RESULTSClinical and Epidemiologic A

RESULTS
Clinical and Epidemiologic Analysis
From July 26 to October 7, 2014, we identified 69 patients with EVD that was suspected (3 patients), probable (28 patients), or confirmed (38 patients). Of these patients, 33 were male and 36 were female; 80% of the patients were adults between the ages of 21 and 60 years (Figure 2AFIGURE 2
Suspected, Probable, and Confirmed Cases of Ebola Virus Disease (EVD) in the Democratic Republic of Congo.
). Among the patients with suspected disease, a higher proportion of children than adults were found to have non-EVD illnesses. Of the 69 patients, 21 male patients and 28 female patients died, including 3 children under the age of 5 years, resulting in a case fatality rate of 74% among probable and confirmed cases, if all cases and deaths were reported. For 28 paired contacts of patients with EVD, the median (serial) interval between dates of the reported onset of symptoms was 16 days (range, 3 to 27), and the mean (±SD) was 16.1±4.4 days, similar to that in West Africa.2 For 32 of the 49 patients who died, the median time from reported symptom onset to death was 11 days (range, 1 to 30), and the mean was 11.3±6.8; the interval was not measured for the other patients who died. All 8 health workers who were affected — 4 with probable EVD and 4 with confirmed EVD — died. As compared with patients with suspected EVD who were found to have non-EVD illnesses, patients with probable or confirmed EVD were more likely to have fever, headache, diarrhea, vomiting or nausea, fatigue, anorexia, muscle pain, difficulty swallowing, conjunctivitis, and blood in stools or vomit (Table 1TABLE 1
Cases of Probable or Confirmed Ebola Virus Disease, According to Reported Signs and Symptoms, in the Democratic Republic of Congo.
).
This outbreak has been driven by human-to-human transmission, but all cases and contacts appear to have originated from a single index case — in other words, there was no evidence of more than one transfer of infection from an animal reservoir. So far, all cases have been confined to Équateur province, including Boende town (approximately 45,000 inhabitants, with four Health Areas affected), Boende Moke, Bokongo, Lokolia, Lokula, Mondombe, and Watsi Kengo (ranging from 4000 to 12,000 inhabitants), which are situated on or close to road RP314 (Figure 1). The majority of suspected, probable, or confirmed cases of EVD have been reported from Lokolia (39 cases) or Watsi Kengo (18 cases), with only 4 cases reported from Boende town and another 8 from other towns in the district.
The maximum number of cases was reported in the weeks beginning August 17 and 24, according to the date of the onset of symptoms (Figure 2B). It is possible, by plotting the daily case incidence, to discern several generations of cases, as indicated by six peaks in incidence, including the initial index case (Figure 2C). These covered approximately five serial intervals (average, 16.1 days), generating a total of 69 cases in 70 days (Figure 2D).
The rise in case incidence during August was apparently driven by multiple infections acquired from the index case. Of the 29 patients in whom EVD was diagnosed during first 24 days of the outbreak, 21 were reported to be direct contacts of the index case (i.e., they had physical contact or contact with bodily fluids). If all these secondary cases did indeed acquire infection from a single source, this represents a basic case reproduction number2 (R 0) of 21 for this outbreak.
The number of secondary cases arising from each primary case during this outbreak was highly variable. Among other patients with EVD who infected named contacts, 1 patient generated 3 secondary cases, 2 patients generated a further 2 cases each, 30 patients generated a single extra case, and 11 patients generated no further cases. Counting all secondary cases arising among named contacts, including the index case, the average case reproduction number (R) for the whole outbreak was 1.29 (95% confidence interval [CI], −4.71 to 7.29). However, after the exclusion of the 21 cases generated by the index case, the average case reproduction number during the outbreak was 0.84 (95% CI, −0.38 to 2.06), which is below the threshold value for persistent transmission (R>1). This explains the observed decline in the EVD case incidence after mid-August. The last reported patient with EVD became ill on October 4, and no further cases were reported as of October 7.
A total of 1121 contacts of the patients were registered for follow-up. By October 7, a total of 830 had been followed for at least 21 days, which is considered to be the maximum incubation period. The index patient and her contacts had no history of travel to the EVD-affected countries in West Africa (Guinea, Liberia, Nigeria, Senegal, and Sierra Leone) and no history of contact with residents of the affected areas.
Identification and Characterization of the Virus
To identify the causative agent of the Boende EVD outbreak, investigators at Institut National de Recherche Biomédicale in Kinshasa and at Centre International de Recherches Médicales de Franceville in Gabon analyzed eight samples from patients who were suspected of having EDV. On the basis of both a conventional filoviridae-specific RT-PCR assay targeting a conserved region in the L gene and a real-time RT-PCR assay targeting the nucleoprotein gene in EBOV, six of the eight samples tested positive for EBOV. Sequencing of the 346-bp fragment amplified from the L gene in four of the samples revealed the viral sequences. These four sequences were identical and closely related to the EBOV variant that caused an EVD outbreak around Kikwit, Zaire (now part of the DRC), in 1995, indicating that the current outbreak in the DRC was unrelated to the ongoing outbreak in West Africa (Figure 3FIGURE 3
Phylogenetic Tree of Ebola Virus (EBOV) Strains Isolated in Equatorial Africa and West Africa.
). We obtained a coding-complete sequence of the virus from the sample having the highest RNA load and obtained a sequence of 18,953 nucleotides in length, which was called EBOV/H.sap/COD/14/Boe-Lok according to the recently established filovirus variant nomenclature6 (GenBank accession number, KM519951; see also GenBank numbers KM517570.1 and KM517571.1, which were obtained from initial RT-PCR analysis). The sequence showed 99.2% identity (0.8% difference, 145 mutations) with the most closely related variant that was isolated during the 1995 Kikwit outbreak (EBOV/H.sap/COD/95/Kikwit-13709). Among the 145 mutations, 22 were nonsynonymous, but none were expected to induce any important change in viral protein sequences. In particular, we observed 5 nonsynonymous mutations in the NP gene, 1 in the VP35 gene, 1 in the VP40 gene, 8 in the GP gene, none in the VP30 gene, 2 in the VP24 gene, and 5 in the L gene.
We then performed high-throughput sequencing on two additional positive samples after random amplification of extracted total RNA from serum samples. Given the moderate viral load in the serum, we could not obtain the complete sequences but only 2270 bp from one sample and 12,501 bp from the other sample. Analysis of these partial sequences showed an identity of 100% with the complete sequence obtained previously, further suggesting that the current outbreak in the DRC is due to a single introduction of this novel EBOV variant into the human population.
In contrast to the similarity between the Boende variant and other equatorial African variants (especially EBOV/H.sap/COD/95/Kikwit-13709), the gene sequence of the Lokolia isolate showed only 96.8% identity (3.2% difference) with the West African variants, with 601 mutations as compared with a Guinean variant (KJ660347) and 602 mutations as compared with a Sierra Leonean variant (KM233116).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ผลลัพธ์วิเคราะห์ทางคลินิก และ Epidemiologicจากวันที่ 26 กรกฎาคมถึง 7 ตุลาคม 2014 เราระบุผู้ป่วย 69 กับอีวีดีที่ถูกสงสัยว่า (ผู้ป่วย 3), อาจเกิดขึ้น (ผู้ป่วย 28), หรือยืนยัน (38 ผู้ป่วย) ผู้ป่วยเหล่านี้ 33 ถูกชาย และ 36 ได้หญิง 80% ของผู้ป่วยถูกผู้ใหญ่ระหว่างอายุ 21 – 60 ปี (รูป 2AFIGURE 2สงสัย น่า และยืนยันกรณีโรคอีโบลาไวรัส (อีวีดี) ในสาธารณรัฐประชาธิปไตยคองโก). ระหว่างผู้ป่วยกับโรคที่สงสัย สัดส่วนสูงของเด็กมากกว่าผู้ใหญ่พบว่ามีโรคอีวีดีไม่ ผู้ป่วย 69, 21 ผู้ป่วยชาย และผู้ป่วยหญิง 28 ที่เสียชีวิต รวมทั้งเด็ก 3 อายุ 5 ปี เกิดในอัตราผิวกรณี 74% ระหว่างดำรง และยืนยันกรณี ถ้ามีรายงานกรณีและเสียชีวิตทั้งหมด สำหรับผู้ติดต่อจัดเป็นคู่ 28 อีวีดีป่วย ช่วงเวลา (ประจำ) มัธยฐานระหว่างวันเริ่มรายงานอาการได้ 16 วัน (ช่วง 3-27), และค่าเฉลี่ย (±SD) เป็น 16.1±4.4 วัน คล้ายกับว่า ในตะวันตก Africa.2 สำหรับ 32 49 ผู้ป่วยที่เสียชีวิต เวลามัธยฐานจากรายงานอาการเริ่มตายคือ 11 วัน (ช่วง, 1-30), และค่าเฉลี่ย 11.3±6.8 ไม่ได้วัดช่วงผู้ป่วยอื่น ๆ ที่เสียชีวิต สุขภาพ 8 ทุกคนที่ได้รับผลกระทบคือ 4 กับอีวีดีน่าเป็นและ 4 กับยืนยันอีวีดี — ตาย แย้งกับอีวีดีสงสัยผู้ ป่วยพบว่ามีอีวีดีไม่เจ็บป่วย ผู้ป่วยที่ มีอีวีดีดำรง หรือยืนยันได้มักมีไข้ ปวดศีรษะ ท้องเสีย อาเจียน หรืออาการคลื่นไส้ ล้า anorexia ปวดกล้ามเนื้อ กลืนลำบาก แดง และเลือดในอุจจาระ หรืออาเจียน (1TABLE ตาราง 1กรณีของโรคไวรัสอีโบลาดำรง หรือยืนยัน ตามรายงานสัญญาณและอาการ ในสาธารณรัฐประชาธิปไตยคองโก).ระบาดของโรคนี้มีการขับเคลื่อน โดยส่งผ่านฝ่ายบุคคล แต่กรณีและผู้ติดต่อทั้งหมดปรากฏว่า ได้มาจากกรณีดัชนีเดียว — ในคำอื่น ๆ มีความโอนย้ายมากกว่าหนึ่งจากอ่างเก็บน้ำเป็นสัตว์ที่ติดเชื้อ ฉะนี้ ถูกขังทุกกรณีเพื่อ Équateur จังหวัด Boende เมือง (ประมาณ 45000 คน กับสี่สุขภาพพื้นที่ได้รับผลกระทบ), Boende Moke, Bokongo, Lokolia, Lokula, Mondombe และ Watsi Kengo (ตั้งแต่ 4000 ถึง 12000 คน), ซึ่งอยู่ใน หรือใกล้ กับถนน RP314 (รูปที่ 1) ส่วนใหญ่ สงสัย ดำรง หรืออีวีดียืนยันกรณีมีการรายงานจาก Lokolia (กรณี 39) หรือ Watsi Kengo (18 กรณี), กับกรณีเฉพาะ 4 รายงานจากเมือง Boende และอีก 8 จากเมืองอื่น ๆ ในอำเภอจำนวนของกรณีที่มีรายงานในสัปดาห์เริ่มวันที่ 17 สิงหาคมและ 24 ตามวันเริ่มมีอาการของอาการ (รูปที่ 2B) มันเป็นไปได้ โดยพล็อตทุกกรณีอุบัติการณ์ แยกแยะกรณี หลายรุ่นตามที่ระบุ โดยยอดหกในอุบัติการณ์ รวมถึงกรณีดัชนีเริ่มต้น (รูปที่ 2C) เหล่านี้ครอบคลุมประมาณห้าประจำช่วง (เฉลี่ย 16.1 ล้านวัน), สร้างจำนวน 69 กรณี 70 วัน (รูปที่ 2D)เพิ่มขึ้นในกรณีเกิดระหว่างเดือนสิงหาคมเห็นได้ชัดขับเคลื่อน ด้วยเชื้อหลายที่มาจากกรณีดัชนี ของผู้ป่วยที่ 29 ที่อีวีดีถูกวินิจฉัยในช่วงวันแรก 24 ระบาด 21 ได้รายงานให้ ติดต่อโดยตรงกรณีดัชนี (เช่น พวกเขาทางกายภาพติดต่อ หรือติดต่อกับของเหลวในร่างกาย) ถ้ากรณีรองเหล่านี้แน่นอนได้รับเชื้อจากแหล่งเดียว นี้แทน number2 ซ้ำกรณีพื้นฐาน (R 0) ของ 21 สำหรับการระบาดของโรคนี้จำนวนกรณีและปัญหารองที่เกิดจากแต่ละกรณีหลักในระหว่างการระบาดของโรคนี้สูงตัวแปรได้ ในผู้ป่วยอื่น ๆ ด้วยอีวีดีที่ติดชื่อผู้ติดต่อ ผู้ป่วย 1 สร้างกรณีรอง 3 ผู้ป่วยที่ 2 สร้างเป็น 2 กรณีละ ผู้ป่วย 30 สร้างกรณีพิเศษเดียว และผู้ป่วย 11 สร้างกรณีเติมไม่ กรณีรองทั้งหมดที่เกิดขึ้นระหว่างชื่อผู้ติดต่อ รวมถึงกรณีดัชนี การตรวจนับหมายเลขซ้ำกรณีเฉลี่ย (R) การระบาดของโรคทั้งหมดถูก 1.29 (95% ช่วงความเชื่อมั่น [CI] −4.71 กับ 7.29) อย่างไรก็ตาม หลังจากการกันกรณี 21 สร้างกรณีดัชนี หมายเลขซ้ำกรณีเฉลี่ยระหว่างสธ.ถูก 0.84 (95% CI, −0.38 กับ 2.06), ซึ่งต่ำกว่าค่าขีดจำกัดสำหรับการส่งแบบ (R > 1) นี้อธิบายการสังเกตลดลงของอุบัติการณ์กรณีอีวีดีหลังจากกลางเดือนสิงหาคม ล่าสุดรายงานผู้ป่วยกับอีวีดีเริ่มป่วยในวันที่ 4 ตุลาคม และเพิ่มเติมไม่ มีรายงานกรณีวันที่ 7 ตุลาคมป.ณ. 1121 ผู้ติดต่อของผู้ป่วยทั้งหมดถูกลงทะเบียนสำหรับการติดตามผล โดยเดือน 7 ตุลาคม จำนวน 830 ได้รับตามวันที่ 21 ซึ่งถือเป็นระยะฟักตัวสูงสุด ดัชนีผู้ป่วยและติดต่อเธอได้ไม่มีประวัติเดินทางไปยังประเทศที่ได้รับผลกระทบอีวีดีในแอฟริกาตะวันตก (กินี ไลบีเรีย ไนจีเรีย เซเนกัล และสาธารณรัฐเซียร์ราลีโอน) และไม่มีประวัติของผู้ติดต่อกับผู้อยู่อาศัยในพื้นที่ที่ได้รับผลกระทบรหัสและคุณสมบัติของไวรัสระบุตัวแทนสาเหตุการระบาด Boende อีวีดี นักสืบ ที่ Biomédicale สถาบันชาติ de Recherche ในกินชาซา และศูนย์นานาชาติ de Recherches Médicales de Franceville ในสาธารณรัฐกาบองวิเคราะห์ตัวอย่างที่ 8 จากผู้ป่วยที่ถูกสงสัยว่ามี EDV โดยใช้ทั้งแบบธรรมดา filoviridae เฉพาะ RT-PCR วิเคราะห์กำหนดเป้าหมายพื้นที่นำในยีน L และวิเคราะห์ RT-PCR แบบเรียลไทม์ที่กำหนดเป้าหมายยีน nucleoprotein ใน EBOV หกอย่างแปดทดสอบบวกสำหรับ EBOV ลำดับของส่วน 346 bp ขยายจากยีน L ในสี่ของตัวอย่างการเปิดเผยลำดับไวรัส ลำดับสี่เหล่านี้ได้เหมือนกัน และที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับตัวแปร EBOV ที่ทำให้เกิดการระบาดของโรคอีวีดีรอบ Kikwit, Zaire (ตอนนี้ส่วนของ DRC), 1995 บ่งชี้ว่า ปัจจุบันระบาดใน DRC ไม่เกี่ยวข้องกับการระบาดของโรคอย่างต่อเนื่องในแอฟริกาตะวันตก (3FIGURE เลข 3ต้นไม้ phylogenetic ของสายพันธุ์ไวรัสอีโบลา (EBOV) ที่แยกต่างหากในแอฟริกาที่เส้นศูนย์สูตรและแอฟริกาตะวันตก). เราได้ลำดับรหัสสมบูรณ์ของไวรัสจากตัวอย่างที่มีอาร์เอ็นเอโหลดสูงสุด และลำดับของนิวคลีโอไทด์ 18,953 ยาว ซึ่งถูกเรียกว่า EBOV/H.sap/COD/14/Boe-Lok ตาม nomenclature6 ตัวแปร filovirus เพิ่งก่อตั้ง ได้รับ (GenBank ทะเบียนหมายเลข KM519951 ดู GenBank หมายเลข KM517570.1 และ KM517571.1 ซึ่งได้รับจากการวิเคราะห์ RT-PCR เริ่มต้น) ลำดับที่แสดงให้เห็นเอกลักษณ์ 99.2% (0.8% ความแตกต่าง กลายพันธุ์ 145) กับตัวแปรที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุดที่แยกระหว่างสธ. Kikwit 1995 (EBOV/H.sap/COD/95/Kikwit-13709) ระหว่างกลายพันธุ์ 145, 22 ถูก nonsynonymous แต่ไม่ได้คาดว่าจะก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลงที่สำคัญในลำดับโปรตีนไวรัส โดยเฉพาะอย่างยิ่ง เราสังเกตกลายพันธุ์ nonsynonymous 5 ในยีน NP, 1 ในยีน VP35, 1 ในยีน VP40, 8 ในยีน GP ไม่มีในยีน VP30, 2 ในยีน VP24 และ 5 ในยีน Lเราแล้วดำเนินการจัดลำดับอัตราความเร็วสูงในสองตัวอย่างบวกเพิ่มเติมหลังจากขยายสุ่มของอาร์เอ็นเอรวมแยกจากตัวอย่างซีรั่ม ให้โหลดไวรัสปานกลางในซีรั่ม เราไม่สามารถได้รับลำดับที่สมบูรณ์แต่เพียง 2270 bp จาก bp 12,501 และชิ้นงานตัวอย่างหนึ่งจากตัวอย่างอื่น ๆ ได้ วิเคราะห์ลำดับเหล่านี้บางส่วนแสดง identity ของ 100% สมบูรณ์ลำดับได้รับก่อนหน้านี้ แนะนำเพิ่มเติม ว่าปัจจุบันระบาดใน DRC ใช้เนื่องจากบทนำเดี่ยวของนวนิยายนี้ตัวแปร EBOV ในประชากรมนุษย์ตรงข้ามความคล้ายกันระหว่างตัวแปร Boende และอื่น ๆ เส้นศูนย์สูตรแอฟริกาตัวแปร (โดยเฉพาะอย่างยิ่ง EBOV/H.sap/COD/95/Kikwit-13709), ลำดับยีนของ Lokolia แยกแสดงเฉพาะ 96.8% รหัสประจำตัว (3.2% ส่วนต่าง) กับสายพันธุ์แอฟริกาตะวันตก 601 กลายพันธุ์เมื่อเทียบกับตัวแปร Guinean (KJ660347) และกลายพันธุ์ 602 เมื่อเทียบกับตัวแปร Sierra Leonean (KM233116)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ผลลัพธ์ทางคลินิกและการวิเคราะห์ทางระบาดวิทยา

จาก 26 กรกฎาคม ถึงวันที่ 7 ตุลาคม 2014 เราระบุผู้ป่วยที่ถูกสงสัยว่า evd 69 ( 3 ราย ) น่าจะเป็น ( 28 ราย ) , หรือได้รับการยืนยัน ( 38 คน ) ของผู้ป่วยเหล่านี้ เป็นเพศชายเป็นเพศหญิง 33 และ 36 ; 80% ของผู้ป่วยผู้ใหญ่อายุระหว่าง 21 - 60 ปี ( รูปที่ 2afigure 2
สงสัยว่า ความน่าจะเป็นและได้รับการยืนยันกรณีของไวรัสโรคอีโบลา ( evd ) ในสาธารณรัฐประชาธิปไตยคองโก .
) ผู้ป่วยที่สงสัยโรคสูงกว่าสัดส่วนของเด็กมากกว่าผู้ใหญ่ พบว่ามีไม่ evd ร่วมด้วย ของผู้ป่วย ผู้ป่วยชาย 69 21 และ 28 หญิงผู้ป่วยเสียชีวิต รวมทั้ง 3 เด็กอายุต่ำกว่า 5 ปีกรณีอุบัติเหตุที่เกิดในอัตรา 74% ของความน่าจะเป็นและยืนยันกรณี ถ้าทุกกรณีและรายงานการเสียชีวิต . 28 จับคู่รายชื่อของผู้ป่วย evd , มัธยฐาน ( อนุกรม ) ช่วงระหว่างวันที่ของรายงานมีอาการ 16 วัน ( ช่วง 3 ถึง 27 ) และค่าเฉลี่ย ( ± SD ) อยู่ที่ 16.1 ± 4.4 วัน คล้ายกับว่าในแอฟริกาตะวันตก 2 32 จาก 49 รายที่เสียชีวิตเวลาเฉลี่ยจากรายงานอาการเริ่มตายเป็น 11 วัน ( ช่วง 1 - 30 ) และเฉลี่ยอยู่ที่ 11.3 ± 6.8 ; ช่วงไม่ได้วัดอื่น ๆ ผู้ป่วยที่เสียชีวิต เจ้าหน้าที่สาธารณสุขที่ได้รับผลกระทบทั้งหมด 8 - 4 กับ evd น่าจะเป็น 4 ที่มีการยืนยัน evd - ตาย เมื่อเทียบกับผู้ป่วยที่สงสัย evd ที่พบมีไม่ evd ร่วมด้วยผู้ป่วยที่น่าจะเป็น หรือยืนยัน evd มีแนวโน้มเป็นไข้ ปวดหัว ท้องเสีย อาเจียน หรืออาการคลื่นไส้ อ่อนเพลีย เบื่ออาหาร ปวดกล้ามเนื้อ ความยากในการกลืน เยื่อตาอักเสบ และเลือดในอุจจาระหรืออาเจียน ( ตาราง 1table 1
กรณีน่าจะเป็นหรือยืนยันอีโบลาไวรัสโรค , ตามรายงานอาการและอาการแสดงในสาธารณรัฐประชาธิปไตย คองโก .

)การระบาดของโรคนี้ถูกขับเคลื่อนโดยมนุษย์เพื่อการส่งมนุษย์ แต่ทุกกรณี และรายชื่อ ปรากฏมีที่มาจากดัชนีคดีเดียว -- ในคำอื่น ๆที่ไม่มีหลักฐานมากกว่าหนึ่งโอนของการติดเชื้อจากอ่างเก็บน้ำสัตว์ ดังนั้นไกลทั้งหมดกรณีมีคับ zaire2006 . kgm จังหวัดรวมทั้ง zaire2006 . kgm เมือง ( ประมาณ 45000 คน , กับสี่สุขภาพพื้นที่ได้รับผลกระทบ )zaire2006 . kgm bokongo โมก lokolia lokula , , , , mondombe และ watsi เคนโงะ ( ตั้งแต่ 4 , 000 , 000 คน ) ซึ่งตั้งอยู่ในหรือใกล้ถนน rp314 ( รูปที่ 1 ) ส่วนใหญ่สงสัยว่า ความน่าจะเป็น หรือการยืนยันกรณีของ evd ได้รับรายงานจาก lokolia ( 39 ราย หรือ watsi เคนโงะ ( 18 ราย ) มีเพียง 4 ราย จาก zaire2006 . kgm เมืองและอีก 8 จากเมืองอื่น ๆในเขตพื้นที่
จำนวนสูงสุดของกรณีที่มีรายงานว่า ในสัปดาห์ที่ผ่านมา เริ่ม 17 สิงหาคม และ 24 , ตามวันที่ของการโจมตีของอาการ ( รูปที่ 2B ) มันเป็นไปได้ โดยวางแผนการเกิดคดีรายวัน เพื่อแยกแยะหลายรุ่นของกรณี , ตามที่ระบุโดยหกยอดในอุบัติการณ์ รวมถึงกรณีที่ดัชนีเบื้องต้น ( รูปที่ 2 ) เหล่านี้ครอบคลุมประมาณห้าช่วงต่อเนื่อง ( เฉลี่ย 16.1 วัน )สร้างจำนวน 69 รายใน 70 วัน ( รูปที่ 2 ) .
เพิ่มขึ้นในกรณีที่อุบัติการณ์ในระหว่างเดือนสิงหาคม ปรากฏว่าแรงผลักดันจากหลายเชื้อที่ได้มาจากดัชนีกรณี ของผู้ป่วยที่ได้รับการวินิจฉัยว่า evd 29 ในช่วง 25 วันแรกของการระบาด มีการติดต่อโดยตรง 21 ของดัชนีกรณี ( เช่น มีการติดต่อทางกายภาพ หรือติดต่อกับของเหลวในร่างกาย )ถ้ากรณีรองเหล่านี้แน่นอนได้รับการติดเชื้อจากแหล่งเดียว นี้แสดงถึงพื้นฐานกรณีการสืบพันธุ์ number2 ( R 0 ) 21 สำหรับการระบาดของโรคนี้
จำนวนรองคดีที่เกิดจากแต่ละคดีหลักในคราวนี้คือสูง ในหมู่อื่น ๆ ผู้ป่วยที่ติดเชื้อ evd ชื่อผู้ติดต่อ , 1 ผู้ป่วยที่สร้างขึ้น 3 กรณี รอง2 ) สร้างขึ้นอีก 2 รายละ 30 ผู้ป่วยสร้างเดียวพิเศษกรณี 11 ผู้ป่วยสร้างไม่มีรายต่อไป นับรองคดีที่เกิดระหว่างชื่อที่ติดต่อ รวมถึงดัชนีกรณี กรณีการเฉลี่ยจำนวน ( R ) สำหรับการรวม 1.29 ( 95% ช่วงความเชื่อมั่น [ CI ] − 4.71 7.29 ) อย่างไรก็ตามหลังจากการยกเว้นของ 21 ราย ที่สร้างขึ้นโดยดัชนีกรณี กรณีการเฉลี่ยจำนวนในระหว่างการระบาดของโรคเป็น 0.84 ( 95% CI , − 0.38 2.06 ) ซึ่งต่ำกว่าค่าเกณฑ์เพื่อการส่งข้อมูลแบบถาวร ( r > 1 ) นี้จะอธิบายถึงการตรวจสอบกรณีการปฏิเสธใน evd หลังจากกลางเดือนสิงหาคม รายงานล่าสุด evd กับผู้ป่วยที่ป่วยใน 4 ตุลาคมและไม่มีรายต่อไป มีรายงานเมื่อวันที่ 7 ตุลาคม
รวม 1329 ติดต่อของผู้ป่วยได้ลงทะเบียนเพื่อติดตาม โดยวันที่ 7 ตุลาคม รวม 830 ได้รับการติดตามอย่างน้อย 21 วัน ซึ่งถือเป็นระยะเวลาสูงสุด ดัชนีของผู้ป่วยและติดต่อเธอไม่มีประวัติเดินทางไป evd ผลกระทบประเทศในแอฟริกาตะวันตก ( กินี ไลบีเรีย ไนจีเรีย เซเนกัลและเซียร์ราลีโอน ) และไม่มีประวัติสัมผัสกับประชาชนในพื้นที่ที่ได้รับผลกระทบ .
การจำแนกและคุณสมบัติของไวรัส
ระบุตัวแทนที่เป็นสาเหตุของ zaire2006 . kgm evd ระบาดนักวิจัยที่สถาบันแห่งชาติเดอ ใน biom é dicale ในกินชาซาและศูนย์นานาชาติ recherches de M é dicales de franceville ในประเทศกาบองวิเคราะห์ 8 ตัวอย่าง จากผู้ป่วยที่สงสัยว่ามี edv .บนพื้นฐานของทั้งสอง โดยเฉพาะวิธี RT-PCR ฟิโลวิริดีเล็งเขตอนุรักษ์ใน L ยีนและเรียลไทม์โดยเป้าหมายนี้นิ วคลีโอโปรตีนยีนใน ebov หกของแปดตัวอย่างทดสอบบวกสำหรับ ebov . ลำดับของเบสเบสเบสจาก 346 L ยีนใน 4 ตัวอย่าง พบยีนไวรัสเหล่านี้สี่ลำดับมีเหมือนกันและที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ ebov ตัวแปรที่ก่อให้เกิด evd ระบาดรอบคิกวิทซาอีร์ ( ตอนนี้ , ส่วนหนึ่งของ DRC ) ในปี 1995 ระบุว่า การระบาดของโรคในปัจจุบันใน DRC ไม่เกี่ยวกับระบาดอย่างต่อเนื่องในแอฟริกาตะวันตก ( รูป 3figure 3
phylogenetic ต้นไม้ของอีโบลาไวรัส ( ebov ) สายพันธุ์ที่แยก ในแถบเส้นศูนย์สูตรแอฟริกาและแอฟริกาตะวันตก .
)เราได้รับรหัสสมบูรณ์ลำดับของไวรัสจากตัวอย่างมีโหลด RNA สูงสุดและได้รับการเรียงลำดับของนิวคลีโอไทด์ใน 18953 ยาวซึ่งถูกเรียกว่า ebov / h.sap/cod/14/boe-lok ตามนี้แตกต่าง nomenclature6 หมายเลขภาคยานุวัติฟิโลไวรัส ( ขนาด km519951 ; ดูยังพบ km517570.1 km517571.1 และตัวเลข ,ซึ่งได้จากการวิเคราะห์นี้ครั้งแรก ) ลําดับที่พบ 99.2% เอกลักษณ์ ( 0.8 % ความแตกต่าง 145 การกลายพันธุ์ ) ที่มีตัวแปรที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่ถูกแยกในช่วง 1995 คิกวิทระบาด ( ebov / h.sap / COD / 95 / kikwit-13709 ) ระหว่าง 145 การกลายพันธุ์ nonsynonymous 22 คน แต่คาดว่าจะก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลงที่สำคัญใด ๆในลำดับโปรตีนไวรัส โดยเฉพาะอย่างยิ่งเราพบการกลายพันธุ์ในยีน 5 nonsynonymous NP 1 ใน vp35 ยีน 1 ใน vp40 ยีน , 8 ใน GP ยีน ไม่มีใน vp30 ยีน 2 ยีนใน vp24 และ 5 ใน L ยีน
เราแล้วทำการช่วยลำดับสองเพิ่มเติมตัวอย่างแบบสุ่มของหลังบวกได้ทั้งหมด ซึ่งจากตัวอย่างซีรั่ม ให้โหลดไวรัสในระดับปานกลางในเซรั่มเราไม่สามารถได้รับลำดับสมบูรณ์แต่ 2270 BP จากตัวอย่างหนึ่งและ 12501 BP จากตัวอย่างอื่น ๆ การวิเคราะห์ลำดับบางส่วนเหล่านี้แสดงเอกลักษณ์ของ 100% กับสมบูรณ์ลำดับต่อไปจะได้ก่อนหน้านี้ ที่ระบาดในปัจจุบันใน DRC เนื่องจากเดียวแนะนำใหม่นี้ ebov ตัวแปรในประชากรมนุษย์ .
ในทางตรงกันข้าม ความเหมือนระหว่างตัวแปรและตัวแปรอื่น ๆแถบเส้นศูนย์สูตรแอฟริกา zaire2006 . kgm ( โดยเฉพาะ ebov / h.sap / COD / 95 / kikwit-13709 ) , ยีน ลำดับ lokolia แยก พบเพียง 96.8 % ตัวตน ( ความแตกต่างร้อยละ 3.2 ) กับสายพันธุ์แอฟริกาตะวันตกกับ 601 การกลายพันธุ์เมื่อเทียบกับคนพื้นเมืองในสาธารณรัฐกินีตัวแปร ( kj660347 ) และ 602 การกลายพันธุ์เมื่อเทียบกับเทือกเขา leonean ตัวแปร ( km233116 )