Within the Photorhabdus clade, thre

Within the Photorhabdus clade, three subclades (noted CP-I,
CP-II and CP-III) were clearly distinguished: these three
lineages appear to have emerged simultaneously from one
common ancestor. The phylogenetic node which linked the
subclades Photorhabdus luminescens and Photorhabdus
temperata (Fig. 1) had a low bootstrap value (0.63) and
was only supported by the analysis of two genes, recA and
gltX (Figs 3 and 4). The subclade CP-I included the
sequences of the species P. luminescens. Four P. luminescens
subspecies of the five currently described were included in
CP-I: P. luminescens subsp. akhurstii; P. luminescens subsp.
kayaii; P. luminescens subsp. laumondii and P. luminescens
subsp. luminescens. For each of four genes – recA (Fig. 3),
gyrB (Fig. 5), dnaN (Fig. 6) and rplB (Fig. 7) – the
sequences of the P. luminescens subsp. kayaii type strain
CIP 108428T were similar to those of strains IT12, FR33,
C8406 and KR04, indicating that these strains belong to the
same subspecies. However, for the gltX gene, the sequence
of the type strain was not closely related to those of the
other four strains, suggesting that this sequence was
probably obtained by LGT. Strain CIP 108426T has been
described as the type strain of P. luminescens subsp.
thracensis on the basis of its 16S rRNA gene sequence
(Hazir et al., 2004). We also confirmed that the 16S rRNA

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ภายใน clade Photorhabdus สาม subclades (ตั้งข้อสังเกต CP-I,
CP-II และ CP-III) มีความโดดเด่นอย่างชัดเจนทั้งสาม
lineages
ปรากฏว่าได้โผล่ออกมาพร้อมกันจากบรรพบุรุษร่วมกัน โหนดสายวิวัฒนาการที่เชื่อมโยง
subclades luminescens Photorhabdus และ Photorhabdus
temperata (รูปที่ 1). มีค่าบูตต่ำ (0.63)
และได้รับการสนับสนุนโดยเฉพาะการวิเคราะห์ของทั้งสองยีนrecA และ
gltX (มะเดื่อ 3 และ 4) subclade
CP-ฉันรวมถึงลำดับของสายพันธุ์พีluminescens สี่พี luminescens
ย่อยในห้าที่อธิบายไว้ในปัจจุบันถูกรวมอยู่ใน
CP-I: พี luminescens subsp akhurstii; พี luminescens subsp.
kayaii; พี luminescens subsp laumondii พี luminescens
subsp luminescens สำหรับแต่ละสี่ยีน - recA. (รูปที่ 3)
gyrB (รูปที่ 5.) dnaN (รูปที่ 6.) และ rplB (รูปที่ 7.) -
ลำดับของพี luminescens subsp ประเภท kayaii สายพันธุ์
CIP 108428T มีความคล้ายคลึงกับสายพันธุ์ IT12, FR33,
C8406 และ KR04
แสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์เหล่านี้เป็นของย่อยเดียวกัน แต่สำหรับยีน gltX
ลำดับของสายพันธุ์ชนิดที่ไม่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับผู้ที่อยู่ในอีกสี่สายพันธุ์บอกว่าลำดับนี้อาจจะได้รับโดยLGT สายพันธุ์ CIP 108426T ได้รับการอธิบายว่าเป็นสายพันธุ์ชนิดของพีluminescens subsp. thracensis บนพื้นฐานของ 16S rRNA ลำดับยีนของมัน(Hazir et al., 2004) นอกจากนี้เรายังได้รับการยืนยันว่า 16S rRNA

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ใน clade photorhabdus สาม subclades ( สังเกต cp-i
cp-ii , และแตกต่างอย่างชัดเจน cp-iii ) : 3
เมื่อปรากฏเกิดขึ้นพร้อมกันจาก
บรรพบุรุษร่วม . การวิวัฒนาการที่เชื่อมโยงปม
subclades และ photorhabdus luminescens photorhabdus
temperata ( รูปที่ 1 ) มีมูลค่าเท่ากับต่ำ ( 0.63 ) และ
เป็นเพียงการสนับสนุนโดยการวิเคราะห์ยีนสองรีก้าและ
,gltx ( มะเดื่อ 3 และ 4 ) การ subclade cp-i รวม
ลำดับของชนิดหน้า luminescens . สี่หน้า luminescens
ชนิดย่อยของห้ากำลังอธิบายอยู่ใน cp-i
: P luminescens subsp . akhurstii ; P luminescens subsp .
kayaii ; P luminescens subsp . laumondii และ P . luminescens
subsp . luminescens . สำหรับแต่ละสี่ยีน–รีก้า ( รูปที่ 3 ) ,
gyrb ( รูปที่ 5 ) , dnan ( ภาพที่ 6 ) และ rplb ( ฟิค7 ) )
5 P . luminescens subsp . kayaii ชนิดสายพันธุ์
CIP 108428t เป็นคล้ายกับบรรดาของสายพันธุ์ it12 fr33
, , และ c8406 kr04 แสดงว่าสายพันธุ์เหล่านี้เป็นของ
สายพันธุ์เดียวกัน อย่างไรก็ตาม สำหรับ gltx ยีน ลำดับ
ชนิดสายพันธุ์ที่ไม่ใกล้เคียงกับของ
อีก 4 สายพันธุ์ แนะนำว่า ลำดับนี้
อาจได้รับโดย LGT .สายพันธุ์ 108426t CIP ได้
อธิบายชนิดของเชื้อ P . luminescens subsp .
thracensis บนพื้นฐานของยีน 16S rRNA ลำดับ
( hazir et al . , 2004 ) เรายังยืนยันว่า 16S rRNA