้องกับขนาด 3-744 ของรหัสภูมิภาคของ vp6 ยีนโดยใช้กลุ่ม D ต้นแบบเป็นลำดับอ้างอิง ( trojnar et al . , 2010 ) ลำดับการศึกษาสำหรับ vp6 ยีนชิดและแก้ไขโดยใช้ bioedit ( v.7.0.5.3 ) และพันธุกรรมที่ถูกสร้างขึ้นโดยเมกะ 5 ( v.5.05 ) โดยใช้รูปแบบ วิธีการ และเพื่อนบ้านร่วมคิมูระสอง ( คิมูระ , 1980 ) ; ความน่าเชื่อถือการทดสอบโดยการวิเคราะห์ประผลสำเร็จกับ 2000 ซ้ำ