Translin is a single-stranded DNA a

Translin is a single-stranded DNA and RNA binding protein that has a high affinity for G-rich sequences. TRAX is a Translin paralog that associates with Translin. Both Translin and TRAX were highly conserved in eukaryotes. The nucleic acid binding form of Translin is a barrel-shaped homo-octamer. A Translin–TRAX hetero-octamer having a similar structure also binds nucleic acids. Previous reports suggested that Translin may be involved in chromosomal translocations, telomere metabolism and the control of mRNA transport and translation. More recent studies have indicated that Translin–TRAX hetero-octamers are involved in RNA silencing. To gain a further insight into the functions of Translin, we have undertaken to systematically search for proteins with which it forms specific complexes in living cells. Here we report the results of such a search conducted in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe, a suitable model system. This search was carried out by affinity purification and immuno-precipitation techniques, combined with differential labeling of the intracellular proteins with the stable isotopes 15N and 14N. We identified for the first time two proteins containing an RNA Recognition Motif (RRM), which are specifically associated with the yeast Translin: (1) the pre-mRNA-splicing factor srp1 that belongs to the highly conserved SR family of proteins and (2) vip1, a protein conserved in fungi. Our data also support the presence of RNA in these intracellular complexes. Our experimental approach should be generally applicable to studies of weak intracellular protein–protein interactions and provides a clear distinction between false positive vs. truly interacting proteins.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Translin เป็นการควั่นเดียวดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอรวมโปรตีนที่ยุ่งสำหรับลำดับ G-ริช แทร็กซ์เป็น paralog Translin ที่เชื่อมโยงกับ Translin Translin และแทร็กซ์ได้สูงอยู่ใน eukaryotes กรดนิวคลีอิกรวมรูปแบบของ Translin คือ octamer ตุ๊ดทรงกระบอก การ Translin–TRAX hetero-octamer มีโครงสร้างคล้ายยัง binds กรดนิวคลีอิก รายงานก่อนหน้านี้แนะนำว่า อาจเกี่ยวข้องกับ Translin ใน translocations ของโครโมโซม telomere เมแทบอลิซึม และการควบคุมการขนส่ง mRNA และแปล การศึกษาล่าสุดได้ระบุว่า Translin–TRAX hetero-octamers เกี่ยวข้องในอาร์เอ็นเอ silencing เพื่อความเข้าใจเพิ่มเติมในฟังก์ชันของ Translin เราได้ดำเนินการหาโปรตีนที่แบบคอมเพล็กซ์เฉพาะในเซลล์ที่อยู่อาศัยอย่างเป็นระบบ ที่นี่เราสามารถรายงานผลเช่นการค้นหาใน pombe ฟิชชันยีสต์ Schizosaccharomyces ระบบจำลองที่เหมาะสม ค้นหานี้ถูกดำเนินการ โดยฟอกความสัมพันธ์และเทคนิคการ immuno-ฝน ร่วมกับการติดฉลากส่วนที่แตกต่างของโปรตีน intracellular ด้วยไอโซโทป 15N 14N และ เราระบุในครั้งแรกครั้งสองโปรตีนประกอบด้วยการอาร์เอ็นเอรู้แปลน (RRM), ที่เกี่ยวข้องโดยเฉพาะกับยีสต์ Translin: (1)ก่อน-mRNA-splicing ปัจจัย srp1 ที่ตระกูล SR นำสูงโปรตีนและ (2) vip1 โปรตีนที่อยู่ในเชื้อรา ข้อมูลสนับสนุนของอาร์เอ็นเอในคอมเพล็กซ์ intracellular เหล่านี้ยัง วิธีการทดลองของเราควรจะใช้โดยทั่วไปการศึกษาของ protein–protein อ่อนแอ intracellular โต้ตอบ และมีความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างบวกเท็จเทียบกับโปรตีนที่ได้โต้ตอบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Translin เป็นดีเอ็นเอเกลียวเดี่ยวและ RNA โปรตีนที่มีความสัมพันธ์กันสูงสำหรับลำดับ G-อุดมไปด้วย TRAX เป็น paralog Translin ที่ร่วมด้วย Translin ทั้ง Translin และ TRAX ถูกอนุรักษ์สูงในยูคาริโอ กรดนิวคลีอิกรูปแบบของ Translin ผูกพันเป็นรูปทรงกระบอกตุ๊ด-octamer Translin-TRAX-octamer แตกต่างที่มีโครงสร้างที่คล้ายกันยังผูกกรดนิวคลีอิก รายงานก่อนหน้านี้ชี้ให้เห็นว่า Translin อาจจะเกี่ยวข้องกับโครโมโซม translocations, การเผาผลาญอาหารใน telomere และการควบคุมของการขนส่งและการแปล mRNA การศึกษาล่าสุดได้แสดงให้เห็นว่า Translin-TRAX แตกต่าง octamers-มีส่วนร่วมในอาร์เอ็นเอสมร เพื่อให้ได้รับข้อมูลเชิงลึกต่อไปเป็นหน้าที่ของ Translin ที่เราได้ดำเนินการที่จะค้นหาระบบโปรตีนที่มันเป็นคอมเพล็กซ์เฉพาะในเซลล์ที่มีชีวิต ที่นี่เรารายงานผลของการค้นหาดังกล่าวดำเนินการใน pombe Schizosaccharomyces เซลล์ยีสต์ระบบรูปแบบที่เหมาะสม การค้นหานี้ได้ดำเนินการโดยบริสุทธิ์และอิมมูโนเทคนิคการเร่งรัดความสัมพันธ์บวกกับการติดฉลากความแตกต่างของโปรตีนในเซลล์ที่มี 15N ไอโซโทปที่มีเสถียรภาพและ 14N เราระบุเป็นครั้งแรกที่ทั้งสองโปรตีนที่มีอาร์เอ็นเอได้รับการยอมรับ Motif (RRM) ซึ่งจะเกี่ยวข้องเฉพาะกับ Translin ยีสต์: (1) ปัจจัย srp1 ก่อน mRNA-ประกบที่เป็นของครอบครัวอาร์ป่าสงวนสูงของโปรตีนและ (2 ) vip1 โปรตีนในป่าสงวนเชื้อรา ข้อมูลของเรายังสนับสนุนการปรากฏตัวของอาร์เอ็นเอในคอมเพล็กซ์ภายในเซลล์เหล่านี้ วิธีการทดลองของเราควรจะเป็นโดยทั่วไปที่ใช้บังคับกับการศึกษาของเซลล์อ่อนแอปฏิกริยาระหว่างโปรตีนและให้ความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างบวกปลอมอย่างแท้จริงโต้ตอบกับโปรตีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

translin เป็นเดียว stranded DNA และ RNA โปรตีนที่มีความสามารถสูง สำหรับ g-rich ลำดับ แทร็กซ์ เป็น translin paralog ที่เชื่อมโยงกับ translin . ทั้ง translin Trax และมีการอนุรักษ์ในยูแคริโอต . ส่วนกรดนิวคลีอิกปกรูป translin เป็นบาร์เรลรูปตุ๊ดกทาเมอร์ . เป็น translin – Trax กทาเมอร์มีโครงสร้างที่คล้ายกันอื่นยังผูก กรดนิวคลีอิกรายงานก่อนหน้านี้พบว่า translin อาจเกี่ยวข้องกับโครโมโซมโยกย้าย เมแทบอลิซึมและการควบคุมภาวะขนส่ง mRNA และการแปล การศึกษาล่าสุดได้แสดงให้เห็นว่า translin –แสน octamers อื่นมีส่วนร่วมใน silencing RNA . เพื่อให้ได้รับข้อมูลเชิงลึกเพิ่มเติมในการทำงานของ translin ,เราได้เพิ่มระบบค้นหาโปรตีนที่ซับซ้อนในรูปแบบเฉพาะเซลล์ที่มีชีวิต มารายงานผลเช่นการค้นหาดำเนินการในเซลล์ยีสต์ schizosaccharomyces pombe ระบบแบบจำลองที่เหมาะสม การค้นหานี้กระทำโดยกลุ่มมมูโนเทคนิคบำบัดน้ำเสียการตกตะกอนรวมกับการติดฉลากของโปรตีนภายในเซลล์กับมั่นคงไอโซโทป 15 14n และแตกต่างกัน เราระบุเป็นครั้งแรกสองโปรตีน rna รับรู้ที่มีแม่ลาย ( RRM ) ซึ่งเป็นโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่เกี่ยวข้องกับยีสต์ translin ( 1 ) pre mRNA splicing factor srp1 ว่าเป็นของที่มีการอนุรักษ์ SR ครอบครัวของโปรตีนและ ( 2 ) vip1 , โปรตีนที่ป่าสงวนในราข้อมูลนอกจากนี้ยังสนับสนุนการแสดงตนของ DNA complexes ภายในเซลล์เหล่านี้ วิธีการทดลองของเรา จะโดยทั่วไปสามารถใช้ได้กับการศึกษาที่อ่อนแอภายในเซลล์โปรตีน–โปรตีนปฏิสัมพันธ์และมีความแตกต่างที่ชัดเจนระหว่างเท็จบวกกับอย่างแท้จริงด้วยโปรตีน