ResultsSequencing and de novo trans

Results
Sequencing and de novo transcriptome assembly
The fruits of black pepper (P. nigrum L. cv. Reyin No. 1) at different developmental stages were
collected at 1 month to 10 months post anthesis. The RNA of these fruits was isolated. RNAs of
equal quality were mixed for Illumina sequencing. A total of 56,281,710 raw reads were
obtained. We filtered the sequence data for clean reads, resulting in 52,098,738 clean reads. All
clean reads were de novo assembled into contigs by using the Trinity method [14]. The clean
read assembly generated 179,075 contigs when all isoforms were included. These contigs represent
a total of 44,061 unigenes that were considered for downstream analysis with an N50
length of 1,757 nt. The length of the unigenes ranged from 300 nt to 15,000 nt, with a mean
length of 1,354 nt and 46.60% GC content (Table 1). A total of 23,085 (52.39%) unigenes longer
than 1 kb and 9,769 (22.17%) unigenes longer than 2 kb were obtained. The length distributions
of the unigenes are shown in Table 1; the results revealed that more than 30,000 unigenes
(75.77%) were longer than 500 nt (Table 1). The database was deposited in the NCBI Sequence
Read Archive (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/) under accession number SRS856941.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ผลลำดับและโนโวชุมนุมยีนผลไม้พริกไทยดำ(พี nigrum L. พันธุ์. Reyin ครั้งที่ 1) ในขั้นตอนการพัฒนาที่แตกต่างกันเก็บที่1 เดือนถึง 10 เดือนโพสต์ดอกบาน อาร์เอ็นเอของผลไม้เหล่านี้ถูกแยกออก RNAs ของที่มีคุณภาพเท่าเทียมกันถูกผสมสำหรับลำดับIllumina รวมของ 56,281,710 ดิบอ่านถูกได้ เรากรองข้อมูลลำดับสำหรับทำความสะอาดอ่านผลในการทำความสะอาด 52098738 อ่าน ทั้งหมดทำความสะอาดได้อ่านโนโวเดประกอบเป็น contigs โดยใช้วิธีการทรินิตี้ [14] สะอาดประกอบการอ่านสร้าง 179,075 contigs เมื่อไอโซฟอร์มทั้งหมดถูกรวม contigs เหล่านี้เป็นตัวแทนทั้งหมด44,061 unigenes ที่ได้รับการพิจารณาสำหรับการวิเคราะห์ต่อเนื่องกับ N50 ความยาวของเอ็นที 1757 ความยาวของ unigenes ที่อยู่ระหว่าง 300 ถึง 15,000 เอ็นทีเอ็นทีมีค่าเฉลี่ยความยาวของเอ็นที 1354 และ 46.60% เนื้อหา GC (ตารางที่ 1) รวม 23,085 (52.39%) unigenes นานกว่า1 กิโลและ 9769 (22.17%) unigenes นานกว่า 2 กิโลได้รับ การกระจายความยาวของ unigenes จะแสดงในตารางที่ 1; ผลการศึกษาพบว่ามากกว่า 30,000 unigenes (75.77%) เป็นเวลานานกว่า 500 เอ็นที (ตารางที่ 1) ฐานข้อมูลที่ถูกฝากไว้ในลำดับ NCBI อ่าน Archive (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/) ภายใต้หมายเลขภาคยานุวัติ SRS856941

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

I like playing water in a family vacation I'll take you to the waterfalls.I like playing water in a family vacation I'll take you to the waterfalls.I like playing water in a family vacation I'll take you to the waterfalls.I like playing water in a family vacation I'll take you to the waterfalls.