Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5

Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344 is an alkaliphilic bacterium that can use cyanide as nitrogen source for growth, becoming a suitable candidate to be applied in biological treatment of cyanide-containing wastewaters. The assessment of the whole genome sequence of the strain CECT5344 has allowed the generation of DNA microarrays to analyze the response to different nitrogen sources. The mRNA of P. pseudoalcaligenes CECT5344 cells grown under nitrogen limiting conditions showed considerable changes when compared against the transcripts from cells grown with ammonium; up-regulated genes were, among others, the glnK gene encoding the nitrogen regulatory protein PII, the two-component ntrBC system involved in global nitrogen regulation, and the ammonium transporter-encoding amtB gene. The protein coding transcripts of P. pseudoalcaligenes CECT5344 cells grown with sodium cyanide or an industrial jewelry wastewater that contains high concentration of cyanide and metals like iron, copper and zinc, were also compared against the transcripts of cells grown with ammonium as nitrogen source. This analysis revealed the induction by cyanide and the cyanide-rich wastewater of four nitrilase-encoding genes, including the nitC gene that is essential for cyanide assimilation, the cyanase cynS gene involved in cyanate assimilation, the cioAB genes required for the cyanide-insensitive respiration, and the ahpC gene coding for an alkyl-hydroperoxide reductase that could be related with iron homeostasis and oxidative stress. The nitC and cynS genes were also induced in cells grown under nitrogen starvation conditions.

In cells grown with the jewelry wastewater, a malate quinone:oxidoreductase mqoB gene and several genes coding for metal extrusion systems were specifically induced.

Keywords

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344 เป็นแบคทีเรีย alkaliphilic ที่สามารถใช้ไซยาไนด์เป็นปุ๋ยไนโตรเจนสำหรับการเจริญเติบโตกลายเป็นผู้สมัครที่เหมาะสมที่จะนำมาใช้ในการบำบัดน้ำเสียที่มีไซยาไนด์ การประเมินผลของลำดับจีโนมทั้งหมดของ CECT5344 ความเครียดได้รับอนุญาตให้สร้างดีเอ็นเอไมโครอะเรย์ในการวิเคราะห์การตอบสนองต่อแหล่งไนโตรเจนที่แตกต่างกัน mRNA พี pseudoalcaligenes เซลล์ CECT5344 เติบโตขึ้นภายใต้ไนโตรเจน จำกัด เงื่อนไขแสดงให้เห็นการเปลี่ยนแปลงอย่างมากเมื่อเทียบกับการถอดเสียงจากเซลล์เติบโตขึ้นโดยมีแอมโมเนียม; ขึ้นควบคุมยีนเป็นหมู่คนยีน glnK เข้ารหัสไนโตรเจนกฎระเบียบโปรตีน PII ระบบ ntrBC สองส่วนมีส่วนร่วมในการควบคุมไนโตรเจนทั่วโลกและแอมโมเนียมขนย้ายเข้ารหัส amtB ยีน โปรตีนเข้ารหัสเทปพี pseudoalcaligenes CECT5344 เซลล์เติบโตขึ้นโดยมีโซเดียมไซยาไนด์หรือน้ำเสียอุตสาหกรรมเครื่องประดับที่มีความเข้มข้นสูงของไซยาไนด์และโลหะเช่นเหล็กทองแดงและสังกะสียังถูกเมื่อเทียบกับใบรับรองผลการเรียนของเซลล์ที่ปลูกด้วยแอมโมเนียไนโตรเจนเป็นแหล่งที่มา การวิเคราะห์นี้จะเผยให้เห็นการเหนี่ยวนำโดยไซยาไนด์และน้ำเสียไซยาไนด์ที่อุดมไปด้วยสี่ nitrilase เข้ารหัสยีนรวมทั้งยีน NITC ว่าเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับไซยาไนด์ดูดซึมยีน cyanase cynS มีส่วนร่วมในการดูดซึมไซยาเนตยีน cioAB ที่จำเป็นสำหรับการหายใจไซยาไนด์ตาย และการแสดงออกของยีน ahpC เข้ารหัสสำหรับ reductase คิล-ไฮโดรที่อาจจะเกี่ยวข้องกับการรักษาสมดุลของธาตุเหล็กและความเครียดออกซิเดชัน NITC และ cynS ยีนยังถูกเหนี่ยวนำให้เกิดในเซลล์ที่ปลูกภายใต้สภาวะความอดอยากไนโตรเจน. ในเซลล์ที่ปลูกที่มีน้ำเสียเครื่องประดับมาเลต quinone:. ยีน oxidoreductase mqoB และอีกหลายรหัสพันธุกรรมสำหรับระบบการอัดขึ้นรูปโลหะถูกเหนี่ยวนำให้เกิดโดยเฉพาะคำหลัก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ของใน pseudoalcaligenes cect5344 เป็นแบคทีเรียที่สามารถใช้ไซยาไนด์เป็นแหล่งไนโตรเจนสำหรับการเจริญเติบโตเป็นผู้เหมาะสมที่จะใช้ในการรักษาทางชีวภาพของไซยาไนด์ที่มีกิจกรรม . การประเมินทั้งจีโนมลำดับของสายพันธุ์ cect5344 ได้รับอนุญาติสร้างดีเอ็นเอวิเคราะห์การตอบสนองแหล่งไนโตรเจนที่แตกต่างกัน ของ P . pseudoalcaligenes cect5344 เซลล์ที่ปลูกภายใต้สภาพการเปลี่ยนแปลงไนโตรเจน จำกัด พบมากเมื่อเปรียบเทียบกับยีนจากเซลล์ที่ปลูกด้วยน้ำ ; กระตุ้นยีนในหมู่คนอื่น ๆ glnk ยีนไนโตรเจนโปรตีนที่ใช้เข้ารหัส , แบบ ntrbc ระบบเกี่ยวข้องกับการควบคุมปริมาณทั่วโลกและแอมโมเนียมขนย้ายยีน amtb การเข้ารหัส โปรตีนนะครับ หลักฐานของหน้า pseudoalcaligenes cect5344 เซลล์เติบโตกับโซเดียมไซยาไนด์หรือเครื่องประดับอุตสาหกรรม น้ำเสียที่มีความเข้มข้นสูงของไซยาไนด์ และโลหะ เช่น เหล็ก ทองแดง และสังกะสี มาเปรียบเทียบกับหลักฐานของเซลล์ที่ปลูกด้วยน้ำ เป็นแหล่งไนโตรเจน การวิเคราะห์นี้แสดงการไซยาไนด์และไซยาไนด์ที่อุดมไปด้วยน้ำเสียสี่ nitrilase การเข้ารหัสยีน ได้แก่ กทสช. ยีนที่จําเป็นสําหรับการไซยาไนด์ , cyanase cyns ยีนที่เกี่ยวข้องในการ cioab ไซยาเนต , ยีนที่จำเป็นสำหรับไซยาไนด์ตายด้านการหายใจ และ ahpc ยีนรหัสสำหรับอัล hydroperoxide และอาจเกี่ยวข้องกับการรักษาสมดุลของร่างกายเหล็กและความเครียดออกซิเดชัน และยีนที่กทสช. cyns ยังเกิดในเซลล์ที่ปลูกภายใต้สภาพการอดอาหารไนโตรเจนในเซลล์ที่ปลูกกับเครื่องประดับน้ำเสีย , malate ควิโนน : อ ซิโดรีดักเทส mqob ยีนหลายยีนและการเข้ารหัสสำหรับระบบรีดโลหะ โดยเฉพาะเกิดคำสำคัญ