What is GenBank?GenBank ® is the NI

What is GenBank?
GenBank ® is the NIH genetic sequence database, an annotated collection of all publicly available DNA sequences (Nucleic Acids Research, 2013 Jan;41(D1):D36-42). GenBank is part of the International Nucleotide Sequence Database Collaboration , which comprises the DNA DataBank of Japan (DDBJ), the European Molecular Biology Laboratory (EMBL), and GenBank at NCBI. These three organizations exchange data on a daily basis.
The complete release notes for the current version of GenBank are available on the NCBI ftp site. A new release is made every two months. GenBank growth statistics for both the traditional GenBank divisions and the WGS division are available from each release.
An annotated sample GenBank record for a Saccharomyces cerevisiae gene demonstrates many of the features of the GenBank flat file format.
Access to GenBank
There are several ways to search and retrieve data from GenBank.
• Search GenBank for sequence identifiers and annotations with Entrez Nucleotide, which is divided into three divisions: CoreNucleotide (the main collection), dbEST (Expressed Sequence Tags), and dbGSS (Genome Survey Sequences).
• Search and align GenBank sequences to a query sequence using BLAST (Basic Local Alignment Search Tool). BLAST searches CoreNucleotide, dbEST, and dbGSS independently; see BLAST info for more information about the numerous BLAST databases.
• Search, link, and download sequences programatically using NCBI e-utilities.
• The ASN.1 and flatfile formats are available at NCBI's anonymous FTP server: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/ncbi-asn1 and ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank .
GenBank Data Usage
The GenBank database is designed to provide and encourage access within the scientific community to the most up to date and comprehensive DNA sequence information. Therefore, NCBI places no restrictions on the use or distribution of the GenBank data. However, some submitters may claim patent, copyright, or other intellectual property rights in all or a portion of the data they have submitted. NCBI is not in a position to assess the validity of such claims, and therefore cannot provide comment or unrestricted permission concerning the use, copying, or distribution of the information contained in GenBank.
Confidentiality
Some authors are concerned that the appearance of their data in GenBank prior to publication will compromise their work. GenBank will, upon request, withhold release of new submissions for a specified period of time. A date must be specified; we can not hold a sequence indefinitely pending publication. However, if a paper citing the sequence or accession number is published prior to the specified date, the sequence will be released upon publication. In order to prevent the delay in the appearance of published sequence data, we urge authors to inform us of the appearance of the published data. As soon as it is available, please send the full publication data--all authors, title, journal, volume, pages and date--to the following address: [e-mail]
Privacy
If you are submitting human sequences to GenBank, do not include any data that could reveal the personal identity of the source. GenBank assumes that the submitter has received any necessary informed consent authorizations required prior to submitting sequences.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

GenBank คืออะไรGenBank ®คือ ฐานข้อมูลลำดับพันธุกรรม NIH คอลเลกชันการประกอบของลำดับทั้งหมดเผยดีเอ็นเอ (กรดนิวคลีอิกวิจัย 2013 Jan;41(D1):D36-42) GenBank เป็นส่วนหนึ่งของนานาชาตินิวคลีโอไทด์ลำดับฐานข้อมูลความร่วมมือ ซึ่งประกอบด้วยการดีเอ็นเอ DataBank ของญี่ปุ่น (DDBJ), ห้องปฏิบัติการอณูชีววิทยายุโรป (EMBL), และ GenBank ที่ NCBI องค์กรเหล่านี้สามแลกเปลี่ยนข้อมูลประจำวันเวอร์ชั่นสมบูรณ์สำหรับเวอร์ชันปัจจุบันของ GenBank จะพร้อมใช้งาน ftp ไซต์ NCBI รุ่นใหม่จะทำทุก ๆ สองเดือน มีสถิติเติบโต GenBank ส่วน GenBank ดั้งเดิมและส่วน WGS จากแต่ละเรกคอร์ GenBank ตัวอย่างประกอบสำหรับการ Saccharomyces cerevisiae ยีนแสดงให้เห็นถึงคุณลักษณะของรูปแบบแฟ้มแบน GenBank มากมายถึง GenBankมีหลายวิธีในการค้น และดึงข้อมูลจาก GenBank• GenBank หาลำดับรหัสและคำอธิบายประกอบกับ Entrez นิวคลีโอไทด์ ซึ่งแบ่งออกเป็นสามส่วน: CoreNucleotide (รวบรวมหลัก), dbEST (แสดงลำดับแท็ก), dbGSS (กลุ่มสำรวจลำดับ) และการ•ค้นหา และจัดลำดับใน GenBank ลำดับแบบสอบถามที่ใช้ระเบิด (พื้นฐานเฉพาะตำแหน่งค้นหาเครื่องมือ) ระเบิดค้นหา CoreNucleotide, dbEST และ dbGSS อิสระ ดูข้อมูลระเบิดสำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับฐานข้อมูลระเบิดจำนวนมาก•ค้นหา เชื่อมโยง และดาวน์โหลดลำดับ programatically ใช้ NCBI อีสาธารณูปโภค•รูป ASN.1 และ flatfile มีที่เซิร์ฟเวอร์ FTP แบบไม่ระบุชื่อของ NCBI: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/ncbi-asn1 และ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbankการใช้ข้อมูลของ GenBankฐานข้อมูลของ GenBank ถูกออกแบบมาเพื่อให้ และส่งเสริมให้เข้าถึงภายในชุมชนทางวิทยาศาสตร์ทันสมัย และครอบคลุมมากที่สุด DNA ลำดับข้อมูล ดังนั้น NCBI สถานไม่มีข้อจำกัดในการใช้งานหรือแจกจ่ายข้อมูล GenBank อย่างไรก็ตาม บาง submitters อาจอ้างสิทธิบัตร ลิขสิทธิ์ หรือสิทธิในทรัพย์สินทางปัญญาอื่น ๆ ทั้งหมด หรือบางส่วนของข้อมูลที่จะส่ง NCBI ไม่อยู่ในตำแหน่งที่จะประเมินความของสิทธิเรียกร้องดังกล่าว และดังนั้น ไม่สามารถให้ข้อคิดเห็นหรือจำกัดสิทธิ์ที่เกี่ยวข้องกับการใช้งาน คัดลอก การกระจายของข้อมูลที่อยู่ใน GenBankรักษาความลับบางอย่างผู้เขียนมีความกังวลว่า ลักษณะที่ปรากฏของข้อมูลใน GenBank ก่อนพิมพ์จะทำงาน GenBank จะ ตาม หักณที่จ่ายนำส่งใหม่สำหรับรอบระยะเวลาที่ระบุ ต้องระบุวันที่ นอกจากนี้เราไม่สามารถเก็บเป็นลำดับอย่างไม่มีกำหนดรอตีพิมพ์ อย่างไรก็ตาม ถ้าเอกสารที่อ้างถึงหมายเลขลำดับหรือภาคยานุวัติจะประกาศก่อนวันที่ระบุ ลำดับที่จะออกตามประกาศ เพื่อป้องกันความล่าช้าในลักษณะของลำดับการเผยแพร่ข้อมูล เรากระตุ้นให้ผู้เขียนแจ้งลักษณะที่ปรากฏของข้อมูลที่เผยแพร่ ทันทีที่มี โปรดส่งข้อมูลพิมพ์เต็มรูปแบบ - ทั้งหมดผู้เขียน ชื่อเรื่อง สมุด ปริมาตร หน้า และวัน - ไปยังที่อยู่ดังต่อไปนี้: [e-mail]ความเป็นส่วนตัวถ้าคุณต้องการส่งมนุษย์ลำดับที่ GenBank ไม่มีข้อมูลใด ๆ ที่สามารถเปิดเผยข้อมูลประจำตัวส่วนบุคคลของแหล่ง GenBank สันนิษฐานว่า ผู้ที่ได้รับการตรวจสอบจำเป็นแจ้งความยินยอมใด ๆ ที่จำเป็นก่อนส่งลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

อะไรคือขนาด ?
ขนาด®เป็น NIH ลำดับพันธุกรรมฐานข้อมูล , แสดงคอลเลกชันของสาธารณชน ( ดีเอ็นเอลำดับกรดนิวคลีอิกวิจัย 2013 ม.ค. ; 41 ( D1 ) : d36-42 ) ขนาดเป็นส่วนหนึ่งของความร่วมมือระหว่างประเทศฐานข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ประกอบด้วยดีเอ็นเอ databank ของญี่ปุ่น ( ddbj ) , ยุโรปห้องปฏิบัติการอณูชีววิทยา ( สัตว ) และพบใน ncbi .ทั้งสามองค์กรแลกเปลี่ยนข้อมูลในแต่ละวัน
สมบูรณ์ปล่อยหมายเหตุสำหรับรุ่นปัจจุบันของขนาดพร้อมใช้งานบนเว็บไซต์ FTP ncbi . ปล่อยใหม่จะทำให้ทุกสองเดือน พบการเจริญเติบโตสถิติทั้งแบบดั้งเดิม และพบกอง wgs กองที่มีอยู่จากแต่ละรุ่น .
ตัวอย่างการบันทึกบันทึกย่อขนาดสำหรับ Saccharomyces cerevisiae ยีนแสดงให้เห็นถึงคุณสมบัติต่างๆของแบนขนาดไฟล์ การเข้าถึงขนาด

มีหลายวิธีในการค้นหาและเรียกข้อมูลจากขนาด .
- ค้นหาพบลำดับนิวคลีโอไทด์และระบุหมายเหตุประกอบกับ entrez ซึ่งแบ่งออกเป็นสามส่วน : corenucleotide ( คอลเลกชันหลัก )dbest ( แสดงลำดับแท็ก ) และ dbgss ( ลำดับการสำรวจจีโนม )
- ค้นหาและเรียงลำดับในแบบสอบถามลำดับขนาดใช้ระเบิด ( เครื่องมือค้นหาการปรับพื้นฐานท้องถิ่น ) การค้นหา corenucleotide dbest ระเบิด , ระเบิด และ dbgss ได้อย่างอิสระ ; ดูข้อมูลสำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับฐานข้อมูลระเบิดมากมาย
- ค้นหา , ลิงค์และดาวน์โหลดลำดับ programatically ใช้ ncbi
e-utilities .- ส่วน asn . 1 และ flatfile รูปแบบมีอยู่ที่ ncbi ไม่ได้ระบุชื่อเซิร์ฟเวอร์ FTP และการใช้งาน : ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/ncbi-asn1 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank .

ขนาดฐานข้อมูลขนาดถูกออกแบบมาเพื่อให้ข้อมูลและสนับสนุนการเข้าถึงภายในชุมชนทางวิทยาศาสตร์มากที่สุดถึงวันที่และข้อมูลลำดับเบสดีเอ็นเออย่างละเอียด ดังนั้นncbi สถานที่ไม่มีข้อ จำกัด ในการใช้ หรือการกระจายของข้อมูลขนาด . แต่บางจัอาจเรียกร้องสิทธิบัตร ลิขสิทธิ์ หรือสิทธิในทรัพย์สินทางปัญญาในทั้งหมดหรือบางส่วนของข้อมูลที่พวกเขาได้ส่ง ncbi ไม่ได้อยู่ในตำแหน่งที่จะประเมินความถูกต้องของการเรียกร้องดังกล่าว จึงไม่สามารถให้ความเห็น หรือ ไม่จำกัดสิทธิ์ในการใช้ คัดลอกหรือการกระจายของข้อมูลที่มีอยู่บริเวณ ความลับ

บางคนเขียนมีความกังวลว่า ลักษณะของข้อมูลที่พวกเขาพบก่อนตีพิมพ์ จะยอมทำงานนี้ ขนาดจะขอระงับการส่งใหม่สำหรับรอบระยะเวลาที่ระบุ วันที่ต้องมีการระบุ ; เราไม่สามารถถือลำดับไปเรื่อย ๆรอตีพิมพ์ อย่างไรก็ตาม