The best pose generated from each r

The best pose generated from each run of the ligands docked to the protein complexes were sorted using the Rerank Score (increase the accuracy of the ranked order of the poses) that is based on linear combination of E-inter (steric, van der Waals,
H-bonding & electrostatic), E-intra (torsions, sp2–sp2, hydrogen bonding, electrostatic) and considers Steric (by LJ12-6) terms which are Lennard-Jones approximations for the steric energy [32]. Final sorting of the ligands were done on the basis of binding affinity as shown by the top ranked pose of each ligand.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ก่อให้เกิดดีที่สุดที่สร้างจากแต่ละรัน ligands ที่ย้ายไปโปรตีนคอมเพล็กซ์เรียงใช้ Rerank คะแนน (เพิ่มความถูกต้องของใบสั่งการจัดอันดับของการโพสท่า) ที่อยู่บนผลรวมเชิงเส้นของ E-อินเตอร์ (steric, van der Waalsไฟฟ้าสถิต และ H-bonding), อีอินทรา (torsions, sp2-sp2 ยึด งานไฮโดรเจน) และพิจารณาเงื่อนไข Steric (โดย LJ12-6) ซึ่งเป็นเพียงการประมาณ Lennard โจนส์พลังงาน steric [32] เรียงลำดับสุดท้ายของ ligands จะทำ โดยผูกความสัมพันธ์แสดง โดยลำดับก่อให้เกิดของลิแกนด์แต่ละด้านบน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ที่ดีที่สุดท่าที่เกิดจากการทำงานในแต่ละแกนด์เทียบกับโปรตีนคอมเพล็กซ์ถูกจัดเรียงโดยใช้คะแนน Rerank (เพิ่มความถูกต้องของการสั่งซื้อการจัดอันดับของการโพสท่า) ที่อยู่บนพื้นฐานของการรวมกันเชิงเส้นของ E-ระหว่าง (steric แวนเดอร์ Waals,
H-พันธะและไฟฟ้าสถิต) E-ภายใน (torsions, sp2-sp2 พันธะไฮโดรเจนไฟฟ้าสถิต) และคิดว่า Steric (โดย LJ12-6) ซึ่งเป็นคำที่ใกล้เคียง Lennard โจนส์สำหรับพลังงาน steric [32] การเรียงลำดับสุดท้ายของแกนด์ได้ทำบนพื้นฐานของความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดผูกพันที่แสดงโดยด้านบนการจัดอันดับท่าของแต่ละแกนด์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ท่าที่ดีที่สุดที่สร้างขึ้นจากแต่ละรันของลิแกนด์เทียบกับโปรตีนเชิงซ้อนถูกเรียงใช้คะแนน rerank ( เพิ่มความแม่นยำของการจัดอันดับเพื่ออากัปกิริยา ) ที่อยู่บนพื้นฐานของการรวมกันเชิงเส้นของ e-inter ( เอ แวนเดอวาลส์
พันธะ , &ไฟฟ้าสถิต ) torsions e-intra ( SP2 ) , SP2 , พันธะไฮโดรเจน ,ไฟฟ้าสถิต ) และพิจารณาเอ ( โดย lj12-6 ) ซึ่งเป็นข้อตกลง เลนนาร์ด โจนส์ใกล้เคียงสำหรับพลังงานเอ [ 32 ] การเรียงลำดับสุดท้ายของลิแกนด์ ทำไปบนพื้นฐานของการผูกความสัมพันธ์ที่แสดงโดยด้านบนการจัดอันดับโพสของแต่ละระบบ .