PCR products recovered with the CTO

PCR products recovered with the CTO primers were subjected to
DGGE according to the protocol of Muyzer et al. [20] as adapted by
Specifically, the probes L-Ammo 223r,
Nsp436r, Nmonas244r, NspCl3-455r and NspCl4-446r were used to
detect 16S rDNA fragments from all ammonia oxidisers, Nitrosospira,
Nitrosomonas, cluster 3 Nitrosospira and cluster 4 Nitrosospira,
respectively. No attempts to quantify the intensity of radioactive signals
were made during the course of this study. 2.5. Sequence analysis of
bands excised from DGGE gels Bands chosen for sequence analysis was
carefully excised from the DGGE gel with a scalpel. Only the centremost
50% of each band was excised in order to avoid the lane edges
where smearing was observed. DNA extraction, reamplification and
DNA sequencing were as described by Kowalchuk et al.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลิตภัณฑ์ PCR กู้คืนได้ด้วยไพรเมอร์ CTO ถูกยัดเยียดให้
DGGE ตามโปรโตคอลของ Muyzer et al, [20]
ในขณะที่ปรับตัวโดยเฉพาะยานสำรวจ223r L-กระสุน,
Nsp436r, Nmonas244r, NspCl3-455r NspCl4-446r
และถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบชิ้นส่วน16S rDNA จากปฏิกิริยาออกซิเดแอมโมเนียทั้งหมด Nitrosospira,
Nitrosomonas กลุ่ม 3 Nitrosospira และกลุ่ม 4 Nitrosospira,
ตามลำดับ
ไม่มีความพยายามที่จะหาจำนวนความเข้มของสัญญาณกัมมันตรังสีที่ถูกสร้างขึ้นในช่วงของการศึกษาครั้งนี้ 2.5 การวิเคราะห์ลำดับของวงดนตรีจากพอร์เจล DGGE วงเลือกสำหรับการวิเคราะห์ลำดับถูกตัดอย่างระมัดระวังจากเจลDGGE มีดผ่าตัด เฉพาะ centremost 50% ของแต่ละวงดนตรีที่พอเพื่อหลีกเลี่ยงขอบถนนที่ทาเป็นที่สังเกต การสกัดดีเอ็นเอ reamplification และลำดับดีเอ็นเอถูกตามที่อธิบายKowalchuk et al,

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลิตภัณฑ์ PCR กู้กับ CTO ไพรเมอร์ถูก

ตามโปรโตคอลการทดลองของ muyzer et al . [ 20 ] ดัดแปลงโดย
โดยเฉพาะ และ 223r l-ammo , nsp436r nmonas244r
, ,

nspcl3-455r nspcl4-446r และใช้ตรวจหา 16S rDNA เศษจากทั้งหมด oxidisers ไนโตรโซ ปรา
ไนโตรโซโมนาส , แอมโมเนีย , กลุ่มที่ 3 และกลุ่มที่ 4 , ไนโตรโซ ปราไนโตรโซ ปรา
, ตามลำดับไม่พยายามที่จะวัดความเข้มของสัญญาณกัมมันตรังสี
เกิดขึ้นในระหว่างหลักสูตรของการศึกษานี้ 2.5 การวิเคราะห์ลำดับเบสของ
วงตัดจากการทดลองเจลวงเลือกการวิเคราะห์ลำดับคือ
อย่างระมัดระวังเอาออกจากการทดลองเจลด้วยมีดผ่าตัด เพียง centremost
50% ของแต่ละวงถูกตัดเพื่อหลีกเลี่ยงขอบเลน
ที่ละเลงอยู่ ) การสกัดดีเอ็นเอ reamplification
, และการจัดลำดับดีเอ็นเอเป็นตามที่อธิบายไว้โดย kowalchuk et al .