การวิเคราะห์ข้อมูลทางพันธุกรรมจากการจัดเรียงลำดับ
นิวคลีโอไทด์ เป็นประโยชน์ต่อการทำงานทางชีวโมเลกุลมาก
ทางด้านการวิเคราะห์หายีน โครงสร้างของยีน เช่น ส่วนที่ทำหน้าที่
regulatory elements ส่วนที่จะ
ทำการแปลรcoding sequenceซึ่งสามารถ
ประยุกต์ใช้ได้ในกระบวนการโคลนเพื่อการสร้างโปรตีนลูกผสม
ใหม่ๆ ขึ้น หรือแม้กระทั่งการจัดจำแนกและชี้เฉพาะสปีชีส์ของ
สิ่งมีชีวิตโดยเทียบความคล้ายคลึงจากลำดับเบส และสร้าง
แผนภาพต้นไม้แสดงความสัมพันธ์ของสิ่งมีชีวิตขึ้นมา เป็นต้น