The abundance and population struct

The abundance and population structure of pseudomonads in soils collected from long-(1006 years) and short-(54 years) term grapevine monocultures in Switzerland were examined across five soil horizons within the 1.20–1.35 m range. Soil samples were baited with grapevine, and rhizosphere pseudomonads containing the biocontrol genes phlD (2,4-diacetylphloroglucinol synthesis) and/or hcnAB (hydrogen cyanide synthesis) were analyzed by MPN-PCR. The numbers of total, phlD+ and hcnAB+ pseudomonads decreased with depth by 1.5–2 log (short-term monoculture) and 3–3.5 log (long-term monoculture). In addition, the percentages of phlD+ (except in short-term monoculture) and hcnAB+ pseudomonads were also lower in deeper horizons. RFLP-profiling of phlD+ and hcnAB+ pseudomonads revealed three phlD and twelve hcnAB alleles overall, but the number of alleles for both decreased in relation to depth. The only phlD allele found in deeper horizons was also found in topsoil, whereas one hcnAB allele (k) found in deeper horizons in long-term monoculture was absent in the topsoil. This suggests that certain Pseudomonas ecotypes are adapted to specific depths. Four hcnAB alleles enabled discrimination between monocultures. We conclude that soil depth is a factor selecting phlD and hcnAB genotypes, and that the allelic diversity of the two biocontrol genes decreases with depth.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความอุดมสมบูรณ์และประชากรโครงสร้างของ pseudomonads ในดินที่เก็บจากยาว- (1006 ปี) และระยะสั้น- (54 ปี) คำลือ monocultures ในสวิตเซอร์แลนด์ถูก examined ทั่วฟ้าดินห้าช่วง 1.20-1.35 เมตร ตัวอย่างดินถูกล่อหลอกที่ฐานตอนกล่อง และ pseudomonads ไรโซสเฟียร์ที่ประกอบด้วย phlD ยีน biocontrol (สังเคราะห์ 2, 4-diacetylphloroglucinol) หรือ hcnAB (สังเคราะห์ไฮโดรเจนไซยาไนด์) ถูกวิเคราะห์ โดย MPN PCR หมายเลขของ pseudomonads รวม phlD + และ hcnAB + ลดลงลึก โดยล็อก 1.5 – 2 (ปลูกพืชเชิงเดี่ยวระยะสั้น) และล็อก 3 – 3.5 (ระยะยาวปลูกพืชเชิงเดี่ยว) นอกจากนี้ เปอร์เซ็นต์ของ phlD + (ยกเว้นในระยะสั้นปลูกพืชเชิงเดี่ยว) และ hcnAB + pseudomonads ยังต่ำกว่าในขอบเขตที่ลึก รวบรวมสถานะ RFLP ของ pseudomonads phlD + และ hcnAB + เปิดเผย phlD สามและสิบสอง hcnAB alleles โดยรวม แต่ลดจำนวนของ alleles ทั้งลึก อัล phlD เฉพาะในขอบเขตที่ลึกยังพบในชั้นดิน ในขณะที่หนึ่ง hcnAB อัลลีล (k) พบในขอบเขตที่ลึกในระยะยาวปลูกพืชเชิงเดี่ยวคือขาดในชั้นดิน นี้แสดงให้เห็นว่า บาง ecotypes Pseudomonas เหมาะสมกับความลึกเฉพาะ Alleles hcnAB สี่เปิดใช้งานการเลือกปฏิบัติระหว่าง monocultures เราสรุปว่า ความลึกของดินเป็นปัจจัยการเลือกศึกษาจีโนไทป์ phlD และ hcnAB และความหลากหลายสอง biocontrol ยีน allelic ลดลงกับความลึก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความอุดมสมบูรณ์และโครงสร้างประชากรของ pseudomonads ในดินที่เก็บได้จากระยะยาว (1006 ปี) และระยะสั้น (54 ปี) เชิงเดี่ยวระยะองุ่นในประเทศสวิสเซอร์แลนด์มีการตรวจสอบในห้าช่วงชั้นดินอยู่ในช่วง 1.20-1.35 เมตร ตัวอย่างดินถูกกลั่นแกล้งด้วยองุ่นและ pseudomonads บริเวณรากที่มียีนควบคุมทางชีวภาพ phlD (สังเคราะห์ 2,4-diacetylphloroglucinol) และ / หรือ hcnAB (สังเคราะห์ไฮโดรเจนไซยาไนด์) มาวิเคราะห์โดย MPN-PCR ตัวเลขจากทั้งหมด phlD + + และ hcnAB pseudomonads ลดลงโดยมีความลึก 1.5-2 เข้าสู่ระบบ (เชิงเดี่ยวระยะสั้น) และ 3-3.5 ล็อก (ระยะยาวเชิงเดี่ยว) นอกจากนี้ร้อยละของ phlD + (ยกเว้นในเชิงเดี่ยวระยะสั้น) และ hcnAB + pseudomonads ก็ยังต่ำกว่าในอันไกลโพ้นลึก RFLP-โปรไฟล์ของ phlD + + และ hcnAB pseudomonads เปิดเผยสาม phlD สิบสองอัลลีล hcnAB โดยรวม แต่จำนวนของอัลลีลทั้งลดลงในความสัมพันธ์กับระดับความลึก เพียงคนเดียวที่พบในขอบเขตอันไกลโพ้นลึกอัลลีล phlD ยังพบในดินในขณะที่ hcnAB อัลลีล (k) พบในขอบเขตอันไกลโพ้นลึกลงไปในเชิงเดี่ยวระยะยาวอยู่ในดิน นี้แสดงให้เห็นว่าบางสายพันธุ์ Pseudomonas จะปรับระดับความลึกที่เฉพาะเจาะจง สี่อัลลีล hcnAB การเลือกปฏิบัติระหว่างเปิดการใช้งานเชิงเดี่ยว เราสรุปได้ว่าลึกของดินเป็นปัจจัยการเลือก phlD และ hcnAB จีโนไทป์และที่หลากหลาย allelic ของทั้งสองยีนควบคุมทางชีวภาพลดลงมีความลึก