Abstract
We determined the complete mitochondrial (mt) genomes of the deep-sea squid (Bathyteuthis abyssicola; supperfamily Bathyteuthoidea), the bob-tail squid (Semirossia patagonica;ORDER Sepiolida) and four giant cuttlefish (Sepia apama, S. latimanus,S. lycidas and S. pharaonis; order Sepiida). The unique structures of the mt genomes ofBathyteuthis and Semirossia provide new information about the evolution of decapodiform mt genomes. We show that the mt genome of B. abyssicola, like those of other oegopsids studied so far, has two long duplicated regions that include seven genes (COX1–3, ATP6 and ATP8, tRNAAsn, and either ND2 or ND3) and that one of the duplicated COX3 genes has lost its function. The mt genome of S. patagonica is unlike any other decapodiforms and, like Nautilus, its ATP6 and ATP8 genes are not adjacent to each other. The four giant cuttlefish have identical mt gene order to other cuttlefish determined to date. Molecular phylogenetic analyses using maximum likelihood and Bayesian methods suggest that traditional order Sepioidea (Sepiolida + Sepiida) is paraphyletic and Sepia (cuttlefish) has the sister-relationship with all other decapodiforms. Taking both the phylogenetic analyses and the mt gene order analyses into account, it is likely that the octopus-type mt genome is an ancestral state and that it had maintained from at least the Cephalopoda ancestor to the common ancestor of Oegopsida, Myopsida and Sepiolida.
บทคัดย่อเรากำหนด genomes สมบูรณ์ยล (mt) ปลาหมึกน้ำลึก (Bathyteuthis abyssicola; supperfamily Bathyteuthoidea), บ๊อบหางปลาหมึก (Semirossia patagonica; Sepiolida สั่ง) และปลาหมึกยักษ์สี่ (ซีเปีย apama, S. latimanus, S. lycidas และ S. pharaonis สั่ง Sepiida) โครงสร้างเฉพาะของ mt genomes ofBathyteuthis และ Semirossia ให้ข้อมูลใหม่เกี่ยวกับวิวัฒนาการของ decapodiform mt genomes เราแสดงว่า จีโน abyssicola B. เช่นของ oegopsids อื่น ๆ ศึกษาฉะนี้ mt มีซ้ำยาวสองภูมิภาคที่มียีนเจ็ด (COX1-3, ATP6 และ ATP8, tRNAAsn และ ND2 หรือ ND3) และว่า ยีน COX3 ที่ซ้ำกันอย่างใดอย่างหนึ่งได้สูญเสียฟังก์ชั่น จีโน mt S. patagonica ไม่เหมือน decapodiforms อื่น ๆ ใด ๆ และ เช่น Nautilus ของยีน ATP6 และ ATP8 จะไม่ติดกัน ปลาหมึกยักษ์สี่มียีนเหมือน mt เพื่อปลาหมึกอื่น ๆ ที่กำหนดวัน วิเคราะห์ทางโมเลกุลโดยใช้ทฤษฎีวิธีและโอกาสสูงสุดแนะนำว่า สั่งแบบ Sepioidea (Sepiolida + Sepiida) เป็น paraphyletic และซีเปีย (ปลาหมึก) มีความสัมพันธ์น้องสาวกับ decapodiforms อื่น ๆ การวิเคราะห์ผลและการวิเคราะห์ลำดับยีน mt เข้าบัญชี เป็นไปได้ว่า จีโน mt ชนิดปลาหมึกเป็นสถานะของบรรพบุรุษ และที่มันมีสภาพจากน้อยบรรพบุรุษ Cephalopoda ที่บรรพบุรุษของ Oegopsida, Myopsida และ Sepiolida
การแปล กรุณารอสักครู่..

บทคัดย่อเรามุ่งมั่นที่สมบูรณ์ของไมโตคอนเดรีย ( MT ) จีโนมของปลาหมึกน้ำลึก ( bathyteuthis abyssicola ; supperfamily bathyteuthoidea ) , บ๊อบ หาง ปลาหมึก ( semirossia patagonica ; สั่งซื้อ sepiolida ) และสี่ปลาหมึกยักษ์ ( ซีเปีย apama เอส latimanus , S และ S . pharaonis ลีซิแด็ซ ; สั่งซื้อ sepiida ) เฉพาะโครงสร้างของจีโนม ofbathyteuthis semirossia ) และให้ข้อมูลใหม่เกี่ยวกับวิวัฒนาการของ decapodiform ตันหา . เราแสดงให้เห็นว่าค่ายจีโนม พ. abyssicola , ผู้ที่ชอบ oegopsids อื่นเรียนจนมีสภาพพื้นที่ที่ยาวนานรวมถึงเจ็ดยีน ( cox1 – 3 , atp6 atp8 trnaasn และ , และให้ nd2 หรือ nd3 ) และหนึ่งใน cox3 ยีนๆการสูญเสียฟังก์ชัน ค่ายจีโนมของ S . patagonica เป็นแตกต่างอื่น ๆและ decapodiforms Nautilus , atp6 atp8 ยีนและไม่ได้อยู่ติดกับแต่ละอื่น ๆ ยักษ์สี่ปลาหมึกมียีนเหมือนกัน ) เพื่อให้อื่น ๆปลาหมึก กำหนดให้วันที่ การวิเคราะห์วิวัฒนาการโมเลกุลโดยใช้ความน่าจะเป็นสูงสุดและวิธีการแบบดั้งเดิมเพื่อให้ sepioidea ( sepiolida + sepiida ) และ paraphyletic ซีเปีย ( ปลาหมึก ) มีความสัมพันธ์กับน้องสาว decapodiforms อื่นๆทั้งหมด ซึ่งใช้ทั้งการวิเคราะห์และการวิเคราะห์ยีน ) เพื่อเข้าบัญชี มีแนวโน้มว่า หมึกพิมพ์ MT จีโนมเป็นบรรพบุรุษของรัฐและจะรักษาอย่างน้อย Cephalopoda บรรพบุรุษกับบรรพบุรุษของ oegopsida myopsida sepiolida , และ .
การแปล กรุณารอสักครู่..
