16S rRNA analysis of mesophilic mix

16S rRNA analysis of mesophilic mixed culture

The cloning results show that a total of 37 OTUs were detected from a total of 100 clones. According to analysis results (see Table 1), the 52% of the microbial community were able to hydrolyze the cellulose effectively such as Enterobacter cloacae, Pedobacter sp. and Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum ( Soares et al., 2012). Several bacteria such as Clostridium, Bacillus, Enterobacter and Pseudomonas produce cellulases such as carboxymethyl cellulase (CMCase) ( Chen et al., 2008, Khanna et al., 2011 and Kumar and Das, 2001). It plays an important role to hydrolyze cellobiose to fermentable glucose. Additionally, the purified CMCase is reported to be stable over a pH range of 4–6, and its optimal temperature from 20 to 70 °C (Kumar and Das, 2001). For methane production under such condition, Specific species of Bacteroides and Clostridium that reside in the gut can also liberate CH4 and could easily be part of the small intestinal flora. According to 16s rRNA analysis, Bacteroides genus was detected with 6% abundance. Eubacterium limosum was also appeared in the bacterial community analysis it has ability to utilize H2 and CO2 as an energy source, which was negatively affected bio-hydrogen production in this system. Abounding facultative and obligate anaerobes such as Enterobacter ( Kumar and Das, 2001) and Clostridia ( Chen et al., 2008) have been reported to produce hydrogen efficiently by dark fermentation. Khanna et al., 2011 reported that a 3.1 mol H2 mol−1 glucose was obtained by E. cloacae at pH of 6.5, because higher Acetic/Butyric ratio was achieved. Furthermore, T. thermosaccharolyticum is capable to produce β-Glucosidase that degrade cellobiose to fermentable glucose. The purified β-Glucosidase enzyme is reported to be stable over a pH range of 5.2–7.6, had a 1 h half-life at 68 °C, and its optimal activity is at pH 6.4 and 70 °C (Pei et al., 2012). Bacteroides helcogenes was also detected with 6% abundance. B. helcogenes produces many extracellular enzymes which assist in the breakdown of many polysaccharides such as cellulose. The phylogenetic tree in Fig. 1 illustrates that thirty-seven OTUs were affiliated with the twelve strains of E. cloacae, Tannerella forsythia, Erysipelothrix rhusiopathiae, B. helcogenes, E. limosum, Pedobacter heparinus, Pedobacter saltans, Clostridium beijerinckii, Acidaminococcus fermentans, Aeromonas salmonicida, Enterobacter asburiae and T. thermosaccharolyticum. While the six OTUs form a cluster with 74% bootstrap value with the two known species of Thermoanaerobacterium and Clostridium for cellulosic hydrogen fermentation.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์ 16S rRNA mesophilic ผสมวัฒนธรรมผลการ cloning แสดงทั้งหมด 37 OTUs พบมีทั้งหมด 100 โคลน ตามผลการวิเคราะห์ (ดูตารางที่ 1), 52% ของชุมชนจุลินทรีย์ได้มีการ hydrolyze เซลลูโลสได้อย่างมีประสิทธิภาพเช่น Enterobacter cloacae, Pedobacter sp. และ Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum (Soares et al. 2012) แบคทีเรียหลายเช่น Clostridium บาซิลลัส Enterobacter และ Pseudomonas ผลิต cellulases เช่น cellulase carboxymethyl (CMCase) (Chen et al. 2008 คันนา et al. 2011 และ Kumar และ Das, 2001) มันมีบทบาทสำคัญในการ hydrolyze cellobiose fermentable กลูโคสในเลือด นอกจากนี้ มีรายงาน CMCase บริสุทธิ์จะมีเสถียรภาพมากกว่าช่วง pH 4-6 และอุณหภูมิที่เหมาะสมจาก 20 to 70 ° C (Kumar และ Das, 2001) สำหรับการผลิตมีเทนภายใต้เงื่อนไขดังกล่าว Bacteroides และ Clostridium เฉพาะชนิดที่อาศัยอยู่ในลำไส้ยังสามารถปลดปล่อย CH4 และอาจเป็นส่วนหนึ่งของในลำไส้เล็กได้ง่าย ตาม 16s rRNA วิเคราะห์ Bacteroides สกุลพบกับ 6% ความอุดมสมบูรณ์ Eubacterium limosum ก็ยังปรากฏอยู่ในการวิเคราะห์ชุมชนแบคทีเรียที่มีความสามารถในการใช้ CO2 และ H2 เป็นแหล่งพลังงาน ซึ่งได้รับผลกระทบในเชิงลบไบไฮโดรเจนการผลิตในระบบนี้ ความอุดมสมบูรณ์ obligate และ facultative anaerobes เช่น Enterobacter (Kumar และ Das, 2001) และ Clostridia (Chen et al. 2008) มีการรายงานในการผลิตไฮโดรเจนได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยหมักเข้ม คันนา et al. 2011 รายงานว่า ได้รับการ 3.1 โมล H2 mol−1 กลูโคส โดย E. cloacae ที่ค่า pH 6.5 เนื่องจากอัตราส่วนของอะซิติก/แกมสูงสำเร็จ นอกจากนี้ T. thermosaccharolyticum มีความสามารถในการผลิตβ-Glucosidase ที่ cellobiose fermentable กลูโคสในเลือดลดลง มีรายงานเอนไซม์β-Glucosidase ที่บริสุทธิ์จะมีเสถียรภาพมากกว่าค่า pH ช่วง 5.2 – 7.6 มีครึ่งชีวิต 1 ชม.ที่ 68 ° C และกิจกรรมที่เหมาะสมที่สุดที่ pH 6.4 และ 70 ° C (Pei et al. 2012) นอกจากนี้ยังตรวจพบ Bacteroides helcogenes มี 6% อุดมสมบูรณ์ B. helcogenes ผลิตเอนไซม์สารจำนวนมากซึ่งช่วยในการสลายของสารมากเช่นเซลลูโลส ต้นไม้ผลในรูปที่ 1 แสดงให้เห็นว่าสามสิบเจ็ด OTUs ถูกสังกัดสิบสองสายพันธุ์ของ E. cloacae, Tannerella forsythia, Erysipelothrix rhusiopathiae, B. helcogenes, E. limosum, Pedobacter heparinus, Pedobacter saltans, Clostridium beijerinckii, Acidaminococcus fermentans, Aeromonas salmonicida, Enterobacter asburiae และ T. thermosaccharolyticum ในขณะที่ OTUs หกแบบคลัสเตอร์สองรู้จักชนิด Thermoanaerobacterium และ Clostridium มูลค่าเริ่มต้น 74% สำหรับไฮโดรไลต์หมัก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วิเคราะห์ 16S rRNA ของวัฒนธรรมผสม mesophilic ผลโคลนแสดงให้เห็นว่าทั้งหมด 37 Otus ถูกตรวจพบจากทั้งหมด 100 โคลน ตามผลการวิเคราะห์ (ดูตารางที่ 1), 52% ของกลุ่มจุลินทรีย์ก็สามารถที่จะย่อยสลายเซลลูโลสได้อย่างมีประสิทธิภาพเช่น Enterobacter cloacae, Pedobacter SP และ Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum (Soares et al., 2012) หลายแบคทีเรียเช่นเชื้อ Clostridium, Bacillus, Enterobacter และ Pseudomonas ผลิตเซลลูเช่นคาร์บอกซีเซลลูเลส (CMCase) (Chen et al., 2008 คันนา et al., ปี 2011 และมาร์และดาส, 2001) มันมีบทบาทที่สำคัญในการย่อยสลาย cellobiose การย่อยน้ำตาลกลูโคส นอกจากนี้ CMCase บริสุทธิ์เป็นรายงานที่มีเสถียรภาพในช่วงที่ค่า pH 4-6, และอุณหภูมิที่เหมาะสมของ 20-70 ° C (มาร์และดาส, 2001) สำหรับการผลิตก๊าซมีเทนภายใต้เงื่อนไขดังกล่าวเฉพาะสายพันธุ์ของเชื้อ Clostridium Bacteroides และที่อยู่ในลำไส้ยังสามารถปลดปล่อย CH4 และง่ายดายอาจจะเป็นส่วนหนึ่งของธรรมชาติในลำไส้ขนาดเล็ก ตามการวิเคราะห์ 16s rRNA, Bacteroides สกุลพบกับ 6% ความอุดมสมบูรณ์ Eubacterium limosum ยังได้ปรากฏตัวขึ้นในการวิเคราะห์ชุมชนแบคทีเรียก็มีความสามารถที่จะใช้ H2 และ CO2 เป็นแหล่งพลังงานซึ่งได้รับผลกระทบในเชิงลบผลิตไบโอไฮโดรเจนในระบบนี้ ที่อุดมไปด้วยตามอำเภอใจและบังคับ anaerobes เช่น Enterobacter (มาร์และดาส, 2001) และ Clostridia (Chen et al., 2008) ได้รับรายงานการผลิตไฮโดรเจนได้อย่างมีประสิทธิภาพโดยการหมักมืด คันนา et al., 2011 รายงานว่า 3.1 mol H2 mol-1 กลูโคสได้มาจากอี cloacae ที่ pH 6.5 เนื่องจากอัตราการใช้อะซิติก / Butyric สูงก็ประสบความสำเร็จ นอกจากนี้ที thermosaccharolyticum มีความสามารถในการผลิตβ-glucosidase ที่ลด cellobiose การย่อยน้ำตาลกลูโคส บริสุทธิ์เอนไซม์β-glucosidase เป็นรายงานที่มีเสถียรภาพในช่วงที่ค่า pH 5.2-7.6 มีเวลา 1 ชั่วโมงครึ่งชีวิตที่ 68 ° C และกิจกรรมที่เหมาะสมคือที่ pH 6.4 และ 70 ° C (เป่ย et al., 2012) Bacteroides helcogenes ยังพบกับ 6% ความอุดมสมบูรณ์ บี helcogenes ผลิตเอนไซม์หลายอย่างที่ช่วยในการสลายของ polysaccharides หลายอย่างเช่นเซลลูโลส phylogenetic ต้นไม้ในรูป 1 แสดงให้เห็นว่าสามสิบเจ็ด Otus ถูกร่วมกับสิบสองสายพันธุ์ของอี cloacae, Tannerella Forsythia, Erysipelothrix rhusiopathiae บี helcogenes อี limosum, Pedobacter heparinus, saltans Pedobacter, Clostridium beijerinckii, fermentans Acidaminococcus, Aeromonas salmonicida, Enterobacter asburiae และ T. thermosaccharolyticum ในขณะที่หก Otus รูปแบบคลัสเตอร์ที่มีมูลค่าเงินทุน 74% กับทั้งสองสายพันธุ์ที่รู้จักกันดีของ Thermoanaerobacterium และ Clostridium สำหรับการหมักไฮโดรเจนเซลลูโลส

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เบส 16S rRNA จุลินทรีย์ผสมและมีการวิเคราะห์การโคลนพบว่าทั้งหมดของ 37 ในถูกตรวจพบจากทั้งหมด 100 โคลน จากผลวิเคราะห์ ( ดูตารางที่ 1 ) , 52% ของชุมชนจุลินทรีย์สามารถย่อยสลายเซลลูโลสได้อย่างมีประสิทธิภาพ เช่น เชื้อ Enterobacter sp . , และ pedobacter thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum ( Soares et al . , 2012 ) หลายประการ เช่น Clostridium แบคทีเรีย Bacillus , Enterobacter , Pseudomonas และผลิตได้ เช่น คาร์บอกซีเมทธิล cellulase ( CMCase ) ( Chen et al . , 2008 , Khanna et al . , 2011 และคูมาร์กับดาส , 2001 ) มันมีบทบาทสำคัญสลายกลูโคสที่กรัม . นอกจากนี้ เอนไซม์บริสุทธิ์รายงานให้มีเสถียรภาพ pH ช่วง 4 – 6 และที่อุณหภูมิ 20 ° C ( จาก 70 และคูดาส , 2001 ) สำหรับการผลิตก๊าซมีเทนภายใต้เงื่อนไขดังกล่าว เฉพาะชนิดและ bacteroides Clostridium ที่อาศัยอยู่ในลำไส้ยังสามารถปลดปล่อยร่าง และอาจเป็นส่วนหนึ่งของฟลอร่าลำไส้ขนาดเล็ก 16S rRNA จากการวิเคราะห์พบ bacteroides สกุล 6 % ที่อุดมสมบูรณ์ eubacterium limosum ยังปรากฏในการวิเคราะห์ชุมชนแบคทีเรียมีความสามารถในการใช้ H2 และคาร์บอนไดออกไซด์เป็นแหล่งพลังงาน ซึ่งมีผลต่อการผลิตก๊าซไฮโดรเจนทางชีวภาพในระบบนี้ อยหรือหลักวิชาและอุดมไปด้วยเช่น Enterobacter ( คู และดาส , 2001 ) และ Clostridia ( Chen et al . , 2008 ) มีการรายงานเพื่อผลิตไฮโดรเจนอย่างมีประสิทธิภาพ โดยการหมักแบบมืด . กานน et al . , 2011 รายงานว่า H2 mol − 1 3.1 โมลกลูโคสได้โดยวิธีที่พีเอช 6.5 เพราะสูงกว่ากรดอะซิติก / ) โดยความ นอกจากนี้ ที่ ต. thermosaccharolyticum มีความสามารถในการผลิตบีตาในที่ที่ย่อยสลายกลูโคส กรัม . บริสุทธิ์เอนไซม์บีตา - กลูโคซิเดส รายงาน ให้มีเสถียรภาพในช่วง pH 5.2 – 7.6 มีครึ่งชีวิต 1 H ที่ 68 ° C และกิจกรรมที่เหมาะสมของมันคือที่ pH 6.4 และ 70 ° C ( เพ่ย et al . , 2012 ) bacteroides helcogenes ยังตรวจพบมี 6% ที่อุดมสมบูรณ์ B . helcogenes ผลิตหลายยัดเยียดซึ่งช่วยในการสลายของโพลีแซคคาไรด์มากเช่นเซลลูโลส ต้นไม้ในรูปที่ 1 แสดงให้เห็นถึงวิวัฒนาการที่ 37 ในสังกัดกับสิบสองสายพันธุ์ของเชื้อ E . tannerella forsythia , erysipelothrix rhusiopathiae พ. helcogenes e . limosum pedobacter heparinus pedobacter saltans , , , beijerinckii acidaminococcus fermentans เชื้อ Clostridium , , salmonicida , Enterobacter asburiae และ ต. thermosaccharolyticum . ในขณะที่หกในรูปแบบคลัสเตอร์กับ 74% บูค่า ด้วยสองชนิดที่รู้จักของ thermoanaerobacterium และ Clostridium สำหรับการหมักไฮโดรเจนเซลลูโลส .