2.5. Microarrays data analysisSigna

2.5. Microarrays data analysis
Signal processing was performed using vector oligonucleotide data to correct the relative amount of DNA present in each spot. At this step, low nucleotide signals (lower than 3 times the background level) were excluded from the analysis. After correction, signals were normalized by dividing each gene expression by the median value of the array. Data were subsequently analysed using statistical GeneANOVA software (Didier et al., 2002) and gene expression was significantly different when Pb0.01.
2.6. Data mining
Rainbow trout sequences originating from INRA Agenae (Govoroun et al.,2006) and USDA (Rexroad et al., 2003) and EST sequencing programs were used to generate publicly available contigs (http://public-contigbrowser.sigenae. org:9090/index.html). The 4th version (om.4) was used for BlastX (Basic Local Alignment Search Tool) comparison (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/). The score of each alignment was retrieved after performing a Blast X comparison.
Biological signification of data (biochemical pathways, cellular processes…) was illustrated using Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) as bioinformatics resource (http://www.genome.jp/kegg/).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.5 วิเคราะห์ข้อมูล Microarraysการประมวลผลสัญญาณที่ดำเนินการโดยใช้เวกเตอร์ oligonucleotide ข้อมูลเพื่อแก้ไขยอดเงินที่สัมพันธ์กันของดีเอ็นเอที่อยู่ในแต่ละจุด ในขั้นตอนนี้ สัญญาณนิวคลีโอไทด์ที่ต่ำ (ต่ำกว่า 3 ครั้งระดับพื้นหลัง) ถูกแยกออกจากการวิเคราะห์ หลังจากการแก้ไข สัญญาณได้ตามปกติ โดยแบ่งแต่ละยีนโดยค่ามัธยฐานของอาร์เรย์ ข้อมูลมาที่ analysed โดยใช้ซอฟต์แวร์ GeneANOVA สถิติ (Didier et al., 2002) และยีนแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญเมื่อ Pb0.012.6 การทำเหมืองเรนโบว์เทราต์ลำดับมาจาก Agenae INRA (Govoroun และ al., 2006) และจาก (Rexroad et al., 2003) และ EST ลำดับโปรแกรมที่ใช้สร้างเผย contigs (http://public-contigbrowser.sigenae. org:9090/index.html) รุ่น 4 (om.4) ใช้สำหรับเปรียบเทียบ BlastX (พื้นฐานเฉพาะตำแหน่งค้นหาเครื่องมือ) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/) คะแนนของแต่ละตำแหน่งถูกดึงหลังจากที่ทำการเปรียบเทียบ X ระเบิดSignification ชีวภาพข้อมูล (หลักชีวเคมี กระบวนการโทรศัพท์มือถือ...) ได้อธิบายการใช้สารานุกรมยีนเกียวโตและ Genomes (KEGG) เป็นทรัพยากร bioinformatics (http://www.genome.jp/kegg/)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.5 microarrays การวิเคราะห์ข้อมูล
การประมวลผลสัญญาณที่ได้ดำเนินการโดยใช้ข้อมูล oligonucleotide เวกเตอร์ในการแก้ไขจำนวนเงินที่ญาติในปัจจุบันดีเอ็นเอในแต่ละจุด ในขั้นตอนนี้สัญญาณเบื่อหน่ายต่ำ (ต่ำกว่า 3 ครั้งระดับพื้นหลัง) ได้รับการยกเว้นจากการวิเคราะห์ หลังจากการแก้ไขสัญญาณถูกปกติโดยแบ่งการแสดงออกของยีนแต่ละโดยค่าเฉลี่ยของอาร์เรย์ วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ซอฟต์แวร์ภายหลัง GeneANOVA ทางสถิติ (Didier et al., 2002) และการแสดงออกของยีนที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญเมื่อ Pb0.01.
2.6 การทำเหมืองข้อมูล
(. Govoroun et al, 2006) (. Rexroad et al, 2003) เรนโบว์เทราท์ลำดับที่มาจาก INRA Agenae และ USDA และ EST โปรแกรมลำดับถูกนำมาใช้ในการสร้าง contigs ที่เปิดเผยต่อสาธารณชน (http:. //public-contigbrowser.sigenae org : 9090 / index.html) รุ่นที่ 4 (om.4) ที่ใช้สำหรับ BlastX (Basic ท้องถิ่นจัดเครื่องมือค้นหา) เปรียบเทียบ (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/) คะแนนของการจัดตำแหน่งแต่ละถูกดึงหลังจากดำเนินการเปรียบเทียบระเบิด X.
ความหมายทางชีวภาพของข้อมูล (ชีวเคมีกระบวนการโทรศัพท์มือถือ ... ) เป็นตัวอย่างการใช้เกียวโตสารานุกรมของยีนและจีโนม (KEGG) เป็นทรัพยากรชีวสารสนเทศ (http: //www.genome JP / KEGG /)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.5 ิการวิเคราะห์ข้อมูล
การประมวลผลสัญญาณได้ดําเนินการโดยใช้เวกเตอร์ ซึ่งข้อมูลที่ถูกต้องปริมาณสัมพัทธ์ของดีเอ็นเอที่อยู่ในแต่ละจุด ในขั้นตอนนี้ สัญญาณเบสต่ำ ( น้อยกว่า 3 ครั้ง ระดับพื้นหลัง ) ได้รับการยกเว้นจากการวิเคราะห์ หลังจากแก้ไขสัญญาณได้ปกติ โดยแบ่งแต่ละยีน โดยมีค่ามัธยฐานของเรย์วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ซอฟต์แวร์ทางสถิติ ( ดิดิเยร์ geneanova et al . , 2002 ) และการแสดงออกของยีนที่แตกต่างกันอย่างมากเมื่อ pb0.01 .
2.6 การทำเหมืองข้อมูล
ปลาเรนโบว์เทราท์ ลำดับที่มาจากทีมนักวิจัยของ agenae ( govoroun et al . , 2006 ) และ USDA ( rexroad et al . , 2003 ) และโปรแกรมที่ใช้ในการสร้าง และการเปิดเผยต่อสาธารณชนสูง ( http://public-contigbrowser.sigenae . องค์กร :9090 / index . html ) รุ่นที่ 4 ( โอม ที่ 4 ) ใช้ blastx ( เครื่องมือค้นหาการปรับพื้นฐานท้องถิ่น ) การเปรียบเทียบ ( http : / / www.ncbi . nlm . NIH . gov / ระเบิด / ) คะแนนของแต่ละแนวได้คืนเมื่อการแสดง x ระเบิด เปรียบเทียบความหมายของข้อมูลทางชีวภาพ
( แนวทางกระบวนการ . . . . . . . มือถือ ) แสดงการใช้ Kyoto Encyclopedia ของยีนและจีโนม ( KEGG เป็นต้น ) เป็นทรัพยากรรสน ( http : / / www.genome . JP / KEGG เป็นต้น / )