An EST (GenBank accession no. DR792

An EST (GenBank accession no. DR792958) that exhibited significant expression differences during fiber initiation stages in lintless-fuzzless XinWX and linted-fuzzless XinFLM isogenic lines in a 29K cotton genome array hybridization was used to search the Gossypium EST database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) and in a BLAST search. Identified EST sequences were spliced with CAP3 to form contigs, which were subsequently used as probes in BLASTn searches until the contigs were no longer extended. The open reading frame (ORF) of the longest contig was named as GhAOC in a BLASTp search annotated by the National Center for Biotechnology Information (NCBI),USA. In order to confirm the full-length cDNA, primers to amplify the complete ORF were designed using Primer Premier 5.0 (Premier, Canada). Genomic and cDNA GhAOC sequences were isolated from TM-1 genomic DNA and 10 days post anthesis (DPA) fiber cDNA, respectively. The primers used in this study are shown in Table 1. Oligo synthesis and DNA sequencing
were performed by Nanjing Genscript Bio-Technology Co. Ltd., China.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การ EST (GenBank ทะเบียนไม่ DR792958) ที่จัดแสดงความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญนิพจน์ในระหว่างขั้นตอนเริ่มต้นใย XinWX lintless fuzzless และ linted fuzzless XinFLM isogenic บรรทัดที่ 29 K ฝ้ายจีโนมเรย์ hybridization ถูกใช้เพื่อค้นหาฐานข้อมูล EST ถ่าย (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) และในการระเบิดค้นหา ระบุ EST ลำดับถูก spliced กับ CAP3 กับแบบฟอร์ม contigs ซึ่งต่อมาใช้เป็นคลิปปากตะเข้ BLASTn ค้นหาจนกว่า contigs จะได้ไม่ขยาย เปิดอ่านเฟรม (ORF) ของ contig สูงถูกตั้งชื่อเป็น GhAOC ใน BLASTp ค้นหาใส่คำอธิบายประกอบ โดยศูนย์แห่งชาติสำหรับเทคโนโลยีชีวภาพข้อมูล (NCBI), สหรัฐอเมริกา เพื่อยืนยัน cDNA ปราศจาก ไพรเมอร์ขยาย ORF สมบูรณ์ถูกออกแบบใช้พื้น 5.0 พรีเมียร์ (Premier แคนาดา) Genomic และ cDNA GhAOC ลำดับถูกแยกต่างหากจาก TM 1 genomic DNA และ 10 วันลง anthesis (DPA) ไฟเบอร์ cDNA ตามลำดับ ไพรเมอร์ที่ใช้ในการศึกษานี้ได้แสดงในตารางที่ 1 Oligo สังเคราะห์และจัดลำดับของดีเอ็นเอได้ดำเนินการ โดยจิง Genscript ไบโอเทคโนโลยี จำกัด จีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

EST (. GenBank ภาคยานุวัติไม่มี DR792958) ที่แสดงให้เห็นความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญการแสดงออกในระหว่างขั้นตอนการเริ่มต้นในเส้นใย XinWX lintless-fuzzless และ linted-fuzzless XinFLM สายพันธุ์ในการผสมข้ามพันธุ์อาเรย์จีโนมผ้าฝ้าย 29K ถูกใช้ในการค้นหาฐานข้อมูล EST Gossypium (http: // www.ncbi.nlm.nih.gov/) และในการค้นหาระเบิด ระบุลำดับ EST ถูกแต่งงานกับ CAP3 ในรูปแบบ contigs ซึ่งต่อมาได้ถูกนำมาใช้เป็น probe ในการค้นหา BLASTn จนกว่า contigs กำลังขยายไม่ เปิดอ่านกรอบ (ORF) ที่ยาวที่สุดของ contig ได้ชื่อว่าเป็น GhAOC ในการค้นหา BLASTp ข้อเขียนแห่งชาติศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ (NCBI) สหรัฐอเมริกา เพื่อยืนยัน cDNA ยาวเต็มรูปแบบไพรเมอร์เพื่อขยายสมบูรณ์ ORF ได้รับการออกแบบโดยใช้ไพรเมอร์พรีเมียร์ 5.0 (พรีเมียร์แคนาดา) จีโนมและลำดับยีน GhAOC ที่แยกได้จาก TM-1 ดีเอ็นเอจีโนมและ 10 วันหลังดอกบาน (DPA) cDNA เส้นใยตามลำดับ ไพรเมอร์ที่ใช้ในการศึกษาครั้งนี้จะแสดงในตารางที่ 1 การสังเคราะห์ Oligo ลำดับดีเอ็นเอและ
ดำเนินการโดยหนานจิงเจนสคริปต์ไบโอเทคโนโลยี จำกัด , จีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็น EST ( ขนาดเข้าไม่ dr792958 ) ซึ่งมีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญระหว่างขั้นตอนในการ แสดงออก ไฟเบอร์ และ lintless fuzzless xinwx linted fuzzless xinflm isogenic สาย ใน 29 ฝ้ายจีโนมเรย์ ( ถูกใช้เพื่อค้นหา gossypium EST ฐานข้อมูล ( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ) และระเบิดที่ค้นหา ได้แต่งงานกับ cap3 ระบุ EST ลำดับสูงในรูปแบบ ,ซึ่งต่อมาใช้เป็นโพรบในการค้นหา blastn จนสูงก็ไม่ขยาย กรอบเปิดอ่าน ( ORF ) ของ contig ยาวชื่อ ghaoc ใน blastp ค้นหาบันทึกย่อโดยศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ ( ncbi ) ของสหรัฐอเมริกา เพื่อยืนยันวิธี full-length , ไพรเมอร์เพื่อขยาย ORF ที่สมบูรณ์ได้รับการออกแบบโดยใช้ไพรเมอร์ พรีเมียร์ ( Premier 5.0 ,แคนาดา ) และ ghaoc ลำดับจีโนมสายพันธุ์ที่แยกได้จาก tm-1 genomic DNA และ 10 วัน หลังดอกบาน ( DPA ) เส้นใยดีเอ็นเอ ตามลำดับ ไพรเมอร์ที่ใช้ในการศึกษานี้ แสดงในตารางที่ 1 โอลิโก การสังเคราะห์ดีเอ็นเอ
ได้จิง genscript ไบโอเทคโนโลยี จำกัด , จีน